seq1 = pF1KE2037.tfa, 1902 bp
seq2 = pF1KE2037/gi568815582r_11773122.tfa (gi568815582r:11773122_12015546), 242425 bp

>pF1KE2037 1902
>gi568815582r:11773122_12015546 (Chr16)

(complement)

1-343  (99827-100178)   96% ->
344-385  (117512-117553)   100% ->
386-427  (117666-117707)   100% ->
428-655  (118762-118989)   100% ->
656-689  (120560-120593)   100% ->
690-767  (124408-124485)   100% ->
768-948  (127797-127977)   100% ->
949-1103  (128616-128770)   100% ->
1104-1244  (128936-129076)   100% ->
1245-1338  (130273-130366)   100% ->
1339-1419  (132452-132532)   100% ->
1420-1593  (137967-138140)   100% ->
1594-1683  (139372-139461)   100% ->
1684-1852  (139618-139786)   100% ->
1853-1902  (142376-142425)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCCGGGCAGT         GGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGAG
        |||||||||||||||---------||||||||||||||||||||||||||
  99827 ATGGATCCGGGCAGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CAGCAGCGGCAGCAGCAGCAGCGACTCGGCGCCTGACTGCTGGGACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99877 CAGCAGCGGCAGCAGCAGCAGCGACTCGGCGCCTGACTGCTGGGACCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGGACATGGAAGCCCCCGGGCCGGGCCCTTGCGGCGGCGGCGGCTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99927 CGGACATGGAAGCCCCCGGGCCGGGCCCTTGCGGCGGCGGCGGCTCCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGGCGGCGGCCGAGGCCCAGCGGGAGAACCTCAGCGCGGCCTTCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99977 GCGGCGGCGGCCGAGGCCCAGCGGGAGAACCTCAGCGCGGCCTTCAGCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAACTCAACGTCAACGCCAAGCCCTTCGTGCCCAACGTCCACGCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100027 GCAACTCAACGTCAACGCCAAGCCCTTCGTGCCCAACGTCCACGCCGCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTTCGTGCCGTCCTTCCTGCGGTGCCCGGCAGCGCCGCCACCCCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
 100077 AGTTCGTGCCGTCCTTCCTGCGGGGCCCGGCAGCGCCGCCACCCCCAGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGCGGCGCCGCCAATAACCACGGAGCCGGCAGCGGCGCGGGAGGCCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100127 GGCGGCGCCGCCAATAACCACGGAGCCGGCAGCGGCGCGGGAGGCCGTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GG         CACCTGTGGAATCCTCTCAAGAGGAACAGTCATTGTGTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100177 GGGTA...CAGCACCTGTGGAATCCTCTCAAGAGGAACAGTCATTGTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAG         GTTCAAATTCAGCTGTTAGCATGGAACTTTCAGAACCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117551 AAGGTA...TAGGTTCAAATTCAGCTGTTAGCATGGAACTTTCAGAACCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATTG         TAGAAAATGGAGAGACAGAAATGTCTCCAGAAGAATC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117704 ATTGGTA...CAGTAGAAAATGGAGAGACAGAAATGTCTCCAGAAGAATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ATGGGAGCACAAAGAAGAAATAAGTGAAGCAGAGCCAGGGGGTGGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118799 ATGGGAGCACAAAGAAGAAATAAGTGAAGCAGAGCCAGGGGGTGGTTCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGGAGATGGAAGGCCGCCAGAGGAAAGTGCCCATGAAATGATGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118849 TGGGAGATGGAAGGCCGCCAGAGGAAAGTGCCCATGAAATGATGGAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAAGAGGAAATCCCAAAACCTAAGTCTGTGGTTGCACCGCCAGGTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118899 GAAGAGGAAATCCCAAAACCTAAGTCTGTGGTTGCACCGCCAGGTGCTCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TAAGAAAGAGCATGTAAATGTAGTATTCATTGGGCACGTAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 118949 TAAGAAAGAGCATGTAAATGTAGTATTCATTGGGCACGTAGGTA...TAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATGCTGGCAAGTCAACCATTGGAGGACAAATAAT         GTATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 120560 ATGCTGGCAAGTCAACCATTGGAGGACAAATAATGTA...CAGGTATTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ACTGGAATGGTTGACAAAAGGACGCTTGAAAAGTATGAAAGAGAAGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124415 ACTGGAATGGTTGACAAAAGGACGCTTGAAAAGTATGAAAGAGAAGCTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGAGAAAAACAGAGAAACTTG         GTACTTGTCTTGGGCCTTAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 124465 AGAGAAAAACAGAGAAACTTGGTA...CAGGTACTTGTCTTGGGCCTTAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ACACAAATCAGGAAGAACGAGACAAGGGTAAAACAGTAGAAGTGGGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127817 ACACAAATCAGGAAGAACGAGACAAGGGTAAAACAGTAGAAGTGGGTCGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCCTATTTTGAAACCGAAAAGAAGCATTTCACAATTCTAGATGCCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127867 GCCTATTTTGAAACCGAAAAGAAGCATTTCACAATTCTAGATGCCCCTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCACAAGAGTTTTGTCCCAAATATGATTGGTGGTGCCTCTCAAGCTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127917 CCACAAGAGTTTTGTCCCAAATATGATTGGTGGTGCCTCTCAAGCTGATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGGCTGTGCTG         GTAATCTCAGCCAGGAAAGGAGAGTTTGAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 127967 TGGCTGTGCTGGTA...TAGGTAATCTCAGCCAGGAAAGGAGAGTTTGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 ACTGGATTTGAAAAAGGAGGACAGACAAGAGAACATGCAATGTTGGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128646 ACTGGATTTGAAAAAGGAGGACAGACAAGAGAACATGCAATGTTGGCAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GACAGCAGGTGTAAAACACCTAATTGTGCTAATTAATAAGATGGATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128696 GACAGCAGGTGTAAAACACCTAATTGTGCTAATTAATAAGATGGATGATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CAACAGTAAATTGGAGCAATGAGAG         ATATGAAGAATGTAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 128746 CAACAGTAAATTGGAGCAATGAGAGGTG...CAGATATGAAGAATGTAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GAGAAACTAGTGCCATTTTTGAAAAAAGTTGGCTTCAATCCCAAAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128952 GAGAAACTAGTGCCATTTTTGAAAAAAGTTGGCTTCAATCCCAAAAAGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CATTCACTTTATGCCCTGCTCAGGACTTACTGGAGCAAATCTCAAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129002 CATTCACTTTATGCCCTGCTCAGGACTTACTGGAGCAAATCTCAAAGAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AGTCGGATTTCTGTCCTTGGTACAT         TGGATTACCGTTTATT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 129052 AGTCGGATTTCTGTCCTTGGTACATGTA...CAGTGGATTACCGTTTATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CCATATCTGGATAATTTGCCGAACTTCAATAGATCAGTTGATGGACCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130289 CCATATCTGGATAATTTGCCGAACTTCAATAGATCAGTTGATGGACCAAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CAGGCTGCCAATTGTGGATAAGTACAAG         GATATGGGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 130339 CAGGCTGCCAATTGTGGATAAGTACAAGGTA...CAGGATATGGGCACTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TGGTCCTGGGAAAGCTGGAATCAGGATCTATTTGTAAAGGCCAGCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132465 TGGTCCTGGGAAAGCTGGAATCAGGATCTATTTGTAAAGGCCAGCAGCTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GTGATGATGCCAAACAAG         CACAACGTGGAAGTTCTTGGAAT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 132515 GTGATGATGCCAAACAAGGTA...AAGCACAACGTGGAAGTTCTTGGAAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 ACTTTCCGATGATGTAGAGACTGATACCGTAGCCCCAGGTGAAAACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137990 ACTTTCCGATGATGTAGAGACTGATACCGTAGCCCCAGGTGAAAACCTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 AAATCAGACTGAAAGGAATTGAAGAAGAGGAGATTCTTCCAGGGTTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138040 AAATCAGACTGAAAGGAATTGAAGAAGAGGAGATTCTTCCAGGGTTTATA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CTTTGTGATCCTAATAATCTTTGTCATTCTGGACGCACATTTGATGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138090 CTTTGTGATCCTAATAATCTTTGTCATTCTGGACGCACATTTGATGCCCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 G         ATAGTGATTATAGAGCACAAATCCATCATCTGCCCAGGCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138140 GGTA...CAGATAGTGATTATAGAGCACAAATCCATCATCTGCCCAGGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 ATAATGCGGTGCTGCATATTCATACCTGTATTGAGGAGGTGGAAATAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139412 ATAATGCGGTGCTGCATATTCATACCTGTATTGAGGAGGTGGAAATAACA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684          GCCTTAATCTGCTTGGTAGACAAAAAATCAGGAGAAAAAAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139462 GTG...TAGGCCTTAATCTGCTTGGTAGACAAAAAATCAGGAGAAAAAAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 TAAGACCCGACCCCGTTTTGTCAAACAAGATCAAGTATGCATTGCTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139659 TAAGACCCGACCCCGTTTTGTCAAACAAGATCAAGTATGCATTGCTCGCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TAAGGACAGCAGGAACCATCTGCCTTGAGACCTTTAAAGACTTCCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139709 TAAGGACAGCAGGAACCATCTGCCTTGAGACCTTTAAAGACTTCCCTCAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 ATGGGTCGTTTCACCTTAAGAGATGAGG         GTAAGACCATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 139759 ATGGGTCGTTTCACCTTAAGAGATGAGGGTA...TAGGTAAGACCATTGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .
   1866 AATTGGAAAAGTTCTGAAACTGGTTCCAGAGAAAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142389 AATTGGAAAAGTTCTGAAACTGGTTCCAGAGAAAGAC