seq1 = pF1KE2028.tfa, 1833 bp
seq2 = pF1KE2028/gi568815586r_95900992.tfa (gi568815586r:95900992_96135519), 234528 bp

>pF1KE2028 1833
>gi568815586r:95900992_96135519 (Chr12)

(complement)

1-159  (100001-100159)   100% ->
160-290  (106335-106465)   100% ->
291-411  (107956-108076)   100% ->
412-480  (110973-111041)   100% ->
481-585  (113269-113373)   100% ->
586-638  (114383-114435)   100% ->
639-711  (116280-116352)   100% ->
712-852  (116617-116757)   100% ->
853-876  (117940-117963)   100% ->
877-947  (118406-118476)   100% ->
948-1059  (119826-119937)   100% ->
1060-1204  (120521-120665)   100% ->
1205-1308  (121667-121770)   100% ->
1309-1379  (122262-122332)   100% ->
1380-1434  (126372-126426)   100% ->
1435-1530  (129111-129206)   100% ->
1531-1613  (131600-131682)   100% ->
1614-1718  (132456-132560)   100% ->
1719-1833  (134414-134528)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGAGATAGTGGATACCTGTTCGTTGGCCTCTCCGGCTTCCGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGAGATAGTGGATACCTGTTCGTTGGCCTCTCCGGCTTCCGTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGACCAAGCACCTGCACCTGCGCTGCAGCGTCGACTTTACTCGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGACCAAGCACCTGCACCTGCGCTGCAGCGTCGACTTTACTCGCCGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCTGACCGGGACTGCTGCTCTCACGGTCCAGTCTCAGGAGGACAATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCTGACCGGGACTGCTGCTCTCACGGTCCAGTCTCAGGAGGACAATCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCAGCCTG         GTTTTGGATACAAAGGACCTTACAATAGAAAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCAGCCTGGTA...TAGGTTTTGGATACAAAGGACCTTACAATAGAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTAGTGATCAATGGACAAGAAGTCAAATATGCTCTTGGAGAAAGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106367 AGTAGTGATCAATGGACAAGAAGTCAAATATGCTCTTGGAGAAAGACAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTTACAAGGGATCGCCAATGGAAATCTCTCTTCCTATCGCTTTGAGCAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 106417 GTTACAAGGGATCGCCAATGGAAATCTCTCTTCCTATCGCTTTGAGCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    291         AAATCAAGAAATTGTTATAGAAATTTCTTTTGAGACCTCTCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106467 TA...CAGAAATCAAGAAATTGTTATAGAAATTTCTTTTGAGACCTCTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAAATCTTCTGCTCTCCAGTGGCTCACTCCTGAACAGACTTCTGGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107998 AAAATCTTCTGCTCTCCAGTGGCTCACTCCTGAACAGACTTCTGGGAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AACACCCATATCTCTTTAGTCAGTGCCAG         GCCATCCACTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 108048 AACACCCATATCTCTTTAGTCAGTGCCAGGTA...CAGGCCATCCACTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGAGCAATCCTTCCTTGTCAGGACACTCCTTCTGTGAAATTAACCTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110985 AGAGCAATCCTTCCTTGTCAGGACACTCCTTCTGTGAAATTAACCTATAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGCAGAG         GTGTCTGTCCCTAAAGAACTGGTGGCACTTATGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111035 TGCAGAGGTA...TAGGTGTCTGTCCCTAAAGAACTGGTGGCACTTATGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTGCTATTCGTGATGGAGAAACACCTGACCCAGAAGACCCAAGCAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113303 GTGCTATTCGTGATGGAGAAACACCTGACCCAGAAGACCCAAGCAGGAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATATACAAATTCATCCAAAAA         GTTCCAATACCCTGCTACCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 113353 ATATACAAATTCATCCAAAAAGTA...TAGGTTCCAATACCCTGCTACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GATTGCTTTAGTTGTTGGAGCTTTAGAAAGCAG         GCAAATTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 114403 GATTGCTTTAGTTGTTGGAGCTTTAGAAAGCAGGTG...CAGGCAAATTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GCCCAAGAACTTTGGTGTGGTCTGAGAAAGAGCAGGTGGAAAAGTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116288 GCCCAAGAACTTTGGTGTGGTCTGAGAAAGAGCAGGTGGAAAAGTCTGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TATGAGTTTTCTGAG         ACTGAATCTATGCTTAAAATAGCAGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 116338 TATGAGTTTTCTGAGGTT...CAGACTGAATCTATGCTTAAAATAGCAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGATCTGGGAGGACCGTATGTATGGGGACAGTATGACCTATTGGTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116643 AGATCTGGGAGGACCGTATGTATGGGGACAGTATGACCTATTGGTCCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CACCATCCTTCCCTTATGGTGGCATGGAGAATCCTTGCCTTACTTTTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116693 CACCATCCTTCCCTTATGGTGGCATGGAGAATCCTTGCCTTACTTTTGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ACTCCTACTCTACTG         GCAGGCGACAAGTCACTCTCCAAT  
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||>>
 116743 ACTCCTACTCTACTGGTA...TAGGCAGGCGACAAGTCACTCTCCAATGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    877        GTCATTGCACATGAAATATCTCATAGCTGGACAGGGAATCTAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117966 A...TAGGTCATTGCACATGAAATATCTCATAGCTGGACAGGGAATCTAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TGACCAACAAAACTTGGGATCACTTTTG         GTTAAATGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 118449 TGACCAACAAAACTTGGGATCACTTTTGGTA...CAGGTTAAATGAGGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 CATACTGTGTACTTGGAACGCCACATTTGCGGACGATTGTTTGGTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119839 CATACTGTGTACTTGGAACGCCACATTTGCGGACGATTGTTTGGTGAAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GTTCAGACATTTTAATGCTCTGGGAGGATGGGGAGAACTACAGAATTCG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 119889 GTTCAGACATTTTAATGCTCTGGGAGGATGGGGAGAACTACAGAATTCGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1060         GTAAAGACATTTGGGGAGACACATCCTTTCACCAAACTTGTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119939 TA...CAGGTAAAGACATTTGGGGAGACACATCCTTTCACCAAACTTGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 GTTGATCTGACAGATATAGACCCTGATGTAGCTTATTCTTCAGTTCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120563 GTTGATCTGACAGATATAGACCCTGATGTAGCTTATTCTTCAGTTCCCTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 TGAGAAGGGCTTTGCTTTACTTTTTTACCTTGAACAACTGCTTGGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120613 TGAGAAGGGCTTTGCTTTACTTTTTTACCTTGAACAACTGCTTGGAGGAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 CAG         AGATTTTCCTAGGATTCTTAAAAGCTTATGTTGAGAAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120663 CAGGTA...TAGAGATTTTCCTAGGATTCTTAAAAGCTTATGTTGAGAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 TTTTCCTATAAGAGCATAACTACTGATGACTGGAAGGATTTCCTGTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121705 TTTTCCTATAAGAGCATAACTACTGATGACTGGAAGGATTTCCTGTATTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 CTATTTTAAAGATAAG         GTTGATGTTCTCAATCAAGTTGATT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 121755 CTATTTTAAAGATAAGGTT...TAGGTTGATGTTCTCAATCAAGTTGATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 GGAATGCCTGGCTCTACTCTCCTGGACTGCCTCCCATAAAGCCCAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 122287 GGAATGCCTGGCTCTACTCTCCTGGACTGCCTCCCATAAAGCCCAAGTA.

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1380      TTATGATATGACTCTGACAAATGCTTGTATTGCCTTAAGTCAAAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122337 ..CAGTTATGATATGACTCTGACAAATGCTTGTATTGCCTTAAGTCAAAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 ATGGATTACT         GCCAAAGAAGATGATTTAAATTCATTCAATG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 126417 ATGGATTACTGTA...CAGGCCAAAGAAGATGATTTAAATTCATTCAATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 CCACAGACCTGAAGGATCTCTCTTCTCATCAATTGAATGAGTTTTTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129142 CCACAGACCTGAAGGATCTCTCTTCTCATCAATTGAATGAGTTTTTAGCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 CAGACGCTCCAGAGG         GCACCTCTTCCATTGGGGCACATAAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 129192 CAGACGCTCCAGAGGGTA...TAGGCACCTCTTCCATTGGGGCACATAAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 GCGAATGCAAGAGGTGTACAACTTCAATGCCATTAACAATTCTGAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131626 GCGAATGCAAGAGGTGTACAACTTCAATGCCATTAACAATTCTGAAATAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 GATTCAG         ATGGCTGCGGCTCTGCATTCAATCCAAGTGGGAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131676 GATTCAGGTA...TAGATGGCTGCGGCTCTGCATTCAATCCAAGTGGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1648 GACGCAATTCCTTTGGCGCTAAAGATGGCAACTGAACAAGGAAGAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132490 GACGCAATTCCTTTGGCGCTAAAGATGGCAACTGAACAAGGAAGAATGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698 GTTTACCCGGCCCTTATTCAA         GGATCTTGCTGCCTTTGACA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 132540 GTTTACCCGGCCCTTATTCAAGTA...CAGGGATCTTGCTGCCTTTGACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1739 AATCCCATGATCAAGCTGTCCGAACCTACCAAGAGCACAAAGCAAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134434 AATCCCATGATCAAGCTGTCCGAACCTACCAAGAGCACAAAGCAAGCATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1789 CATCCCGTGACTGCAATGCTGGTGGGGAAAGACTTAAAAGTGGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134484 CATCCCGTGACTGCAATGCTGGTGGGGAAAGACTTAAAAGTGGAT