seq1 = pF1KE1978.tfa, 1665 bp
seq2 = pF1KE1978/gi568815588r_70498056.tfa (gi568815588r:70498056_70700902), 202847 bp

>pF1KE1978 1665
>gi568815588r:70498056_70700902 (Chr10)

(complement)

1-539  (100001-100539)   100% ->
540-1665  (101722-102847)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCCCGTCTGCTCCTCCTGGGCATCCTTCTCCTGCTGCTGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCCCGTCTGCTCCTCCTGGGCATCCTTCTCCTGCTGCTGCCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCGTCCCTGCCCCGTGCCACACAGCCGCACGCTCAGAGTGCAAGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCCGTCCCTGCCCCGTGCCACACAGCCGCACGCTCAGAGTGCAAGCGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCACAAGTTCGTGCCTGGTGCATGGCTGGCCGGGGAGGGTGTGGACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCACAAGTTCGTGCCTGGTGCATGGCTGGCCGGGGAGGGTGTGGACGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCAGCCTCCGCCGCTCGGGCTCCTTCCCAGTGGACACACAAAGGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCAGCCTCCGCCGCTCGGGCTCCTTCCCAGTGGACACACAAAGGTTCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGGCCCGACGGCACCTGCACCCTCTGTGAAAATGCCCTACAGGAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGGCCCGACGGCACCTGCACCCTCTGTGAAAATGCCCTACAGGAGGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCTCCAGCGCCTGCCTCTGGCGCTCACCAACTGGCGGGCCCAGGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCTCCAGCGCCTGCCTCTGGCGCTCACCAACTGGCGGGCCCAGGGCTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCTGCCAGCGCCATGTAACCAGGGCCAAAGTCAGCTCCACTGAAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCTGCCAGCGCCATGTAACCAGGGCCAAAGTCAGCTCCACTGAAGCTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCCGGGATGCGGCTCGTAGCATCCGCAACGACTGGAAGGTCGGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCCGGGATGCGGCTCGTAGCATCCGCAACGACTGGAAGGTCGGGCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACGTGACTCCTAAGCCCACCAGCAATGTGCATGTGTCTGTGGCCGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACGTGACTCCTAAGCCCACCAGCAATGTGCATGTGTCTGTGGCCGGCTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CACTCACAGGCAGCCAACTTTGCAGCCCAGAAGACCCACCAGGACCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CACTCACAGGCAGCCAACTTTGCAGCCCAGAAGACCCACCAGGACCAGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGCTTCAGCACTGACACGGTGGAGTGCCGCTTCTACAG         TT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100501 CAGCTTCAGCACTGACACGGTGGAGTGCCGCTTCTACAGGTG...CAGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCCATGTGGTACACACTCCCCCGCTGCACCCTGACTTCAAGAGGGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101724 TCCATGTGGTACACACTCCCCCGCTGCACCCTGACTTCAAGAGGGCCCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGGGACCTGCCCCACCACTTCAACGCCTCCACCCAGCCCGCCTACCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101774 GGGGACCTGCCCCACCACTTCAACGCCTCCACCCAGCCCGCCTACCTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCTTATCTCCAACTACGGCACCCACTTCATCCGGGCTGTGGAGCTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101824 GCTTATCTCCAACTACGGCACCCACTTCATCCGGGCTGTGGAGCTGGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GCCGCATATCGGCCCTCACTGCCCTGCGCACCTGCGAGCTGGCCCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101874 GCCGCATATCGGCCCTCACTGCCCTGCGCACCTGCGAGCTGGCCCTGGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GGGCTCACGGACAACGAGGTGGAGGACTGCCTGACTGTCGAGGCCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101924 GGGCTCACGGACAACGAGGTGGAGGACTGCCTGACTGTCGAGGCCCAGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CAACATAGGCATCCACGGCAGCATCTCTGCCGAAGCCAAGGCCTGTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101974 CAACATAGGCATCCACGGCAGCATCTCTGCCGAAGCCAAGGCCTGTGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGAAGAAGAAGAAGCACAAGATGACGGCCTCCTTCCACCAAACCTACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102024 AGAAGAAGAAGAAGCACAAGATGACGGCCTCCTTCCACCAAACCTACCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GAGCGCCATTCGGAAGTGGTTGGCGGCCATCACACCTCCATTAACGACCT
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102074 GAGCGCCACTCGGAAGTGGTTGGCGGCCATCACACCTCCATTAACGACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GCTGTTCGGGATCCAGGCCGGGCCCGAGCAGTACTCAGCCTGGGTAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102124 GCTGTTCGGGATCCAGGCCGGGCCCGAGCAGTACTCAGCCTGGGTAAACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CGCTGCCCGGCAGCCCTGGCCTGGTGGACTACACCCTGGAACCCCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102174 CGCTGCCCGGCAGCCCTGGCCTGGTGGACTACACCCTGGAACCCCTGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GTGCTGCTGGACAGCCAGGACCCGCGGCGGGAGGCACTGAGGAGGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102224 GTGCTGCTGGACAGCCAGGACCCGCGGCGGGAGGCACTGAGGAGGGCCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GAGTCAGTACCTGACGGACAGGGCTCGCTGGAGGGACTGCAGCCGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102274 GAGTCAGTACCTGACGGACAGGGCTCGCTGGAGGGACTGCAGCCGGCCGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 GCCCACCAGGGCGGCAGAAGAGCCCCCGAGACCCATGCCAGTGTGTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102324 GCCCACCAGGGCGGCAGAAGAGCCCCCGAGACCCATGCCAGTGTGTGTGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 CATGGCTCAGCGGTCACCACCCAGGACTGCTGCCCTCGGCAGAGGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102374 CATGGCTCAGCGGTCACCACCCAGGACTGCTGCCCTCGGCAGAGGGGCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 GGCCCAGCTGGAGGTGACCTTCATCCAAGCATGGGGCCTGTGGGGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102424 GGCCCAGCTGGAGGTGACCTTCATCCAAGCATGGGGCCTGTGGGGGGACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 GGTTCACTGCCACGGATGCCTATGTGAAGCTCTTCTTTGGTGGCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102474 GGTTCACTGCCACGGATGCCTATGTGAAGCTCTTCTTTGGTGGCCAGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 CTGAGGACGAGCACCGTGTGGGACAATAACAACCCCATCTGGTCAGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102524 CTGAGGACGAGCACCGTGTGGGACAATAACAACCCCATCTGGTCAGTGCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 GCTGGATTTTGGGGATGTGCTCCTGGCCACAGGGGGGCCCCTGAGGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102574 GCTGGATTTTGGGGATGTGCTCCTGGCCACAGGGGGGCCCCTGAGGTTGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 AGGTCTGGGATCAGGACTCTGGCAGGGACGATGACCTCCTTGGCACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102624 AGGTCTGGGATCAGGACTCTGGCAGGGACGATGACCTCCTTGGCACCTGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 GATCAGGCTCCCAAGTCTGGTTCCCATGAGGTGAGATGCAACCTGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102674 GATCAGGCTCCCAAGTCTGGTTCCCATGAGGTGAGATGCAACCTGAATCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 TGGCCACCTAAAATTCCGCTATCATGCCAGGTGCTTGCCCCACCTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102724 TGGCCACCTAAAATTCCGCTATCATGCCAGGTGCTTGCCCCACCTGGGAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 GAGGCACCTGCCTGGACTATGTCCCCCAAATGCTTCTGGGGGAGCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102774 GAGGCACCTGCCTGGACTATGTCCCCCAAATGCTTCTGGGGGAGCCTCCA

   1650     .    :    .    :
   1642 GGAAACCGGAGTGGGGCCGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||
 102824 GGAAACCGGAGTGGGGCCGTGTGG