seq1 = pF1KE2023.tfa, 1797 bp
seq2 = pF1KE2023/gi568815597f_37375497.tfa (gi568815597f:37375497_37583608), 208112 bp

>pF1KE2023 1797
>gi568815597f:37375497_37583608 (Chr1)

1-443  (100001-100443)   100% ->
444-583  (104794-104933)   100% ->
584-818  (106105-106339)   100% ->
819-925  (106938-107044)   100% ->
926-1797  (107241-108112)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGGCCCCTGTGGAGAGAAGCCTGTCCTGGAAGCCAGCCCCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTGGCCCCTGTGGAGAGAAGCCTGTCCTGGAAGCCAGCCCCACCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGTCTGTGGGAATTTGAGGACAGCCACAGCCGTCAGGGCACCCCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGTCTGTGGGAATTTGAGGACAGCCACAGCCGTCAGGGCACCCCAAGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGGTCAAGAGCTGGCCGCTGAGGAGGCCTCGGCCCTGGAACTGCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGGTCAAGAGCTGGCCGCTGAGGAGGCCTCGGCCCTGGAACTGCAGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGGTGGACTTCTTCCGGAAGCTGGGCTATTCATCCACGGAGATCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGGTGGACTTCTTCCGGAAGCTGGGCTATTCATCCACGGAGATCCACAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTCCTGCAGAAGCTGGGCGTCCAGGCAGACACCAACACGGTGCTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTCCTGCAGAAGCTGGGCGTCCAGGCAGACACCAACACGGTGCTGGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCTGGTGAAACACGGGACAGCCACCGAGCGGGAGCGCCAGACCTCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCTGGTGAAACACGGGACAGCCACCGAGCGGGAGCGCCAGACCTCACCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACCCCTGCCCTCAGCTCCCTCTAGTCCCGCGGGGTGGTGGCACCCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACCCCTGCCCTCAGCTCCCTCTAGTCCCGCGGGGTGGTGGCACCCCTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCTCCCAACCTGGAGCCTCCACTCCCAGAAGAGGAAAAGGAGGGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCTCCCAACCTGGAGCCTCCACTCCCAGAAGAGGAAAAGGAGGGCAGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCTGAGACCAGTGGTCATCGATGGGAGCAACGTGGCCATGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100401 ACCTGAGACCAGTGGTCATCGATGGGAGCAACGTGGCCATGAGGTA...C

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    444   CCATGGGAACAAGGAGGTCTTCTCCTGCCGGGGCATCCTGCTGGCAGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104792 AGCCATGGGAACAAGGAGGTCTTCTCCTGCCGGGGCATCCTGCTGGCAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GAACTGGTTTCTGGAGCGGGGCCACACAGACATCACAGTGTTTGTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104842 GAACTGGTTTCTGGAGCGGGGCCACACAGACATCACAGTGTTTGTGCCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCTGGAGGAAGGAGCAGCCTCGGCCCGACGTGCCCATCACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104892 CCTGGAGGAAGGAGCAGCCTCGGCCCGACGTGCCCATCACAGGTG...CA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    584  ACCAGCACATCCTGCGGGAACTGGAGAAGAAGAAGATCCTGGTGTTCAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106104 GACCAGCACATCCTGCGGGAACTGGAGAAGAAGAAGATCCTGGTGTTCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 ACCATCACGACGCGTGGGTGGCAAGCGGGTGGTGTGCTATGACGACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106154 ACCATCACGACGCGTGGGTGGCAAGCGGGTGGTGTGCTATGACGACAGAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TCATTGTGAAGCTGGCCTACGAGTCTGACGGGATCGTGGTTTCCAACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106204 TCATTGTGAAGCTGGCCTACGAGTCTGACGGGATCGTGGTTTCCAACGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ACATACCGTGACCTCCAAGGCGAGCGGCAGGAGTGGAAGCGCTTCATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106254 ACATACCGTGACCTCCAAGGCGAGCGGCAGGAGTGGAAGCGCTTCATCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GGAGCGGCTGCTCATGTACTCCTTCGTCAATGACAA         GTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 106304 GGAGCGGCTGCTCATGTACTCCTTCGTCAATGACAAGTA...CAGGTTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TGCCCCCTGATGACCCACTGGGCCGGCACGGGCCCAGCCTGGACAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106943 TGCCCCCTGATGACCCACTGGGCCGGCACGGGCCCAGCCTGGACAACTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CTGCGTAAGAAGCCACTCACTTTGGAGCACAGGAAGCAGCCGTGTCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106993 CTGCGTAAGAAGCCACTCACTTTGGAGCACAGGAAGCAGCCGTGTCCCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TG         GAAGGAAATGCACCTATGGGATCAAGTGCCGATTCTTCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107043 TGGTA...CAGGAAGGAAATGCACCTATGGGATCAAGTGCCGATTCTTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ACCCAGAGCGGCCAAGCTGCCCCCAGCGCTCTGTGGCAGATGAGCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107280 ACCCAGAGCGGCCAAGCTGCCCCCAGCGCTCTGTGGCAGATGAGCTCCGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GCCAATGCTCTCCTCTCACCCCCCAGAGCCCCAAGCAAGGACAAAAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107330 GCCAATGCTCTCCTCTCACCCCCCAGAGCCCCAAGCAAGGACAAAAATGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CCGGCGGCCTTCACCTTCATCCCAGTCCAGCTCTCTGCTAACAGAGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107380 CCGGCGGCCTTCACCTTCATCCCAGTCCAGCTCTCTGCTAACAGAGAGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 AGCAGTGCAGCCTGGATGGGAAGAAGCTGGGGGCCCAGGCATCCCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107430 AGCAGTGCAGCCTGGATGGGAAGAAGCTGGGGGCCCAGGCATCCCCAGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TCCCGCCAAGAGGGTCTAACACAGACCTATGCCCCATCAGGCAGGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107480 TCCCGCCAAGAGGGTCTAACACAGACCTATGCCCCATCAGGCAGGAGCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CGCACCTAGCGGGGGCAGTGGCAGCAGCTTTGGGCCCACAGACTGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107530 CGCACCTAGCGGGGGCAGTGGCAGCAGCTTTGGGCCCACAGACTGGCTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 CACAGACGCTGGACTCACTCCCGTACGTCTCCCAGGATTGCCTGGACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107580 CACAGACGCTGGACTCACTCCCGTACGTCTCCCAGGATTGCCTGGACTCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GGCATTGGCTCCCTGGAGAGCCAGATGTCGGAACTTTGGGGGGTTCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107630 GGCATTGGCTCCCTGGAGAGCCAGATGTCGGAACTTTGGGGGGTTCGAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 AGGAGGCCCTGGTGAGCCGGGCCCACCCCGAGCCCCTTACACGGGCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107680 AGGAGGCCCTGGTGAGCCGGGCCCACCCCGAGCCCCTTACACGGGCTACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 GTCCCTATGGATCTGAGCTCCCAGCCACCGCAGCCTTCTCTGCCTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107730 GTCCCTATGGATCTGAGCTCCCAGCCACCGCAGCCTTCTCTGCCTTTGGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 CGGGCCATGGGTGCTGGCCACTTCAGTGTCCCTGCCGACTACCCACCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107780 CGGGCCATGGGTGCTGGCCACTTCAGTGTCCCTGCCGACTACCCACCCGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 GCCCCCTGCCTTTCCACCTCGAGAGTACTGGTCTGAACCATACCCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107830 GCCCCCTGCCTTTCCACCTCGAGAGTACTGGTCTGAACCATACCCACTGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 CCCCACCCACATCAGTCCTTCAGGAGCCCCCAGTGCAGAGCCCAGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107880 CCCCACCCACATCAGTCCTTCAGGAGCCCCCAGTGCAGAGCCCAGGGGCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 GGCAGGAGCCCGTGGGGCAGGGCAGGCAGCCTGGCCAAGGAGCAGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107930 GGCAGGAGCCCGTGGGGCAGGGCAGGCAGCCTGGCCAAGGAGCAGGCCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 CGTGTATACTAAGCTGTGTGGTGTGTTTCCCCCGCACCTGGTGGAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107980 CGTGTATACTAAGCTGTGTGGTGTGTTTCCCCCGCACCTGGTGGAGGCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 TGATGGGGCGCTTCCCACAGCTCCTGGACCCCCAGCAGCTGGCTGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108030 TGATGGGGCGCTTCCCACAGCTCCTGGACCCCCAGCAGCTGGCTGCCGAG

   1800     .    :    .    :    .    :
   1765 ATCCTCTCCTACAAGTCCCAGCACCCCAGTGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 108080 ATCCTCTCCTACAAGTCCCAGCACCCCAGTGAG