seq1 = pF1KE1951.tfa, 1524 bp
seq2 = pF1KE1951/gi568815576r_30192378.tfa (gi568815576r:30192378_30426881), 234504 bp

>pF1KE1951 1524
>gi568815576r:30192378_30426881 (Chr22)

(complement)

1-209  (100001-100209)   100% ->
210-309  (122252-122351)   100% ->
310-417  (127331-127438)   100% ->
418-524  (131039-131145)   100% ->
525-639  (131827-131941)   100% ->
640-705  (132021-132086)   100% ->
706-895  (132772-132961)   100% ->
896-1050  (133077-133231)   100% ->
1051-1524  (134031-134504)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGAAGAGCAACGGAGAGAATGGGCCGCGCGCGCCCGCGGCCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGAAGAGCAACGGAGAGAATGGGCCGCGCGCGCCCGCGGCCGGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAGCCTGTCGGGAACCCGGGAGAGCCTGGCCCAGGGCCCCGACGCCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAGCCTGTCGGGAACCCGGGAGAGCCTGGCCCAGGGCCCCGACGCCGCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCACCGACGAACTCAGCTCTCTCGGGTCTGACTCGGAGGCCAACGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCACCGACGAACTCAGCTCTCTCGGGTCTGACTCGGAGGCCAACGGCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCGAGCGCCGCATCGACAAGTTCGGCTTCATCGTGGGCTCGCAGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCGAGCGCCGCATCGACAAGTTCGGCTTCATCGTGGGCTCGCAGGGCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGAGGGCGC         GCTGGAGGAAGTACCCCTGGAGGTGCTGAGGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGAGGGCGCGTG...CAGGCTGGAGGAAGTACCCCTGGAGGTGCTGAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGAGGGAGTCCAAGTGGCTGGACATGCTCAACAACTGGGACAAATGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122284 AGAGGGAGTCCAAGTGGCTGGACATGCTCAACAACTGGGACAAATGGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCAAGAAGCACAAAAAG         ATTCGTCTGCGGTGCCAAAAGGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 122334 GCCAAGAAGCACAAAAAGGTG...CAGATTCGTCTGCGGTGCCAAAAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATCCCGCCTTCTCTGCGGGGCCGTGCTTGGCAGTACCTGTCAGGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127354 CATCCCGCCTTCTCTGCGGGGCCGTGCTTGGCAGTACCTGTCAGGAGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGGTGAAGTTACAGCAGAACCCTGGAAAGTTTGAC         GAGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 127404 AGGTGAAGTTACAGCAGAACCCTGGAAAGTTTGACGTA...TAGGAGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GACATGTCCCCTGGGGACCCCAAGTGGCTGGACGTGATTGAGCGTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131045 GACATGTCCCCTGGGGACCCCAAGTGGCTGGACGTGATTGAGCGTGACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCACCGGCAGTTCCCATTCCATGAGATGTTTGTGTCCCGGGGGGGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131095 GCACCGGCAGTTCCCATTCCATGAGATGTTTGTGTCCCGGGGGGGCCACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 G         CCAGCAGGACCTATTCCGTGTGCTGAAGGCCTACACGCTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131145 GGTG...CAGCCAGCAGGACCTATTCCGTGTGCTGAAGGCCTACACGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TACCGGCCCGAGGAGGGCTACTGCCAGGCCCAGGCGCCCATTGCCGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131867 TACCGGCCCGAGGAGGGCTACTGCCAGGCCCAGGCGCCCATTGCCGCTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTTGCTCATGCATATGCCTGCTGAG         CAAGCCTTCTGGTGCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 131917 CTTGCTCATGCATATGCCTGCTGAGGTA...CAGCAAGCCTTCTGGTGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGTACAGATCTGTGAGAAGTACCTGCCCGGCTACTACAGCGAGAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132037 TGGTACAGATCTGTGAGAAGTACCTGCCCGGCTACTACAGCGAGAAACTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706          GAGGCGATCCAGCTGGACGGGGAGATCCTTTTCTCGCTGTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132087 GTG...TAGGAGGCGATCCAGCTGGACGGGGAGATCCTTTTCTCGCTGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCAGAAGGTGTCGCCGGTGGCCCACAAGCACCTCAGCCGTCAGAAGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132813 GCAGAAGGTGTCGCCGGTGGCCCACAAGCACCTCAGCCGTCAGAAGATCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACCCGCTCCTCTATATGACAGAATGGTTCATGTGCGCCTTCTCCCGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132863 ACCCGCTCCTCTATATGACAGAATGGTTCATGTGCGCCTTCTCCCGAACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTGCCCTGGAGCTCTGTGCTGCGTGTCTGGGACATGTTCTTCTGTGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 132913 TTGCCCTGGAGCTCTGTGCTGCGTGTCTGGGACATGTTCTTCTGTGAAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    896         GGGTCAAGATCATCTTCCGGGTGGGGCTGGTGCTGCTGAAGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132963 TA...CAGGGGTCAAGATCATCTTCCGGGTGGGGCTGGTGCTGCTGAAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ACGCGCTGGGCTCCCCTGAGAAGGTCAAAGCCTGCCAGGGCCAGTACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133119 ACGCGCTGGGCTCCCCTGAGAAGGTCAAAGCCTGCCAGGGCCAGTACGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACCATCGAGCGACTGCGGAGCCTCAGCCCCAAGATCATGCAGGAGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133169 ACCATCGAGCGACTGCGGAGCCTCAGCCCCAAGATCATGCAGGAGGCCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TCTGGTCCAGGAG         GTGGTGGAGTTGCCCGTGACAGAGCGCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 133219 TCTGGTCCAGGAGGTA...CAGGTGGTGGAGTTGCCCGTGACAGAGCGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGATTGAGCGCGAACACCTCATTCAGCTGCGGCGCTGGCAGGAGACCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134059 AGATTGAGCGCGAACACCTCATTCAGCTGCGGCGCTGGCAGGAGACCCGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GGTGAGCTGCAGTGCCGCTCCCCGCCCAGGCTGCATGGTGCCAAGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134109 GGTGAGCTGCAGTGCCGCTCCCCGCCCAGGCTGCATGGTGCCAAGGCTAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CTTGGATGCAGAACCTGGTCCCCGGCCTGCCCTACAACCTTCACCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134159 CTTGGATGCAGAACCTGGTCCCCGGCCTGCCCTACAACCTTCACCATCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TCCGCCTGCCCCTAGATGCCCCCCTCCCTGGCTCCAAAGCCAAGCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134209 TCCGCCTGCCCCTAGATGCCCCCCTCCCTGGCTCCAAAGCCAAGCCCAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CCACCCAAGCAGGCCCAGAAGGAGCAGCGGAAACAGATGAAGGGGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134259 CCACCCAAGCAGGCCCAGAAGGAGCAGCGGAAACAGATGAAGGGGAGAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GCAGCTGGAGAAGCCCCCAGCCCCAAATCAAGCCATGGTGGTGGCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134309 GCAGCTGGAGAAGCCCCCAGCCCCAAATCAAGCCATGGTGGTGGCCGCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CAGGAGATGCATGTCCCCCACAGCATGTGCCCCCGAAGGACTCAGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134359 CAGGAGATGCATGTCCCCCACAGCATGTGCCCCCGAAGGACTCAGCCCCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 AAGGACTCAGCCCCTCAGGATTTGGCTCCCCAGGTCTCAGCCCACCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134409 AAGGACTCAGCCCCTCAGGATTTGGCTCCCCAGGTCTCAGCCCACCACCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1479 CTCCCAGGAGAGCTTGACGTCCCAAGAGAGTGAGGACACCTACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134459 CTCCCAGGAGAGCTTGACGTCCCAAGAGAGTGAGGACACCTACTTG