seq1 = pF1KE2022.tfa, 1797 bp
seq2 = pF1KE2022/gi568815596f_102323278.tfa (gi568815596f:102323278_102552178), 228901 bp

>pF1KE2022 1797
>gi568815596f:102323278_102552178 (Chr2)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-395  (100534-100858)   100% ->
396-579  (100954-101137)   100% ->
580-730  (113935-114085)   100% ->
731-796  (118035-118100)   100% ->
797-920  (119923-120046)   100% ->
921-1072  (121912-122063)   100% ->
1073-1210  (123793-123930)   100% ->
1211-1384  (127571-127744)   100% ->
1385-1797  (128489-128901)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCTGTTTGGGCTGGATATTTCTTTGGCTTGTTGCAGGAGAGCGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCTGTTTGGGCTGGATATTTCTTTGGCTTGTTGCAGGAGAGCGAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAAAGGATTTAATATTTCAG         GTTGTTCCACAAAAAAACTCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 TAAAGGATTTAATATTTCAGGTA...CAGGTTGTTCCACAAAAAAACTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTTGGACATATTCTACAAGGAGTGAAGAGGAATTTGTCTTATTTTGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100555 TTTGGACATATTCTACAAGGAGTGAAGAGGAATTTGTCTTATTTTGTGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTACCAGAGCCACAGAAATCACATTTCTGCCACAGAAATCGACTCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100605 TTACCAGAGCCACAGAAATCACATTTCTGCCACAGAAATCGACTCTCACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAAACAAGTCCCTGAGCACCTGCCCTTCATGGGTAGTAACGACCTATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100655 AAAACAAGTCCCTGAGCACCTGCCCTTCATGGGTAGTAACGACCTATCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGTCCAATGGTACCAACAACCTTCGAATGGAGATCCATTAGAGGACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100705 ATGTCCAATGGTACCAACAACCTTCGAATGGAGATCCATTAGAGGACATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGGAAAAGCTATCCTCACATCATTCAGGACAAATGTACCCTTCACTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100755 AGGAAAAGCTATCCTCACATCATTCAGGACAAATGTACCCTTCACTTTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GACCCCAGGGGTGAATAATTCTGGGTCATATATTTGTAGACCCAAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100805 GACCCCAGGGGTGAATAATTCTGGGTCATATATTTGTAGACCCAAGATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTAA         GAGCCCCTATGATGTAGCCTGTTGTGTCAAGATGATT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100855 TTAAGTA...TAGGAGCCCCTATGATGTAGCCTGTTGTGTCAAGATGATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTAGAAGTTAAGCCCCAGACAAATGCATCCTGTGAGTATTCCGCATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100991 TTAGAAGTTAAGCCCCAGACAAATGCATCCTGTGAGTATTCCGCATCACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TAAGCAAGACCTACTTCTTGGGAGCACTGGCTCTATTTCTTGCCCCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101041 TAAGCAAGACCTACTTCTTGGGAGCACTGGCTCTATTTCTTGCCCCAGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCAGCTGCCAAAGTGATGCACAAAGTCCAGCGGTAACCTGGTACAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101091 TCAGCTGCCAAAGTGATGCACAAAGTCCAGCGGTAACCTGGTACAAGGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    580       AATGGAAAACTCCTCTCTGTGGAAAGGAGCAACCGAATCGTAGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101141 ...TAGAATGGAAAACTCCTCTCTGTGGAAAGGAGCAACCGAATCGTAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGATGAAGTTTATGACTATCACCAGGGCACATATGTATGTGATTACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113979 GGATGAAGTTTATGACTATCACCAGGGCACATATGTATGTGATTACACTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGTCGGATACTGTGAGTTCGTGGACAGTCAGAGCTGTTGTTCAAGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114029 AGTCGGATACTGTGAGTTCGTGGACAGTCAGAGCTGTTGTTCAAGTGAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ACCATTG         TGGGAGACACTAAACTCAAACCAGATATTCTGGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114079 ACCATTGGTA...CAGTGGGAGACACTAAACTCAAACCAGATATTCTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TCCTGTCGAGGACACACTGGAAGTAGAACTTG         GAAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 118069 TCCTGTCGAGGACACACTGGAAGTAGAACTTGGTA...CAGGAAAGCCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TAACTATTAGCTGCAAAGCACGATTTGGCTTTGAAAGGGTCTTTAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119932 TAACTATTAGCTGCAAAGCACGATTTGGCTTTGAAAGGGTCTTTAACCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GTCATAAAATGGTACATCAAAGATTCTGACCTAGAGTGGGAAGTCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119982 GTCATAAAATGGTACATCAAAGATTCTGACCTAGAGTGGGAAGTCTCAGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ACCTGAGGCGAAAAG         TATTAAATCCACTTTAAAGGATGAAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 120032 ACCTGAGGCGAAAAGGTA...CAGTATTAAATCCACTTTAAAGGATGAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCATTGAGCGTAATATCATCTTGGAAAAAGTCACTCAGCGTGATCTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121938 TCATTGAGCGTAATATCATCTTGGAAAAAGTCACTCAGCGTGATCTTCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AGGAAGTTTGTTTGCTTTGTCCAGAACTCCATTGGAAACACAACCCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121988 AGGAAGTTTGTTTGCTTTGTCCAGAACTCCATTGGAAACACAACCCAGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CGTCCAACTGAAAGAAAAGAGAGGAG         TGGTGCTCCTGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 122038 CGTCCAACTGAAAGAAAAGAGAGGAGGTA...CAGTGGTGCTCCTGTACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCCTGCTTGGCACCATCGGGACCCTGGTGGCCGTGCTGGCGGCGAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123808 TCCTGCTTGGCACCATCGGGACCCTGGTGGCCGTGCTGGCGGCGAGTGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CTCCTCTACAGGCACTGGATTGAAATAGTGCTGCTGTACCGGACCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123858 CTCCTCTACAGGCACTGGATTGAAATAGTGCTGCTGTACCGGACCTACCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GAGCAAGGATCAGACGCTTGGGG         ATAAAAAGGATTTTGATG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 123908 GAGCAAGGATCAGACGCTTGGGGGTA...CAGATAAAAAGGATTTTGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CTTTCGTATCCTATGCAAAATGGAGCTCTTTTCCAAGTGAGGCCACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127589 CTTTCGTATCCTATGCAAAATGGAGCTCTTTTCCAAGTGAGGCCACTTCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TCTCTGAGTGAAGAACACTTGGCCCTGAGCCTATTTCCTGATGTTTTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127639 TCTCTGAGTGAAGAACACTTGGCCCTGAGCCTATTTCCTGATGTTTTAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 AAACAAATATGGATATAGCCTGTGTTTGCTTGAAAGAGATGTGGCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127689 AAACAAATATGGATATAGCCTGTGTTTGCTTGAAAGAGATGTGGCTCCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GAGGAG         TGTATGCAGAAGACATTGTGAGCATTATTAAGAGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127739 GAGGAGGTA...CAGTGTATGCAGAAGACATTGTGAGCATTATTAAGAGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 AGCAGAAGAGGAATATTTATCTTGAGCCCCAACTATGTCAATGGACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128524 AGCAGAAGAGGAATATTTATCTTGAGCCCCAACTATGTCAATGGACCCAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TATCTTTGAACTACAAGCAGCAGTGAATCTTGCCTTGGATGATCAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128574 TATCTTTGAACTACAAGCAGCAGTGAATCTTGCCTTGGATGATCAAACAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TGAAACTCATTTTAATTAAGTTCTGTTACTTCCAAGAGCCAGAGTCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128624 TGAAACTCATTTTAATTAAGTTCTGTTACTTCCAAGAGCCAGAGTCTCTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CCTCATCTCGTGAAAAAAGCTCTCAGGGTTTTGCCCACAGTTACTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128674 CCTCATCTCGTGAAAAAAGCTCTCAGGGTTTTGCCCACAGTTACTTGGAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 AGGCTTAAAATCAGTTCCTCCCAATTCTAGGTTCTGGGCCAAAATGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128724 AGGCTTAAAATCAGTTCCTCCCAATTCTAGGTTCTGGGCCAAAATGCGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 ACCACATGCCTGTGAAAAACTCTCAGGGATTCACGTGGAACCAGCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128774 ACCACATGCCTGTGAAAAACTCTCAGGGATTCACGTGGAACCAGCTCAGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 ATTACCTCTAGGATTTTTCAGTGGAAAGGACTCAGTAGAACAGAAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128824 ATTACCTCTAGGATTTTTCAGTGGAAAGGACTCAGTAGAACAGAAACCAC

   1850     .    :    .    :    .
   1770 TGGGAGGAGCTCCCAGCCTAAGGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 128874 TGGGAGGAGCTCCCAGCCTAAGGAATGG