seq1 = pF1KE1957.tfa, 1536 bp
seq2 = pF1KE1957/gi568815582r_67875768.tfa (gi568815582r:67875768_68080455), 204688 bp

>pF1KE1957 1536
>gi568815582r:67875768_68080455 (Chr16)

(complement)

1-362  (100001-100362)   100% ->
363-489  (100691-100817)   100% ->
490-619  (101830-101959)   100% ->
620-761  (102048-102189)   100% ->
762-831  (102449-102518)   100% ->
832-1008  (102627-102803)   100% ->
1009-1090  (103105-103186)   100% ->
1091-1166  (103681-103756)   100% ->
1167-1302  (104228-104363)   100% ->
1303-1536  (104455-104688)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCCGGACCCCATTGTCGGCCTCTGCCCATCGCCTGCTCCTCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATCCGGACCCCATTGTCGGCCTCTGCCCATCGCCTGCTCCTCCCAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCCGCGGCCGACCCCCGCGCAACATGCAGCCCACGGGCCGCGAGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCCGCGGCCGACCCCCGCGCAACATGCAGCCCACGGGCCGCGAGGGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCGCGCGCTCAGCCGGCGGTATCTGCGGCGTCTGCTGCTCCTGCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCGCGCGCTCAGCCGGCGGTATCTGCGGCGTCTGCTGCTCCTGCTACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCTGCTGCTGCGGCAGCCCGTAACCCGCGCGGAGACCACGCCGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCTGCTGCTGCGGCAGCCCGTAACCCGCGCGGAGACCACGCCGGGCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCCAGAGCCCTCTCCACGCTGGGCTCCCCCAGCCTCTTCACCACGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCCAGAGCCCTCTCCACGCTGGGCTCCCCCAGCCTCTTCACCACGCCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTGTCCCCAGCGCCCTCACTACCCCAGGCCTCACTACGCCAGGCACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTGTCCCCAGCGCCCTCACTACCCCAGGCCTCACTACGCCAGGCACCCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAAACCCTGGACCTTCGGGGTCGCGCGCAGGCCCTGATGCGGAGTTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAAACCCTGGACCTTCGGGGTCGCGCGCAGGCCCTGATGCGGAGTTTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACTCGTGGACGG         CCACAATGACCTGCCCCAGGTCCTGAGAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACTCGTGGACGGGTA...CAGCCACAATGACCTGCCCCAGGTCCTGAGAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGCGTTACAAGAATGTGCTTCAGGATGTTAACCTGCGAAATTTCAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100720 AGCGTTACAAGAATGTGCTTCAGGATGTTAACCTGCGAAATTTCAGCCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GGTCAGACCAGCCTGGACAGGCTTAGAGACGGCCTCGTGGGTGCCCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100770 GGTCAGACCAGCCTGGACAGGCTTAGAGACGGCCTCGTGGGTGCCCAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    490        TTCTGGTCAGCCTCCGTCTCATGCCAGTCCCAGGACCAGACTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100820 A...CAGTTCTGGTCAGCCTCCGTCTCATGCCAGTCCCAGGACCAGACTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCGTGCGCCTCGCCCTGGAGCAGATTGACCTCATTCACCGCATGTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101873 CCGTGCGCCTCGCCCTGGAGCAGATTGACCTCATTCACCGCATGTGTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TCCTACTCTGAACTCGAGCTTGTGACCTCAGCTGAAG         GTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101923 TCCTACTCTGAACTCGAGCTTGTGACCTCAGCTGAAGGTG...TAGGTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAACAGCTCTCAAAAGCTGGCCTGCCTCATTGGCGTGGAGGGTGGTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102052 GAACAGCTCTCAAAAGCTGGCCTGCCTCATTGGCGTGGAGGGTGGTCACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CACTGGACAGCAGCCTCTCTGTGCTGCGCAGTTTCTATGTGCTGGGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102102 CACTGGACAGCAGCCTCTCTGTGCTGCGCAGTTTCTATGTGCTGGGGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CGCTACCTGACACTTACCTTCACCTGCAGTACACCATG         GGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 102152 CGCTACCTGACACTTACCTTCACCTGCAGTACACCATGGTG...CAGGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGAGAGTTCCACCAAGTTCAGACACCACATGTACACCAACGTCAGCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102452 AGAGAGTTCCACCAAGTTCAGACACCACATGTACACCAACGTCAGCGGAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGACAAGCTTTGGTGAG         AAAGTAGTAGAGGAGTTGAACCGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 102502 TGACAAGCTTTGGTGAGGTG...CAGAAAGTAGTAGAGGAGTTGAACCGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTGGGCATGATGATAGATTTGTCCTATGCATCGGACACCTTGATAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102651 CTGGGCATGATGATAGATTTGTCCTATGCATCGGACACCTTGATAAGAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGTCCTGGAAGTGTCTCAGGCTCCTGTGATCTTCTCCCACTCAGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102701 GGTCCTGGAAGTGTCTCAGGCTCCTGTGATCTTCTCCCACTCAGCTGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GAGCTGTGTGTGACAATTTGTTGAATGTTCCCGATGATATCCTGCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102751 GAGCTGTGTGTGACAATTTGTTGAATGTTCCCGATGATATCCTGCAGCTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTG         AAGAACGGTGGCATCGTGATGGTGACACTGTCCATGGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102801 CTGGTG...AAGAAGAACGGTGGCATCGTGATGGTGACACTGTCCATGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GGTGCTGCAGTGCAACCTGCTTGCTAACGTGTCCACTGTGGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103143 GGTGCTGCAGTGCAACCTGCTTGCTAACGTGTCCACTGTGGCAGGTA...

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1091    ATCACTTTGACCACATCAGGGCAGTCATTGGATCTGAGTTCATCGGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103678 TAGATCACTTTGACCACATCAGGGCAGTCATTGGATCTGAGTTCATCGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ATTGGTGGAAATTATGACGGGACTGGCCG         GTTCCCTCAGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 103728 ATTGGTGGAAATTATGACGGGACTGGCCGGTG...CAGGTTCCCTCAGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GCTGGAGGATGTGTCCACATACCCAGTCCTGATAGAGGAGTTGCTGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104240 GCTGGAGGATGTGTCCACATACCCAGTCCTGATAGAGGAGTTGCTGAGTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GTAGCTGGAGCGAGGAAGAGCTTCAAGGTGTCCTTCGTGGAAACCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104290 GTAGCTGGAGCGAGGAAGAGCTTCAAGGTGTCCTTCGTGGAAACCTGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CGGGTCTTCAGACAAGTGGAAAAG         GTGAGAGAGGAGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104340 CGGGTCTTCAGACAAGTGGAAAAGGTA...CAGGTGAGAGAGGAGAGCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GGCGCAGAGCCCCGTGGAGGCTGAGTTTCCATATGGGCAACTGAGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104472 GGCGCAGAGCCCCGTGGAGGCTGAGTTTCCATATGGGCAACTGAGCACAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CCTGCCACTCCCACCTCGTGCCTCAGAATGGACACCAGGCTACTCATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104522 CCTGCCACTCCCACCTCGTGCCTCAGAATGGACACCAGGCTACTCATCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GAGGTGACCAAGCAGCCAACCAATCGGGTCCCCTGGAGGTCCTCAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104572 GAGGTGACCAAGCAGCCAACCAATCGGGTCCCCTGGAGGTCCTCAAATGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CTCCCCATACCTTGTTCCAGGCCTTGTGGCTGCTGCCACCATCCCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104622 CTCCCCATACCTTGTTCCAGGCCTTGTGGCTGCTGCCACCATCCCAACCT

   1600     .    :    .
   1520 TCACCCAGTGGCTCTGC
        |||||||||||||||||
 104672 TCACCCAGTGGCTCTGC