seq1 = pF1KE1885.tfa, 1233 bp
seq2 = pF1KE1885/gi568815591r_30553463.tfa (gi568815591r:30553463_30782280), 228818 bp

>pF1KE1885 1233
>gi568815591r:30553463_30782280 (Chr7)

(complement)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-229  (100241-100366)   100% ->
230-315  (114968-115053)   100% ->
316-425  (116642-116751)   100% ->
426-543  (117094-117211)   100% ->
544-697  (119434-119587)   100% ->
698-758  (120065-120125)   100% ->
759-831  (121636-121708)   100% ->
832-917  (126269-126354)   100% ->
918-1053  (126566-126701)   100% ->
1054-1095  (127201-127242)   100% ->
1096-1233  (128681-128818)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGCGGCACTGCTCCACAGCCTGCTGGAGGCCAACTGCAGCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGCGGCACTGCTCCACAGCCTGCTGGAGGCCAACTGCAGCCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGCTGAAGAGCTGCTCTTGGACGGCTGGGGGCCACCCCTGGACCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGCTGAAGAGCTGCTCTTGGACGGCTGGGGGCCACCCCTGGACCCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGG         GTCCCTACTCCTACTGCAACACGACCTTGGACCAGATC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGGTA...CAGGTCCCTACTCCTACTGCAACACGACCTTGGACCAGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGAACGTGCTGGCCCCGCAGCGCTGCCGGAGCCCTCGTGGAGAGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100279 GGAACGTGCTGGCCCCGCAGCGCTGCCGGAGCCCTCGTGGAGAGGCCGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCCGAGTACTTCAACGGCGTCAAGTACAACACGACCC         GGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100329 CCCCGAGTACTTCAACGGCGTCAAGTACAACACGACCCGTG...TAGGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGCCTATCGAGAATGCTTGGAGAATGGGACGTGGGCCTCAAAGATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114971 ATGCCTATCGAGAATGCTTGGAGAATGGGACGTGGGCCTCAAAGATCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACTCACAGTGTGAGCCCATTTTGGATGACAAG         CAGAGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 115021 TACTCACAGTGTGAGCCCATTTTGGATGACAAGGTG...CAGCAGAGGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTATGACCTGCACTACCGCATCGCCCTTGTCGTCAACTACCTGGGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116650 GTATGACCTGCACTACCGCATCGCCCTTGTCGTCAACTACCTGGGCCACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCGTATCTGTGGCAGCCCTGGTGGCCGCCTTCCTGCTTTTCCTGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116700 GCGTATCTGTGGCAGCCCTGGTGGCCGCCTTCCTGCTTTTCCTGGCCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CG         GAGCATTCGCTGTCTGCGGAATGTGATTCACTGGAACCT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116750 CGGTG...CAGGAGCATTCGCTGTCTGCGGAATGTGATTCACTGGAACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CATCACCACCTTTATCCTGCGAAATGTCATGTGGTTCCTGCTGCAGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117133 CATCACCACCTTTATCCTGCGAAATGTCATGTGGTTCCTGCTGCAGCTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTGACCATGAAGTGCACGAGAGCAATGAG         GTCTGGTGCCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 117183 TTGACCATGAAGTGCACGAGAGCAATGAGGTC...CAGGTCTGGTGCCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TGCATCACCACCATCTTCAACTACTTCGTGGTGACCAACTTCTTCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119446 TGCATCACCACCATCTTCAACTACTTCGTGGTGACCAACTTCTTCTGGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTTTGTGGAAGGCTGCTACCTGCACACGGCCATTGTCATGACCTACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119496 GTTTGTGGAAGGCTGCTACCTGCACACGGCCATTGTCATGACCTACTCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTGAGCGCCTGCGCAAGTGCCTCTTCCTCTTCATCGGATGGT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 119546 CTGAGCGCCTGCGCAAGTGCCTCTTCCTCTTCATCGGATGGTGTG...CA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    698  GCATCCCCTTCCCCATCATCGTCGCCTGGGCCATCGGCAAGCTCTACTA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120064 GGCATCCCCTTCCCCATCATCGTCGCCTGGGCCATCGGCAAGCTCTACTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGAGAATGAACA         GTGCTGGTTTGGCAAGGAGCCTGGCGACC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 120114 TGAGAATGAACAGTA...CAGGTGCTGGTTTGGCAAGGAGCCTGGCGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGGTGGACTACATCTACCAAGGCCCCATCATTCTCGTGCTCCTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 121665 TGGTGGACTACATCTACCAAGGCCCCATCATTCTCGTGCTCCTGGTA...

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    832    ATCAATTTCGTATTTCTGTTCAACATCGTCAGGATCCTAATGACAAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126266 CAGATCAATTTCGTATTTCTGTTCAACATCGTCAGGATCCTAATGACAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GTTACGCGCGTCCACCACATCCGAGACAATCCAGTACAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 126316 GTTACGCGCGTCCACCACATCCGAGACAATCCAGTACAGGTA...CAGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 AGGCAGTGAAGGCCACCCTGGTGCTCCTGCCCCTCCTGGGCATCACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126568 AGGCAGTGAAGGCCACCCTGGTGCTCCTGCCCCTCCTGGGCATCACCTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 ATGCTCTTCTTCGTCAATCCCGGGGAGGACGACCTGTCACAGATCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126618 ATGCTCTTCTTCGTCAATCCCGGGGAGGACGACCTGTCACAGATCATGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CATCTATTTCAACTCCTTCCTGCAGTCGTTCCAG         GGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 126668 CATCTATTTCAACTCCTTCCTGCAGTCGTTCCAGGTG...CAGGGTTTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TCGTGTCTGTCTTCTACTGCTTCTTCAATGGAGAG         GTGCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 127208 TCGTGTCTGTCTTCTACTGCTTCTTCAATGGAGAGGTA...CAGGTGCGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 TCAGCCGTGAGGAAGAGGTGGCACCGCTGGCAGGACCATCACTCCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128687 TCAGCCGTGAGGAAGAGGTGGCACCGCTGGCAGGACCATCACTCCCTTCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 AGTCCCCATGGCCCGGGCCATGTCCATCCCTACATCACCCACACGGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128737 AGTCCCCATGGCCCGGGCCATGTCCATCCCTACATCACCCACACGGATCA

   1300     .    :    .    :    .    :
   1202 GCTTCCACAGCATCAAGCAGACGGCCGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 128787 GCTTCCACAGCATCAAGCAGACGGCCGCTGTG