seq1 = pF1KE2051.tfa, 1851 bp
seq2 = pF1KE2051/gi568815588f_45274280.tfa (gi568815588f:45274280_45545684), 271405 bp

>pF1KE2051 1851
>gi568815588f:45274280_45545684 (Chr10)

1-150  (100001-100150)   100% ->
151-349  (108204-108402)   100% ->
350-431  (121576-121657)   100% ->
432-554  (137912-138034)   100% ->
555-661  (149762-149868)   100% ->
662-834  (150681-150853)   100% ->
835-981  (154339-154485)   100% ->
982-1185  (166151-166354)   100% ->
1186-1272  (167065-167151)   100% ->
1273-1451  (168759-168937)   100% ->
1452-1573  (169137-169258)   100% ->
1574-1674  (169449-169549)   100% ->
1675-1851  (171229-171405)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCTCCTACACGGTCACCGTGGCCACTGGCAGCCAGTGGTTCGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCTCCTACACGGTCACCGTGGCCACTGGCAGCCAGTGGTTCGCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACTGACGACTACATCTACCTCAGCCTCGTGGGCTCGGCGGGCTGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACTGACGACTACATCTACCTCAGCCTCGTGGGCTCGGCGGGCTGCAGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAAGCACCTGCTGGACAAGCCCTTCTACAACGACTTCGAGCGTGGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAAGCACCTGCTGGACAAGCCCTTCTACAACGACTTCGAGCGTGGCGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151          GTGGATTCATACGACGTGACTGTGGACGAGGAACTGGGCGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTG...CAGGTGGATTCATACGACGTGACTGTGGACGAGGAACTGGGCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATCCAGCTGGTCAGAATCGAGAAGCGCAAGTACTGGCTGAATGACGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108245 GATCCAGCTGGTCAGAATCGAGAAGCGCAAGTACTGGCTGAATGACGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGTACCTGAAGTACATCACGCTGAAGACGCCCCACGGGGACTACATCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108295 GGTACCTGAAGTACATCACGCTGAAGACGCCCCACGGGGACTACATCGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCCCCTGCTACCGCTGGATCACCGGCGATGTCGAGGTTGTCCTGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108345 TTCCCCTGCTACCGCTGGATCACCGGCGATGTCGAGGTTGTCCTGAGGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGGACGCG         CAAAGTTGGCCCGAGATGACCAAATTCACATTC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 108395 TGGACGCGGTG...CAGCAAAGTTGGCCCGAGATGACCAAATTCACATTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCAAGCAACACCGACGTAAAGAACTGGAAACACGGCAAAAACAATATCG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 121609 TCAAGCAACACCGACGTAAAGAACTGGAAACACGGCAAAAACAATATCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    432         ATGGATGGAGTGGAACCCTGGCTTCCCCTTGAGCATCGATGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121659 TG...CAGATGGATGGAGTGGAACCCTGGCTTCCCCTTGAGCATCGATGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAAATGCCACAAGGATTTACCCCGTGATATCCAGTTTGATAGTGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137954 CAAATGCCACAAGGATTTACCCCGTGATATCCAGTTTGATAGTGAAAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GAGTGGACTTTGTTCTGAATTACTCCAAAGC         GATGGAGAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 138004 GAGTGGACTTTGTTCTGAATTACTCCAAAGCGTA...CAGGATGGAGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGTTCATCAACCGCTTCATGCACATGTTCCAGTCTTCTTGGAATGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149772 CTGTTCATCAACCGCTTCATGCACATGTTCCAGTCTTCTTGGAATGACTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGCCGACTTTGAGAAAATCTTTGTCAAGATCAGCAACACTATTTCTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 149822 CGCCGACTTTGAGAAAATCTTTGTCAAGATCAGCAACACTATTTCTGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    662       AGCGGGTCATGAATCACTGGCAGGAAGACCTGATGTTTGGCTAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149872 ...TAGAGCGGGTCATGAATCACTGGCAGGAAGACCTGATGTTTGGCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CAGTTCCTGAATGGCTGCAACCCTGTGTTGATCCGGCGCTGCACAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150725 CAGTTCCTGAATGGCTGCAACCCTGTGTTGATCCGGCGCTGCACAGAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCCCGAGAAGCTCCCGGTGACCACGGAGATGGTAGAGTGCAGCCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150775 GCCCGAGAAGCTCCCGGTGACCACGGAGATGGTAGAGTGCAGCCTGGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GGCAGCTCAGCTTGGAGCAGGAGGTCCAG         CAAGGGAACATT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 150825 GGCAGCTCAGCTTGGAGCAGGAGGTCCAGGTA...CAGCAAGGGAACATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTCATCGTGGACTTTGAGCTGCTGGATGGCATCGATGCCAACAAAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154351 TTCATCGTGGACTTTGAGCTGCTGGATGGCATCGATGCCAACAAAACAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCCCTGCACACTCCAGTTCCTGGCCGCTCCCATCTGCTTGCTGTATAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154401 CCCCTGCACACTCCAGTTCCTGGCCGCTCCCATCTGCTTGCTGTATAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ACCTGGCCAACAAGATTGTCCCCATTGCCATCCAG         CTCAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 154451 ACCTGGCCAACAAGATTGTCCCCATTGCCATCCAGGTA...CAGCTCAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CAAATCCCGGGAGATGAGAACCCTATTTTCCTCCCTTCGGATGCAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166157 CAAATCCCGGGAGATGAGAACCCTATTTTCCTCCCTTCGGATGCAAAATA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CGACTGGCTTTTGGCCAAAATCTGGGTGCGTTCCAGTGACTTCCACGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166207 CGACTGGCTTTTGGCCAAAATCTGGGTGCGTTCCAGTGACTTCCACGTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ACCAGACCATCACCCACCTTCTGCGAACACATCTGGTGTCTGAGGTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166257 ACCAGACCATCACCCACCTTCTGCGAACACATCTGGTGTCTGAGGTTTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GGCATTGCAATGTACCGCCAGCTGCCTGCTGTGCACCCCATTTTCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 166307 GGCATTGCAATGTACCGCCAGCTGCCTGCTGTGCACCCCATTTTCAAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1186        CTGCTGGTGGCACACGTGAGATTCACCATTGCAATCAACACCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166357 A...CAGCTGCTGGTGGCACACGTGAGATTCACCATTGCAATCAACACCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AGGCCCGTGAGCAGCTCATCTGCGAGTGTGGCCTCTTTGACAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 167108 AGGCCCGTGAGCAGCTCATCTGCGAGTGTGGCCTCTTTGACAAGGTG...

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1273    GCCAACGCCACAGGGGGCGGTGGGCACGTGCAGATGGTGCAGAGGGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168756 CAGGCCAACGCCACAGGGGGCGGTGGGCACGTGCAGATGGTGCAGAGGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CATGAAGGACCTGACCTATGCCTCCCTGTGCTTTCCCGAGGCCATCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168806 CATGAAGGACCTGACCTATGCCTCCCTGTGCTTTCCCGAGGCCATCAAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CCCGGGGCATGGAGAGCAAAGAAGACATCCCCTACTACTTCTACCGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168856 CCCGGGGCATGGAGAGCAAAGAAGACATCCCCTACTACTTCTACCGGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GACGGGCTCCTGGTGTGGGAAGCCATCAGGAC         GTTCACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 168906 GACGGGCTCCTGGTGTGGGAAGCCATCAGGACGTG...CAGGTTCACGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CGAGGTGGTAGACATCTACTACGAGGGCGACCAGGTGGTGGAGGAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169146 CGAGGTGGTAGACATCTACTACGAGGGCGACCAGGTGGTGGAGGAGGACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CGGAGCTGCAGGACTTCGTGAACGATGTCTACGTGTACGGCATGCGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169196 CGGAGCTGCAGGACTTCGTGAACGATGTCTACGTGTACGGCATGCGGGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CGCAAGTCCTCAG         GCTTCCCCAAGTCGGTCAAGAGCCGGGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 169246 CGCAAGTCCTCAGGTA...TAGGCTTCCCCAAGTCGGTCAAGAGCCGGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GCAGCTGTCGGAGTACCTGACCGTGGTGATCTTCACCGCCTCCGCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169477 GCAGCTGTCGGAGTACCTGACCGTGGTGATCTTCACCGCCTCCGCCCAGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 ACGCCGCGGTCAACTTCGGCCAG         CTGTTCCTGGGCATGTAC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 169527 ACGCCGCGGTCAACTTCGGCCAGGTA...CAGCTGTTCCTGGGCATGTAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 CCAGAAGAGCATTTTATCGAGAAGCCTGTGAAGGAAGCCATGGCCCGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171247 CCAGAAGAGCATTTTATCGAGAAGCCTGTGAAGGAAGCCATGGCCCGATT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CCGCAAGAACCTCGAGGCCATTGTCAGCGTGATTGCTGAGCGCAACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171297 CCGCAAGAACCTCGAGGCCATTGTCAGCGTGATTGCTGAGCGCAACAAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AGAAGCAGCTGCCATATTACTACTTGTCCCCAGACCGGATTCCGAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171347 AGAAGCAGCTGCCATATTACTACTTGTCCCCAGACCGGATTCCGAACAGT

   1950     .
   1843 GTGGCCATC
        |||||||||
 171397 GTGGCCATC