seq1 = pF1KE1886.tfa, 1236 bp
seq2 = pF1KE1886/gi568815584r_75859190.tfa (gi568815584r:75859190_76080893), 221704 bp

>pF1KE1886 1236
>gi568815584r:75859190_76080893 (Chr14)

(complement)

1-352  (100001-100352)   100% ->
353-516  (109176-109339)   100% ->
517-646  (109639-109768)   100% ->
647-754  (115199-115306)   100% ->
755-926  (117407-117578)   100% ->
927-1080  (119818-119971)   100% ->
1081-1236  (121549-121704)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGATGCACTTGCAAAGGGCTCTGGTGGTCCTGGCCCTGCTGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGATGCACTTGCAAAGGGCTCTGGTGGTCCTGGCCCTGCTGAACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCACGGTCAGCCTCTCTCTGTCCACTTGCACCACCTTGGACTTCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCCACGGTCAGCCTCTCTCTGTCCACTTGCACCACCTTGGACTTCGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACATCAAGAAGAAGAGGGTGGAAGCCATTAGGGGACAGATCTTGAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACATCAAGAAGAAGAGGGTGGAAGCCATTAGGGGACAGATCTTGAGCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCAGGCTCACCAGCCCCCCTGAGCCAACGGTGATGACCCACGTCCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCAGGCTCACCAGCCCCCCTGAGCCAACGGTGATGACCCACGTCCCCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCAGGTCCTGGCCCTTTACAACAGCACCCGGGAGCTGCTGGAGGAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCAGGTCCTGGCCCTTTACAACAGCACCCGGGAGCTGCTGGAGGAGATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGGGGAGAGGGAGGAAGGCTGCACCCAGGAAAACACCGAGTCGGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGGGGAGAGGGAGGAAGGCTGCACCCAGGAAAACACCGAGTCGGAATAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TATGCCAAAGAAATCCATAAATTCGACATGATCCAGGGGCTGGCGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TATGCCAAAGAAATCCATAAATTCGACATGATCCAGGGGCTGGCGGAGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CA         ACGAACTGGCTGTCTGCCCTAAAGGAATTACCTCCAAGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGTA...TAGACGAACTGGCTGTCTGCCCTAAAGGAATTACCTCCAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTTTCCGCTTCAATGTGTCCTCAGTGGAGAAAAATAGAACCAACCTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109215 TTTTCCGCTTCAATGTGTCCTCAGTGGAGAAAAATAGAACCAACCTATTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CGAGCAGAATTCCGGGTCTTGCGGGTGCCCAACCCCAGCTCTAAGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109265 CGAGCAGAATTCCGGGTCTTGCGGGTGCCCAACCCCAGCTCTAAGCGGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGAGCAGAGGATCGAGCTCTTCCAG         ATCCTTCGGCCAGATG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 109315 TGAGCAGAGGATCGAGCTCTTCCAGGTA...TAGATCCTTCGGCCAGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGCACATTGCCAAACAGCGCTATATCGGTGGCAAGAATCTGCCCACACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109655 AGCACATTGCCAAACAGCGCTATATCGGTGGCAAGAATCTGCCCACACGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGCACTGCCGAGTGGCTGTCCTTTGATGTCACTGACACTGTGCGTGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109705 GGCACTGCCGAGTGGCTGTCCTTTGATGTCACTGACACTGTGCGTGAGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCTGTTGAGAAGAG         AGTCCAACTTAGGTCTAGAAATCAGCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 109755 GCTGTTGAGAAGAGGTA...CAGAGTCCAACTTAGGTCTAGAAATCAGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TTCACTGTCCATGTCACACCTTTCAGCCCAATGGAGATATCCTGGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115226 TTCACTGTCCATGTCACACCTTTCAGCCCAATGGAGATATCCTGGAAAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ATTCACGAGGTGATGGAAATCAAATTCAAAG         GCGTGGACAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 115276 ATTCACGAGGTGATGGAAATCAAATTCAAAGGTA...CAGGCGTGGACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGAGGATGACCATGGCCGTGGAGATCTGGGGCGCCTCAAGAAGCAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117417 TGAGGATGACCATGGCCGTGGAGATCTGGGGCGCCTCAAGAAGCAGAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATCACCACAACCCTCATCTAATCCTCATGATGATTCCCCCACACCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117467 ATCACCACAACCCTCATCTAATCCTCATGATGATTCCCCCACACCGGCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GACAACCCGGGCCAGGGGGGTCAGAGGAAGAAGCGGGCTTTGGACACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117517 GACAACCCGGGCCAGGGGGGTCAGAGGAAGAAGCGGGCTTTGGACACCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TTACTGCTTCCG         CAACTTGGAGGAGAACTGCTGTGTGCGCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 117567 TTACTGCTTCCGGTG...TAGCAACTTGGAGGAGAACTGCTGTGTGCGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCCTCTACATTGACTTCCGACAGGATCTGGGCTGGAAGTGGGTCCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119847 CCCTCTACATTGACTTCCGACAGGATCTGGGCTGGAAGTGGGTCCATGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CCTAAGGGCTACTATGCCAACTTCTGCTCAGGCCCTTGCCCATACCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119897 CCTAAGGGCTACTATGCCAACTTCTGCTCAGGCCCTTGCCCATACCTCCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CAGTGCAGACACAACCCACAGCACG         GTGCTGGGACTGTACA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 119947 CAGTGCAGACACAACCCACAGCACGGTA...CAGGTGCTGGGACTGTACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 ACACTCTGAACCCTGAAGCATCTGCCTCGCCTTGCTGCGTGCCCCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121565 ACACTCTGAACCCTGAAGCATCTGCCTCGCCTTGCTGCGTGCCCCAGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CTGGAGCCCCTGACCATCCTGTACTATGTTGGGAGGACCCCCAAAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121615 CTGGAGCCCCTGACCATCCTGTACTATGTTGGGAGGACCCCCAAAGTGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GCAGCTCTCCAACATGGTGGTGAAGTCTTGTAAATGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121665 GCAGCTCTCCAACATGGTGGTGAAGTCTTGTAAATGTAGC