seq1 = pF1KE2044.tfa, 1986 bp
seq2 = pF1KE2044/gi568815579r_17959894.tfa (gi568815579r:17959894_18186823), 226930 bp

>pF1KE2044 1986
>gi568815579r:17959894_18186823 (Chr19)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-124  (103333-103392)   100% ->
125-239  (104560-104674)   100% ->
240-409  (105823-105992)   100% ->
410-549  (109169-109308)   100% ->
550-580  (110497-110527)   100% ->
581-700  (110956-111075)   100% ->
701-783  (113225-113307)   100% ->
784-1021  (114475-114712)   100% ->
1022-1189  (117111-117278)   100% ->
1190-1327  (118298-118435)   100% ->
1328-1483  (120127-120282)   100% ->
1484-1618  (122814-122948)   100% ->
1619-1715  (124547-124643)   100% ->
1716-1791  (125627-125702)   100% ->
1792-1986  (126739-126931)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCGCTGGTGACCTGGGTGGTCCCCCTCCTCTTCCTCTTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCCGCTGGTGACCTGGGTGGTCCCCCTCCTCTTCCTCTTCCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCCAGGCAGGGCG         CTGCCTGCAGAACCAGTGAGTGCTGTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCCAGGCAGGGCGGTG...CAGCTGCCTGCAGAACCAGTGAGTGCTGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTCAGGACCCGCCATATCCGGATGCAGACTCAG         GCTCGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 103360 TTCAGGACCCGCCATATCCGGATGCAGACTCAGGTT...CAGGCTCGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TCGGGCCCTAGGGACCTGAGATGCTATCGGATATCCAGTGATCGTTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104568 TCGGGCCCTAGGGACCTGAGATGCTATCGGATATCCAGTGATCGTTACGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTGCTCCTGGCAGTATGAGGGTCCCACAGCTGGGGTCAGCCACTTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104618 GTGCTCCTGGCAGTATGAGGGTCCCACAGCTGGGGTCAGCCACTTCCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGTGTTG         CCTTAGCTCCGGGCGCTGCTGCTACTTCGCCGCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104668 GGTGTTGGTG...CAGCCTTAGCTCCGGGCGCTGCTGCTACTTCGCCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GGCTCAGCCACCAGGCTGCAGTTCTCCGACCAGGCTGGGGTGTCTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105857 GGCTCAGCCACCAGGCTGCAGTTCTCCGACCAGGCTGGGGTGTCTGTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTACACTGTCACACTCTGGGTGGAATCCTGGGCCAGGAACCAGACAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105907 GTACACTGTCACACTCTGGGTGGAATCCTGGGCCAGGAACCAGACAGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGTCTCCTGAGGTGACCCTGCAGCTCTACAACTCAG         TTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 105957 AGTCTCCTGAGGTGACCCTGCAGCTCTACAACTCAGGTT...CAGTTAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TATGAGCCTCCTCTGGGAGACATCAAGGTGTCCAAGTTGGCCGGGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109174 TATGAGCCTCCTCTGGGAGACATCAAGGTGTCCAAGTTGGCCGGGCAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCGTATGGAGTGGGAGACCCCGGATAACCAGGTTGGTGCTGAGGTGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109224 GCGTATGGAGTGGGAGACCCCGGATAACCAGGTTGGTGCTGAGGTGCAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCCGGCACCGGACACCCAGCAGCCCATGGAAGTTG         GGCGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 109274 TCCGGCACCGGACACCCAGCAGCCCATGGAAGTTGGTG...TAGGGCGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TGCGGACCTCAGGATGATGATACTG         AGTCCTGCCTCTGCCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 110503 TGCGGACCTCAGGATGATGATACTGGTG...CAGAGTCCTGCCTCTGCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CCTGGAGATGAATGTGGCCCAGGAATTCCAGCTCCGACGACGGCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110972 CCTGGAGATGAATGTGGCCCAGGAATTCCAGCTCCGACGACGGCAGCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GGAGCCAAGGAAGTTCCTGGAGCAAGTGGAGCAGCCCCGTGTGCGTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111022 GGAGCCAAGGAAGTTCCTGGAGCAAGTGGAGCAGCCCCGTGTGCGTTCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CCTG         AAAACCCCCCACAGCCTCAGGTGAGATTCTCGGTGGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111072 CCTGGTA...CAGAAAACCCCCCACAGCCTCAGGTGAGATTCTCGGTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GCAGCTGGGCCAGGATGGGAGGAGGCGGCTGACCCTGAAAGAGCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 113262 GCAGCTGGGCCAGGATGGGAGGAGGCGGCTGACCCTGAAAGAGCAGGTA.

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    784      CCAACCCAGCTGGAGCTTCCAGAAGGCTGTCAAGGGCTGGCGCCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113312 ..CAGCCAACCCAGCTGGAGCTTCCAGAAGGCTGTCAAGGGCTGGCGCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GGCACGGAGGTCACTTACCGACTACAGCTCCACATGCTGTCCTGCCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114520 GGCACGGAGGTCACTTACCGACTACAGCTCCACATGCTGTCCTGCCCGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TAAGGCCAAGGCCACCAGGACCCTGCACCTGGGGAAGATGCCCTATCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114570 TAAGGCCAAGGCCACCAGGACCCTGCACCTGGGGAAGATGCCCTATCTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CGGGTGCTGCCTACAACGTGGCTGTCATCTCCTCGAACCAATTTGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114620 CGGGTGCTGCCTACAACGTGGCTGTCATCTCCTCGAACCAATTTGGTCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GGCCTGAACCAGACGTGGCACATTCCTGCCGACACCCACACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 114670 GGCCTGAACCAGACGTGGCACATTCCTGCCGACACCCACACAGGTG...C

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1022   AACCAGTGGCTCTGAATATCAGCGTCGGAACCAACGGGACCACCATGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117109 AGAACCAGTGGCTCTGAATATCAGCGTCGGAACCAACGGGACCACCATGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 ATTGGCCAGCCCGGGCTCAGAGCATGACGTATTGCATTGAATGGCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117159 ATTGGCCAGCCCGGGCTCAGAGCATGACGTATTGCATTGAATGGCAGCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GTGGGCCAGGACGGGGGCCTTGCCACCTGCAGCCTGACTGCGCCGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117209 GTGGGCCAGGACGGGGGCCTTGCCACCTGCAGCCTGACTGCGCCGCAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CCCGGATCCGGCTGGAATGG         CAACCTACAGCTGGAGTCGAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 117259 CCCGGATCCGGCTGGAATGGGTA...CAGCAACCTACAGCTGGAGTCGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGTCTGGGGCAATGGGGCAGGAAAAGTGTTACTACATTACCATCTTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118319 AGTCTGGGGCAATGGGGCAGGAAAAGTGTTACTACATTACCATCTTTGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TCTGCGCACCCCGAGAAGCTCACCTTGTGGTCTACGGTCCTGTCCACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118369 TCTGCGCACCCCGAGAAGCTCACCTTGTGGTCTACGGTCCTGTCCACCTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CCACTTTGGGGGCAATG         CCTCAGCAGCTGGGACACCGCACC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 118419 CCACTTTGGGGGCAATGGTA...CAGCCTCAGCAGCTGGGACACCGCACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 ACGTCTCGGTGAAGAATCATAGCTTGGACTCTGTGTCTGTGGACTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120151 ACGTCTCGGTGAAGAATCATAGCTTGGACTCTGTGTCTGTGGACTGGGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CCATCCCTGCTGAGCACCTGTCCCGGCGTCCTAAAGGAGTATGTTGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120201 CCATCCCTGCTGAGCACCTGTCCCGGCGTCCTAAAGGAGTATGTTGTCCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CTGCCGAGATGAAGACAGCAAACAGGTGTCAG         AGCATCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 120251 CTGCCGAGATGAAGACAGCAAACAGGTGTCAGGTA...CAGAGCATCCCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TGCAGCCCACAGAGACCCAAGTTACCCTCAGTGGCCTGCGGGCTGGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122823 TGCAGCCCACAGAGACCCAAGTTACCCTCAGTGGCCTGCGGGCTGGTGTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GCCTACACGGTGCAGGTGCGAGCAGACACAGCGTGGCTGAGGGGTGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122873 GCCTACACGGTGCAGGTGCGAGCAGACACAGCGTGGCTGAGGGGTGTCTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GAGCCAGCCCCAGCGCTTCAGCATCG         AAGTGCAGGTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 122923 GAGCCAGCCCCAGCGCTTCAGCATCGGTG...CAGAAGTGCAGGTTTCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 ATTGGCTCATCTTCTTCGCCTCCCTGGGGAGCTTCCTGAGCATCCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124562 ATTGGCTCATCTTCTTCGCCTCCCTGGGGAGCTTCCTGAGCATCCTTCTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GTGGGCGTCCTTGGCTACCTTGGCCTGAACAG         GGCCGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 124612 GTGGGCGTCCTTGGCTACCTTGGCCTGAACAGGTA...CAGGGCCGCACG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 GCACCTGTGCCCGCCGCTGCCCACACCCTGTGCCAGCTCCGCCATTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125636 GCACCTGTGCCCGCCGCTGCCCACACCCTGTGCCAGCTCCGCCATTGAGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TCCCTGGAGGGAAGGAG         ACTTGGCAGTGGATCAACCCAGTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 125686 TCCCTGGAGGGAAGGAGGTA...CAGACTTGGCAGTGGATCAACCCAGTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 GACTTCCAGGAAGAGGCATCCCTGCAGGAGGCCCTGGTGGTAGAGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126763 GACTTCCAGGAAGAGGCATCCCTGCAGGAGGCCCTGGTGGTAGAGATGTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 CTGGGACAAAGGCGAGAGGACTGAGCCTCTCGAGAAGACAGAGCTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126813 CTGGGACAAAGGCGAGAGGACTGAGCCTCTCGAGAAGACAGAGCTACCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 AGGGTGCCCCTGAGCTGGCCCTGGATACAGAGTTGTCCTTGGAGGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126863 AGGGTGCCCCTGAGCTGGCCCTGGATACAGAGTTGTCCTTGGAGGATGGA

   2100     .    :    .    :
   1966 GACAGGTGCAAGGCCAAGATG
        ||||||||||||||||||--|
 126913 GACAGGTGCAAGGCCAAG  G