seq1 = pF1KE1941.tfa, 1473 bp
seq2 = pF1KE1941/gi568815591r_106151086.tfa (gi568815591r:106151086_106384884), 233799 bp

>pF1KE1941 1473
>gi568815591r:106151086_106384884 (Chr7)

(complement)

1-57  (100001-100057)   100% ->
58-214  (107706-107862)   100% ->
215-318  (109836-109939)   100% ->
319-447  (112227-112355)   100% ->
448-606  (115573-115731)   100% ->
607-743  (116285-116421)   100% ->
744-969  (121268-121493)   100% ->
970-1089  (123178-123297)   100% ->
1090-1230  (130381-130521)   100% ->
1231-1365  (131734-131868)   100% ->
1366-1473  (133692-133799)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATCCTGCGGCAGAAGCCGAGTTCAACATCCTCCTGGCCACCGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATCCTGCGGCAGAAGCCGAGTTCAACATCCTCCTGGCCACCGACTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACAAG         GTTACTCACTATAAACAATATCCACCCAACACAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTACAAGGTA...TAGGTTACTCACTATAAACAATATCCACCCAACACAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCAAAGTTTATTCCTACTTTGAATGCCGTGAAAAGAAGACAGAAAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107740 GCAAAGTTTATTCCTACTTTGAATGCCGTGAAAAGAAGACAGAAAACTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAATTAAGGAAGGTGAAATATGAGGAAACAGTATTTTATGGGTTGCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107790 AAATTAAGGAAGGTGAAATATGAGGAAACAGTATTTTATGGGTTGCAGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATTCTTAATAAGTACTTAAAAG         GTAAAGTAGTAACCAAAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107840 CATTCTTAATAAGTACTTAAAAGGTA...TAGGTAAAGTAGTAACCAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAAAATCCAGGAAGCCAAAGATGTCTACAAAGAACATTTCCAAGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109854 AGAAAATCCAGGAAGCCAAAGATGTCTACAAAGAACATTTCCAAGATGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTCTTTAATGAAAAGGGATGGAACTACATTCTTGAG         AAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 109904 GTCTTTAATGAAAAGGGATGGAACTACATTCTTGAGGTA...CAGAAGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGATGGGCATCTTCCAATAGAAATAAAAGCTGTTCCTGAGGGCTTTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112232 TGATGGGCATCTTCCAATAGAAATAAAAGCTGTTCCTGAGGGCTTTGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTCCCAGAGGAAATGTTCTCTTCACGGTGGAAAACACAGATCCAGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112282 TTCCCAGAGGAAATGTTCTCTTCACGGTGGAAAACACAGATCCAGAGTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TACTGGCTTACAAATTGGATTGAG         ACTATTCTTGTTCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 112332 TACTGGCTTACAAATTGGATTGAGGTA...CAGACTATTCTTGTTCAGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTGGTATCCAATCACAGTGGCCACAAATTCTAGAGAGCAGAAGAAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115590 CTGGTATCCAATCACAGTGGCCACAAATTCTAGAGAGCAGAAGAAAATAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGCCAAATATTTGTTAGAAACTTCTGGTAACTTAGATGGTCTGGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115640 TGGCCAAATATTTGTTAGAAACTTCTGGTAACTTAGATGGTCTGGAATAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAGTTACATGATTTTGGCTACAGAGGAGTCTCTTCCCAAGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 115690 AAGTTACATGATTTTGGCTACAGAGGAGTCTCTTCCCAAGAGGTA...CA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    607  ACTGCTGGCATAGGAGCATCTGCTCACTTGGTTAACTTCAAAGGAACAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116284 GACTGCTGGCATAGGAGCATCTGCTCACTTGGTTAACTTCAAAGGAACAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATACAGTAGCAGGACTTGCTCTAATTAAAAAATATTATGGAACGAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116334 ATACAGTAGCAGGACTTGCTCTAATTAAAAAATATTATGGAACGAAAGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CCTGTTCCAGGCTATTCTGTTCCAGCAGCAGAACACAG         TAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 116384 CCTGTTCCAGGCTATTCTGTTCCAGCAGCAGAACACAGGTA...TAGTAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CATAACAGCTTGGGGGAAAGACCATGAAAAAGATGCTTTTGAACATATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121271 CATAACAGCTTGGGGGAAAGACCATGAAAAAGATGCTTTTGAACATATTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TAACACAGTTTTCATCAGTGCCTGTATCTGTGGTCAGCGATAGCTATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121321 TAACACAGTTTTCATCAGTGCCTGTATCTGTGGTCAGCGATAGCTATGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ATTTATAATGCGTGTGAGAAAATATGGGGTGAAGATCTAAGACATTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121371 ATTTATAATGCGTGTGAGAAAATATGGGGTGAAGATCTAAGACATTTAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGTATCAAGAAGTACACAGGCACCACTAATAATCAGACCTGATTCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121421 AGTATCAAGAAGTACACAGGCACCACTAATAATCAGACCTGATTCTGGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ACCCTCTTGACACTGTGTTAAAG         GTTTTGGAGATTTTAGGT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 121471 ACCCTCTTGACACTGTGTTAAAGGTA...TAGGTTTTGGAGATTTTAGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AAGAAGTTTCCTGTTACTGAGAACTCAAAGGGTTACAAGTTGCTGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123196 AAGAAGTTTCCTGTTACTGAGAACTCAAAGGGTTACAAGTTGCTGCCACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TTATCTTAGAGTTATTCAAGGGGATGGAGTAGATATTAATACCTTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123246 TTATCTTAGAGTTATTCAAGGGGATGGAGTAGATATTAATACCTTACAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AG         ATTGTAGAAGGCATGAAACAAAAAATGTGGAGTATTGAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123296 AGGTA...TAGATTGTAGAAGGCATGAAACAAAAAATGTGGAGTATTGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AATATTGCCTTCGGTTCTGGTGGAGGTTTGCTACAGAAGTTGACAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130420 AATATTGCCTTCGGTTCTGGTGGAGGTTTGCTACAGAAGTTGACAAGAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TCTCTTGAATTGTTCCTTCAAGTGTAGCTATGTTGTAACTAATGGCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130470 TCTCTTGAATTGTTCCTTCAAGTGTAGCTATGTTGTAACTAATGGCCTTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GG         ATTAACGTCTTCAAGGACCCAGTTGCTGATCCCAACAAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130520 GGGTA...CAGATTAACGTCTTCAAGGACCCAGTTGCTGATCCCAACAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AGGTCCAAAAAGGGCCGATTATCTTTACATAGGACGCCAGCAGGGAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131773 AGGTCCAAAAAGGGCCGATTATCTTTACATAGGACGCCAGCAGGGAATTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TGTTACACTGGAGGAAGGAAAAGGAGACCTTGAGGAATATGGTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 131823 TGTTACACTGGAGGAAGGAAAAGGAGACCTTGAGGAATATGGTCAGGTA.

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1366      GATCTTCTCCATACTGTCTTCAAGAATGGCAAGGTGACAAAAAGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131873 ..CAGGATCTTCTCCATACTGTCTTCAAGAATGGCAAGGTGACAAAAAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TATTCATTTGATGAAATAAGAAAAAATGCACAGCTGAATATTGAACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133737 TATTCATTTGATGAAATAAGAAAAAATGCACAGCTGAATATTGAACTGGA

   1550     .    :
   1461 AGCAGCACATCAT
        |||||||||||||
 133787 AGCAGCACATCAT