seq1 = pF1KE1898.tfa, 2472 bp
seq2 = pF1KE1898/gi568815596r_9390180.tfa (gi568815596r:9390180_9655605), 265426 bp

>pF1KE1898 2472
>gi568815596r:9390180_9655605 (Chr2)

(complement)

1-97  (100001-100097)   100% ->
98-230  (112321-112453)   100% ->
231-361  (118778-118908)   100% ->
362-450  (119684-119772)   100% ->
451-619  (127652-127820)   100% ->
620-753  (129362-129495)   100% ->
754-843  (132268-132357)   100% ->
844-957  (134290-134403)   100% ->
958-1102  (137359-137503)   100% ->
1103-1191  (137617-137705)   100% ->
1192-1344  (145475-145627)   100% ->
1345-1544  (150241-150440)   100% ->
1545-1648  (153330-153433)   100% ->
1649-1783  (158358-158492)   100% ->
1784-1914  (160839-160969)   100% ->
1915-1993  (161781-161859)   100% ->
1994-2082  (162620-162708)   100% ->
2083-2133  (164455-164505)   100% ->
2134-2472  (165088-165426)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGCAGTCTCTCCTATTCCTGACCAGCGTGGTTCCTTTCGTGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGCAGTCTCTCCTATTCCTGACCAGCGTGGTTCCTTTCGTGCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGCGACCTCCGGATGACCCGGGCTTCGGCCCCCACCAGAGACTCG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100051 GCCGCGACCTCCGGATGACCCGGGCTTCGGCCCCCACCAGAGACTCGGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     98       AGAAGCTTGATTCTTTGCTCTCAGACTACGATATTCTCTCTTTA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ...CAGAGAAGCTTGATTCTTTGCTCTCAGACTACGATATTCTCTCTTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCTAATATCCAGCAGCATTCGGTAAGAAAAAGAGATCTACAGACTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112365 TCTAATATCCAGCAGCATTCGGTAAGAAAAAGAGATCTACAGACTTCAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACATGTAGAAACACTACTAACTTTTTCAGCTTTGAAAAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 112415 ACATGTAGAAACACTACTAACTTTTTCAGCTTTGAAAAGGTA...CAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATTTTAAATTATACCTGACATCAAGTACTGAACGTTTTTCACAAAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118780 ATTTTAAATTATACCTGACATCAAGTACTGAACGTTTTTCACAAAATTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGGTCGTGGTGGTGGATGGTAAAAACGAAAGCGAGTACACTGTAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118830 AAGGTCGTGGTGGTGGATGGTAAAAACGAAAGCGAGTACACTGTAAAATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCAGGACTTCTTCACTGGACACGTGGTTG         GTGAGCCTGACT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 118880 GCAGGACTTCTTCACTGGACACGTGGTTGGTT...AAGGTGAGCCTGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTAGGGTTCTAGCCCACATAAGAGATGATGATGTTATAATCAGAATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119696 CTAGGGTTCTAGCCCACATAAGAGATGATGATGTTATAATCAGAATCAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACAGATGGGGCCGAATATAACATAGAG         CCACTTTGGAGATT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 119746 ACAGATGGGGCCGAATATAACATAGAGGTA...TAGCCACTTTGGAGATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGTTAATGATACCAAAGACAAAAGAATGTTAGTTTATAAATCTGAAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127666 TGTTAATGATACCAAAGACAAAAGAATGTTAGTTTATAAATCTGAAGATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCAAGAATGTTTCACGTTTGCAGTCTCCAAAAGTGTGTGGTTATTTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127716 TCAAGAATGTTTCACGTTTGCAGTCTCCAAAAGTGTGTGGTTATTTAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTGGATAATGAAGAGTTGCTCCCAAAAGGGTTAGTAGACAGAGAACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127766 GTGGATAATGAAGAGTTGCTCCCAAAAGGGTTAGTAGACAGAGAACCACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGAAG         AGCTTGTTCATCGAGTGAAAAGAAGAGCTGACCCAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127816 TGAAGGTA...TAGAGCTTGTTCATCGAGTGAAAAGAAGAGCTGACCCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATCCCATGAAGAACACGTGTAAATTATTGGTGGTAGCAGATCATCGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129398 ATCCCATGAAGAACACGTGTAAATTATTGGTGGTAGCAGATCATCGCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TACAGATACATGGGCAGAGGGGAAGAGAGTACAACTACAAATTACTTA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 129448 TACAGATACATGGGCAGAGGGGAAGAGAGTACAACTACAAATTACTTAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    754        ATAGAGCTAATTGACAGAGTTGATGACATCTATCGGAACACTT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129498 A...CAGATAGAGCTAATTGACAGAGTTGATGACATCTATCGGAACACTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CATGGGATAATGCAGGTTTTAAAGGCTATGGAATACAGATAGAGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 132311 CATGGGATAATGCAGGTTTTAAAGGCTATGGAATACAGATAGAGCAGGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    844       ATTCGCATTCTCAAGTCTCCACAAGAGGTAAAACCTGGTGAAAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132361 ...TAGATTCGCATTCTCAAGTCTCCACAAGAGGTAAAACCTGGTGAAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GCACTACAACATGGCAAAAAGTTACCCAAATGAAGAAAAGGATGCTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134334 GCACTACAACATGGCAAAAAGTTACCCAAATGAAGAAAAGGATGCTTGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ATGTGAAGATGTTGCTAGAG         CAATTTAGCTTTGATATAGCT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 134384 ATGTGAAGATGTTGCTAGAGGTA...AAGCAATTTAGCTTTGATATAGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAGGAAGCATCTAAAGTTTGCTTGGCACACCTTTTCACATACCAAGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137380 GAGGAAGCATCTAAAGTTTGCTTGGCACACCTTTTCACATACCAAGATTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TGATATGGGAACTCTTGGATTAGCTTATGTTGGCTCTCCCAGAGCAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137430 TGATATGGGAACTCTTGGATTAGCTTATGTTGGCTCTCCCAGAGCAAACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GCCATGGAGGTGTTTGTCCAAAGG         CTTATTATAGCCCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 137480 GCCATGGAGGTGTTTGTCCAAAGGGTA...TAGCTTATTATAGCCCAGTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GGGAAGAAAAATATCTATTTGAATAGTGGTTTGACGAGCACAAAGAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137634 GGGAAGAAAAATATCTATTTGAATAGTGGTTTGACGAGCACAAAGAATTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGGTAAAACCATCCTTACAAAG         GAAGCTGACCTGGTTACAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 137684 TGGTAAAACCATCCTTACAAAGGTA...AAGGAAGCTGACCTGGTTACAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CTCATGAATTGGGACATAATTTTGGAGCAGAACATGATCCGGATGGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145494 CTCATGAATTGGGACATAATTTTGGAGCAGAACATGATCCGGATGGTCTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GCAGAATGTGCCCCGAATGAGGACCAGGGAGGGAAATATGTCATGTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145544 GCAGAATGTGCCCCGAATGAGGACCAGGGAGGGAAATATGTCATGTATCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CATAGCTGTGAGTGGCGATCACGAGAACAATAAG         ATGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 145594 CATAGCTGTGAGTGGCGATCACGAGAACAATAAGGTA...AAGATGTTTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CAAACTGCAGTAAACAATCAATCTATAAGACCATTGAAAGTAAGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150248 CAAACTGCAGTAAACAATCAATCTATAAGACCATTGAAAGTAAGGCCCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GAGTGTTTTCAAGAACGCAGCAATAAAGTTTGTGGGAACTCGAGGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150298 GAGTGTTTTCAAGAACGCAGCAATAAAGTTTGTGGGAACTCGAGGGTGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TGAAGGAGAAGAGTGTGATCCTGGCATCATGTATCTGAACAACGACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150348 TGAAGGAGAAGAGTGTGATCCTGGCATCATGTATCTGAACAACGACACCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 GCTGCAACAGCGACTGCACGTTGAAGGAAGGTGTCCAGTGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 150398 GCTGCAACAGCGACTGCACGTTGAAGGAAGGTGTCCAGTGCAGGTG...C

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1545   TGACAGGAACAGTCCTTGCTGTAAAAACTGTCAGTTTGAGACTGCCCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153328 AGTGACAGGAACAGTCCTTGCTGTAAAAACTGTCAGTTTGAGACTGCCCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GAAGAAGTGCCAGGAGGCGATTAATGCTACTTGCAAAGGCGTGTCCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153378 GAAGAAGTGCCAGGAGGCGATTAATGCTACTTGCAAAGGCGTGTCCTACT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 GCACAG         GTAATAGCAGTGAGTGCCCGCCTCCAGGAAATGCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153428 GCACAGGTT...CAGGTAATAGCAGTGAGTGCCCGCCTCCAGGAAATGCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GAAGATGACACTGTTTGCTTGGATCTTGGCAAGTGTAAGGATGGGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158393 GAAGATGACACTGTTTGCTTGGATCTTGGCAAGTGTAAGGATGGGAAATG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CATCCCTTTCTGCGAGAGGGAACAGCAGCTGGAGTCCTGTGCATGTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158443 CATCCCTTTCTGCGAGAGGGAACAGCAGCTGGAGTCCTGTGCATGTAATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784          AAACTGACAACTCCTGCAAGGTGTGCTGCAGGGACCTTTCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158493 GTG...CAGAAACTGACAACTCCTGCAAGGTGTGCTGCAGGGACCTTTCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 GGCCGCTGTGTGCCCTATGTCGATGCTGAACAAAAGAACTTATTTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160880 GGCCGCTGTGTGCCCTATGTCGATGCTGAACAAAAGAACTTATTTTTGAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GAAAGGAAAGCCCTGTACAGTAGGATTTTGTGACATGAAT         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 160930 GAAAGGAAAGCCCTGTACAGTAGGATTTTGTGACATGAATGTG...TAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 GCAAATGTGAGAAACGAGTACAGGATGTAATTGAACGATTTTGGGATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161782 GCAAATGTGAGAAACGAGTACAGGATGTAATTGAACGATTTTGGGATTTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 ATTGACCAGCTGAGCATCAATACTTTTG         GAAAGTTTTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 161832 ATTGACCAGCTGAGCATCAATACTTTTGGTA...CAGGAAAGTTTTTAGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 AGACAACATCGTTGGGTCTGTCCTGGTTTTCTCCTTGATATTTTGGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162633 AGACAACATCGTTGGGTCTGTCCTGGTTTTCTCCTTGATATTTTGGATTC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 CTTTCAGCATTCTTGTCCATTGTGTG         GATAAGAAATTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 162683 CTTTCAGCATTCTTGTCCATTGTGTGGTA...TAGGATAAGAAATTGGAT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 AAACAGTATGAATCTCTGTCTCTGTTTCACCCCAGT         AACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 164470 AAACAGTATGAATCTCTGTCTCTGTTTCACCCCAGTGTA...CAGAACGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 CGAAATGCTGAGCAGCATGGATTCTGCATCGGTTCGCATTATCAAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165093 CGAAATGCTGAGCAGCATGGATTCTGCATCGGTTCGCATTATCAAACCCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 TTCCTGCGCCCCAGACTCCAGGCCGCCTGCAGCCTGCCCCTGTGATCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165143 TTCCTGCGCCCCAGACTCCAGGCCGCCTGCAGCCTGCCCCTGTGATCCCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 TCGGCGCCAGCAGCTCCAAAACTGGACCACCAGAGAATGGACACCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165193 TCGGCGCCAGCAGCTCCAAAACTGGACCACCAGAGAATGGACACCATCCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 GGAAGACCCCAGCACAGACTCACATATGGACGAGGATGGGTTTGAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165243 GGAAGACCCCAGCACAGACTCACATATGGACGAGGATGGGTTTGAGAAGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 ACCCCTTCCCAAATAGCAGCACAGCTGCCAAGTCATTTGAGGATCTCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165293 ACCCCTTCCCAAATAGCAGCACAGCTGCCAAGTCATTTGAGGATCTCACG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 GACCATCCGGTCACCAGAAGTGAAAAGGCTGCCTCCTTTAAACTGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165343 GACCATCCGGTCACCAGAAGTGAAAAGGCTGCCTCCTTTAAACTGCAGCG

   2600     .    :    .    :    .    :
   2439 TCAGAATCGTGTTGACAGCAAAGAAACAGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165393 TCAGAATCGTGTTGACAGCAAAGAAACAGAGTGC