seq1 = pF1KE2026.tfa, 1827 bp
seq2 = pF1KE2026/gi568815587r_64627305.tfa (gi568815587r:64627305_64842866), 215562 bp

>pF1KE2026 1827
>gi568815587r:64627305_64842866 (Chr11)

(complement)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-176  (100755-100857)   100% ->
177-239  (101366-101428)   100% ->
240-371  (101788-101919)   100% ->
372-522  (102704-102854)   100% ->
523-696  (103058-103231)   100% ->
697-813  (103391-103507)   100% ->
814-1095  (105833-106114)   100% ->
1096-1173  (106887-106964)   100% ->
1174-1296  (107203-107325)   100% ->
1297-1412  (107640-107755)   100% ->
1413-1554  (112673-112814)   100% ->
1555-1591  (113069-113105)   100% ->
1592-1771  (113825-114004)   100% ->
1772-1827  (115507-115562)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGGCACCCTGGACCTGGACAAGGGCTGCACGGTGGAGGAGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGGCACCCTGGACCTGGACAAGGGCTGCACGGTGGAGGAGCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCGGGTGCATCGAAGCCTTCG         ATGACTCCGGGAAGGTGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 CCGCGGGTGCATCGAAGCCTTCGGTG...CAGATGACTCCGGGAAGGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGGACCCGCAGCTGGTGCGCATGTTCCTCATGATGCACCCCTGGTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100773 GGGACCCGCAGCTGGTGCGCATGTTCCTCATGATGCACCCCTGGTACATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCTCCTCTCAGCTGGCGGCCAAGCTGCTCCACAT         CTACCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100823 CCCTCCTCTCAGCTGGCGGCCAAGCTGCTCCACATATA...CACCTACCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ACAATCCCGGAAGGACAACTCCAATTCCCTGCAGGTGAAAACGTGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101372 ACAATCCCGGAAGGACAACTCCAATTCCCTGCAGGTGAAAACGTGCCACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGTCAG         GTACTGGATCTCCGCCTTCCCAGCGGAGTTTGAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101422 TGGTCAGGTG...CAGGTACTGGATCTCCGCCTTCCCAGCGGAGTTTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTGAACCCGGAGTTGGCTGAGCAGATCAAGGAGCTGAAGGCTCTGCTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101822 TTGAACCCGGAGTTGGCTGAGCAGATCAAGGAGCTGAAGGCTCTGCTAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCAAGAAGGGAACCGACGGCACAGCAGCCTAATCGACATAGACAGCGT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101872 CCAAGAAGGGAACCGACGGCACAGCAGCCTAATCGACATAGACAGCGTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    372        CCCTACCTACAAGTGGAAGCGGCAGGTGACTCAGCGGAACCCT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101922 G...CAGCCCTACCTACAAGTGGAAGCGGCAGGTGACTCAGCGGAACCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTGGGACAGAAAAAGCGCAAGATGTCCCTGTTGTTTGACCACCTGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102747 GTGGGACAGAAAAAGCGCAAGATGTCCCTGTTGTTTGACCACCTGGAGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CATGGAGCTGGCGGAGCATCTCACCTACTTGGAGTATCGCTCCTTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102797 CATGGAGCTGGCGGAGCATCTCACCTACTTGGAGTATCGCTCCTTCTGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGATCCTG         TTTCAGGACTATCACAGTTTCGTGACTCATGGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 102847 AGATCCTGGTG...CAGTTTCAGGACTATCACAGTTTCGTGACTCATGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TGCACTGTGGACAACCCCGTCCTGGAGCGGTTCATCTCCCTCTTCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103091 TGCACTGTGGACAACCCCGTCCTGGAGCGGTTCATCTCCCTCTTCAACAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CGTCTCACAGTGGGTGCAGCTCATGATCCTCAGCAAACCCACAGCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103141 CGTCTCACAGTGGGTGCAGCTCATGATCCTCAGCAAACCCACAGCCCCGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGCGGGCCCTGGTCATCACACACTTTGTCCACGTGGCGGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 103191 AGCGGGCCCTGGTCATCACACACTTTGTCCACGTGGCGGAGGTG...CAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AAGCTGCTACAGCTGCAGAACTTCAACACGCTGATGGCAGTGGTCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103391 AAGCTGCTACAGCTGCAGAACTTCAACACGCTGATGGCAGTGGTCGGGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCTGAGCCACAGCTCCATCTCCCGCCTCAAGGAGACCCACAGCCACGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103441 CCTGAGCCACAGCTCCATCTCCCGCCTCAAGGAGACCCACAGCCACGTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCCCTGAGACCATCAAG         CTCTGGGAGGGTCTCACGGAACTA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103491 GCCCTGAGACCATCAAGGTG...CAGCTCTGGGAGGGTCTCACGGAACTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GTGACGGCGACAGGCAACTATGGCAACTACCGGCGTCGGCTGGCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105857 GTGACGGCGACAGGCAACTATGGCAACTACCGGCGTCGGCTGGCAGCCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGTGGGCTTCCGCTTCCCGATCCTGGGTGTGCACCTCAAGGACCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105907 TGTGGGCTTCCGCTTCCCGATCCTGGGTGTGCACCTCAAGGACCTGGTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCCTGCAGCTGGCACTGCCTGACTGGCTGGACCCAGCCCGGACCCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105957 CCCTGCAGCTGGCACTGCCTGACTGGCTGGACCCAGCCCGGACCCGGCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AACGGGGCCAAGATGAAGCAGCTCTTTAGCATCCTGGAGGAGCTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106007 AACGGGGCCAAGATGAAGCAGCTCTTTAGCATCCTGGAGGAGCTGGCCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGTGACCAGCCTGCGGCCACCAGTACAGGCCAACCCCGACCTGCTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106057 GGTGACCAGCCTGCGGCCACCAGTACAGGCCAACCCCGACCTGCTGAGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGCTCACG         GTGTCTCTGGATCAGTATCAGACGGAGGATGAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 106107 TGCTCACGGTG...CAGGTGTCTCTGGATCAGTATCAGACGGAGGATGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CTGTACCAGCTGTCCCTGCAGCGGGAGCCGCGCTCCAAGTCCTCG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 106920 CTGTACCAGCTGTCCCTGCAGCGGGAGCCGCGCTCCAAGTCCTCGGTG..

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174     CCAACCAGCCCCACGAGTTGCACCCCACCACCCCGGCCCCCGGTAC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106970 .TAGCCAACCAGCCCCACGAGTTGCACCCCACCACCCCGGCCCCCGGTAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TGGAGGAGTGGACCTCGGCTGCCAAACCCAAGCTGGATCAGGCCCTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107249 TGGAGGAGTGGACCTCGGCTGCCAAACCCAAGCTGGATCAGGCCCTCGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GTGGAGCACATCGAGAAGATGGTGGAG         TCTGTGTTCCGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 107299 GTGGAGCACATCGAGAAGATGGTGGAGGTG...CAGTCTGTGTTCCGGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CTTTGACGTCGATGGGGATGGCCACATCTCACAGGAAGAATTCCAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107654 CTTTGACGTCGATGGGGATGGCCACATCTCACAGGAAGAATTCCAGATCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TCCGTGGGAACTTCCCTTACCTCAGCGCCTTTGGGGACCTCGACCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107704 TCCGTGGGAACTTCCCTTACCTCAGCGCCTTTGGGGACCTCGACCAGAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CA         GGATGGCTGCATCAGCAGGGAGGAGATGGTTTCCTATTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107754 CAGTG...CAGGGATGGCTGCATCAGCAGGGAGGAGATGGTTTCCTATTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CCTGCGCTCCAGCTCTGTGTTGGGGGGGCGCATGGGCTTCGTACACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112712 CCTGCGCTCCAGCTCTGTGTTGGGGGGGCGCATGGGCTTCGTACACAACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TCCAGGAGAGCAACTCCTTGCGCCCCGTCGCCTGCCGCCACTGCAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112762 TCCAGGAGAGCAACTCCTTGCGCCCCGTCGCCTGCCGCCACTGCAAAGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CTG         ATCCTGGGCATCTACAAGCAGGGCCTCAAATGCCGAG 
        |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 112812 CTGGTG...CAGATCCTGGGCATCTACAAGCAGGGCCTCAAATGCCGAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592         CCTGTGGAGTGAACTGCCACAAGCAGTGCAAGGATCGCCTGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113107 TG...CAGCCTGTGGAGTGAACTGCCACAAGCAGTGCAAGGATCGCCTGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 CAGTTGAGTGTCGGCGCAGGGCCCAGAGTGTGAGCCTGGAGGGGTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113867 CAGTTGAGTGTCGGCGCAGGGCCCAGAGTGTGAGCCTGGAGGGGTCTGCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 CCCTCACCCTCACCCATGCACAGCCACCATCACCGCGCCTTCAGCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113917 CCCTCACCCTCACCCATGCACAGCCACCATCACCGCGCCTTCAGCTTCTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 TCTGCCCCGCCCTGGCAGGCGAGGCTCCAGGCCTCCAG         AGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 113967 TCTGCCCCGCCCTGGCAGGCGAGGCTCCAGGCCTCCAGGTA...CAGAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TCCGTGAGGAGGAGGTACAGACGGTGGAGGATGGGGTGTTTGACATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115510 TCCGTGAGGAGGAGGTACAGACGGTGGAGGATGGGGTGTTTGACATCCAC

   1950 
   1825 TTG
        |||
 115560 TTG