seq1 = pF1KE1929.tfa, 1401 bp seq2 = pF1KE1929/gi568815597f_18008129.tfa (gi568815597f:18008129_18478323), 470195 bp >pF1KE1929 1401 >gi568815597f:18008129_18478323 (Chr1) 70-183 (219769-219882) 100% -> 184-305 (283738-283859) 100% -> 306-424 (326764-326882) 100% -> 425-540 (353987-354102) 100% -> 541-1015 (357095-357569) 100% -> 1016-1101 (368182-368267) 100% -> 1102-1294 (368672-368864) 100% -> 1295-1333 (369265-369303) 100% -> 1334-1401 (370128-370195) 100% 0 . : . : . : . : . : 70 GGCTACCTGACAGTCAACATTGAGCCTCTCCCCCCTGTGGTGGCTGGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 219769 GGCTACCTGACAGTCAACATTGAGCCTCTCCCCCCTGTGGTGGCTGGAGA 50 . : . : . : . : . : 120 CGCCGTGACTTTGAAGTGTAACTTCAAGACAGATGGGCGCATGCGGGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 219819 CGCCGTGACTTTGAAGTGTAACTTCAAGACAGATGGGCGCATGCGGGAGA 100 . : . : . : . : . : 170 TCGTGTGGTACCGG GTGACGGATGGTGGCACCATCAAGCAA ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 219869 TCGTGTGGTACCGGGTA...CAGGTGACGGATGGTGGCACCATCAAGCAA 150 . : . : . : . : . : 211 AAGATCTTCACCTTCGACGCCATGTTCTCCACCAACTACTCACACATGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 283765 AAGATCTTCACCTTCGACGCCATGTTCTCCACCAACTACTCACACATGGA 200 . : . : . : . : . : 261 GAACTACCGCAAGCGAGAGGACCTGGTGTACCAGTCCACTGTGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 283815 GAACTACCGCAAGCGAGAGGACCTGGTGTACCAGTCCACTGTGAGGTG.. 250 . : . : . : . : . : 306 GCTGCCCGAGGTCCGGATCTCAGACAATGGTCCCTATGAGTGCCAT .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 283865 .CAGGCTGCCCGAGGTCCGGATCTCAGACAATGGTCCCTATGAGTGCCAT 300 . : . : . : . : . : 352 GTGGGCATCTACGACCGCGCCACCAGGGAGAAGGTGGTCCTGGCATCAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 326810 GTGGGCATCTACGACCGCGCCACCAGGGAGAAGGTGGTCCTGGCATCAGG 350 . : . : . : . : . : 402 CAACATCTTCCTCAACGTCATGG CTCCTCCCACCTCCATTG |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 326860 CAACATCTTCCTCAACGTCATGGGTG...CAGCTCCTCCCACCTCCATTG 400 . : . : . : . : . : 443 AAGTGGTGGCTGCTGACACACCAGCCCCCTTCAGCCGCTACCAAGCCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 354005 AAGTGGTGGCTGCTGACACACCAGCCCCCTTCAGCCGCTACCAAGCCCAG 450 . : . : . : . : . : 493 AACTTCACGCTGGTCTGCATCGTGTCTGGAGGAAAACCAGCACCCATG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 354055 AACTTCACGCTGGTCTGCATCGTGTCTGGAGGAAAACCAGCACCCATGGT 500 . : . : . : . : . : 541 GTTTATTTCAAACGAGATGGGGAACCAATCGACGCAGTGCCCC >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 354105 G...CAGGTTTATTTCAAACGAGATGGGGAACCAATCGACGCAGTGCCCC 550 . : . : . : . : . : 584 TATCAGAGCCACCAGCTGCGAGCTCCGGCCCCCTACAGGACAGCAGGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 357138 TATCAGAGCCACCAGCTGCGAGCTCCGGCCCCCTACAGGACAGCAGGCCC 600 . : . : . : . : . : 634 TTCCGCAGCCTTCTGCACCGTGACCTGGATGACACCAAGATGCAGAAGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 357188 TTCCGCAGCCTTCTGCACCGTGACCTGGATGACACCAAGATGCAGAAGTC 650 . : . : . : . : . : 684 ACTGTCCCTCCTGGACGCCGAGAACCGGGGTGGGCGACCCTACACGGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 357238 ACTGTCCCTCCTGGACGCCGAGAACCGGGGTGGGCGACCCTACACGGAGC 700 . : . : . : . : . : 734 GCCCCTCCCGTGGCCTGACCCCAGATCCCAACATCCTCCTCCAGCCAACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 357288 GCCCCTCCCGTGGCCTGACCCCAGATCCCAACATCCTCCTCCAGCCAACC 750 . : . : . : . : . : 784 ACAGAGAACATACCAGAGACGGTCGTGAGCCGTGAGTTTCCCCGCTGGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 357338 ACAGAGAACATACCAGAGACGGTCGTGAGCCGTGAGTTTCCCCGCTGGGT 800 . : . : . : . : . : 834 CCACAGCGCCGAGCCCACCTACTTCCTGCGCCACAGCCGCACCCCGAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 357388 CCACAGCGCCGAGCCCACCTACTTCCTGCGCCACAGCCGCACCCCGAGCA 850 . : . : . : . : . : 884 GTGACGGCACTGTGGAAGTACGTGCCCTGCTCACCTGGACCCTCAACCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 357438 GTGACGGCACTGTGGAAGTACGTGCCCTGCTCACCTGGACCCTCAACCCA 900 . : . : . : . : . : 934 CAGATCGACAACGAGGCCCTCTTCAGCTGCGAGGTCAAGCACCCAGCTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 357488 CAGATCGACAACGAGGCCCTCTTCAGCTGCGAGGTCAAGCACCCAGCTCT 950 . : . : . : . : . : 984 GTCGATGCCCATGCAGGCAGAGGTCACGCTGG TTGCCCCCA ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 357538 GTCGATGCCCATGCAGGCAGAGGTCACGCTGGGTA...CAGTTGCCCCCA 1000 . : . : . : . : . : 1025 AAGGACCCAAAATTGTGATGACGCCCAGCAGAGCCCGGGTAGGGGACACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 368191 AAGGACCCAAAATTGTGATGACGCCCAGCAGAGCCCGGGTAGGGGACACA 1050 . : . : . : . : . : 1075 GTGAGGATTCTGGTCCATGGGTTTCAG AACGAAGTCTTCCC |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 368241 GTGAGGATTCTGGTCCATGGGTTTCAGGTC...CAGAACGAAGTCTTCCC 1100 . : . : . : . : . : 1116 GGAGCCCATGTTCACGTGGACGCGGGTTGGGAGCCGCCTCCTGGACGGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 368686 GGAGCCCATGTTCACGTGGACGCGGGTTGGGAGCCGCCTCCTGGACGGCA 1150 . : . : . : . : . : 1166 GCGCTGAGTTCGACGGGAAGGAGCTGGTGCTGGAGCGGGTTCCCGCCGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 368736 GCGCTGAGTTCGACGGGAAGGAGCTGGTGCTGGAGCGGGTTCCCGCCGAG 1200 . : . : . : . : . : 1216 CTCAATGGCTCCATGTATCGCTGCACCGCCCAGAACCCACTGGGCTCCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 368786 CTCAATGGCTCCATGTATCGCTGCACCGCCCAGAACCCACTGGGCTCCAC 1250 . : . : . : . : . : 1266 CGACACGCACACCCGGCTCATCGTGTTTG AAAACCCAAATA |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 368836 CGACACGCACACCCGGCTCATCGTGTTTGGTA...CAGAAAACCCAAATA 1300 . : . : . : . : . : 1307 TCCCAAGAGGAACGGAGGACTCTAATG GTTCCATTGGCCCC |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 369277 TCCCAAGAGGAACGGAGGACTCTAATGGTA...CAGGTTCCATTGGCCCC 1350 . : . : . : . : . : 1348 ACTGGTGCCCGGCTCACCTTGGTGCTCGCCCTGACAGTGATTCTGGAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 370142 ACTGGTGCCCGGCTCACCTTGGTGCTCGCCCTGACAGTGATTCTGGAGCT 1400 1398 GACG |||| 370192 GACG