seq1 = pF1KE1870.tfa, 1173 bp
seq2 = pF1KE1870/gi568815588r_17049043.tfa (gi568815588r:17049043_17301634), 252592 bp

>pF1KE1870 1173
>gi568815588r:17049043_17301634 (Chr10)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-174  (126975-127084)   99% ->
175-251  (132718-132794)   98% ->
252-323  (139398-139469)   98% ->
324-389  (140087-140152)   100% ->
390-459  (141261-141330)   100% ->
460-543  (142406-142489)   100% ->
544-887  (143851-144194)   99% ->
888-945  (146901-146958)   100% ->
946-1075  (147999-148128)   100% ->
1076-1173  (152495-152592)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCCCTGCGGGTGCTGGAGCTATACAGCGGCGTGGGCGGCATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCCCCTGCGGGTGCTGGAGCTATACAGCGGCGTGGGCGGCATGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCACGCGCTGAGAG         AAAGCTGTATACCTGCACAAGTGGTGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCACGCGCTGAGAGGTG...CAGAAAGCTGTATACCTGCACAAGTGGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTGCCATTGATGTCAACACTGTCGCTAATGAAGTATACAAGTATAATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127002 CTGCCATTGATGTCAACACTGTCGCTAATGAAGTATACAAGTATAATTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTCACACACAGTTACTTGCCAAGACAATTGAA         GGCATTAC
        |||||||||||||||||||||||||| ||||||>>>...>>>||||||||
 127052 CCTCACACACAGTTACTTGCCAAGACGATTGAAGTG...CAGGGCATTAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ACTCGAAGAGTTTGACAGATTATCTTTCGATATGATTTTAATGAGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 132726 ACTCGAAGAGTTTGACAGATTATCTTTTGATATGATTTTAATGAGCCCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCTGCCAGCCATTCACAAG         GATTGGCCGGCAGGGTGATATG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 132776 CCTGCCAGCCATTCACAAGGTA...TAGGATTGGCCGGCAGGGTGATATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACTGATTCAAGGACGAATAGCTTCTTATATATTCTAGATATTCTCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 139420 ACTGATTCAAGGACGAATAGCTTCTTACATATTCTAGATATTCTCCCAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324          ATTACAAAAATTACCAAAGTATATTCTTTTGGAAAATGTTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139470 GTA...TAGATTACAAAAATTACCAAAGTATATTCTTTTGGAAAATGTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAGGTTTTGAAGTATCTTCTACAAG         AGACCTCTTGATACAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 140128 AAGGTTTTGAAGTATCTTCTACAAGGTA...TAGAGACCTCTTGATACAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 ACAATAGAAAATTGTGGCTTTCAGTACCAAGAGTTTCTATTATCTCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141277 ACAATAGAAAATTGTGGCTTTCAGTACCAAGAGTTTCTATTATCTCCAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CTCT         CTTGGCATTCCAAATTCAAGGCTACGATATTTTCTTA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141327 CTCTGTA...CAGCTTGGCATTCCAAATTCAAGGCTACGATATTTTCTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TTGCAAAGCTTCAGTCAGAGCCATTACCCTTTCAAGCCCCTGGTCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 142443 TTGCAAAGCTTCAGTCAGAGCCATTACCCTTTCAAGCCCCTGGTCAGGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    544       GTACTTATGGAGTTCCCCAAAATTGAATCTGTACATCCACAAAA
        ...>>>||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142493 ...CAGGTACTGATGGAGTTCCCCAAAATTGAATCTGTACATCCACAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 ATATGCAATGGATGTAGAAAATAAAATTCAAGAAAAGAACGTTGAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143895 ATATGCAATGGATGTAGAAAATAAAATTCAAGAAAAGAACGTTGAACCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 ATATTAGCTTTGATGGCAGCATACAGTGTTCTGGAAAAGATGCCATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143945 ATATTAGCTTTGATGGCAGCATACAGTGTTCTGGAAAAGATGCCATTCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 TTTAAGCTTGAAACTGCAGAAGAAATTCACAGGAAAAATCAACAAGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143995 TTTAAGCTTGAAACTGCAGAAGAAATTCACAGGAAAAATCAACAAGATAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TGATCTCTCTGTGAAAATGCTAAAAGATTTTCTTGAAGATGACACTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144045 TGATCTCTCTGTGAAAATGCTAAAAGATTTTCTTGAAGATGACACTGACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGAACCAGTATCTTTTACCACCAAAGTCATTGCTGCGATATGCTCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144095 TGAACCAGTATCTTTTACCACCAAAGTCATTGCTGCGATATGCTCTTCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TTAGACATTGTTCAGCCCACTTGTAGAAGGTCCGTGTGCTTTACCAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144145 TTAGACATTGTTCAGCCCACTTGTAGAAGGTCCGTGTGCTTTACCAAAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888          ATATGGAAGCTACATAGAAGGGACAGGGTCTGTGTTACAGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144195 GTA...CAGATATGGAAGCTACATAGAAGGGACAGGGTCTGTGTTACAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CTGCAGAGGATGTGCAG         GTTGAGAATATCTACAAATCCCTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 146942 CTGCAGAGGATGTGCAGGTA...CAGGTTGAGAATATCTACAAATCCCTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 ACCAATTTGTCACAAGAAGAACAGATAACAAAGCTGTTAATACTTAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148023 ACCAATTTGTCACAAGAAGAACAGATAACAAAGCTGTTAATACTTAAACT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GCGATATTTCACTCCTAAAGAAATAGCAAATCTCCTTGGATTTCCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148073 GCGATATTTCACTCCTAAAGAAATAGCAAATCTCCTTGGATTTCCTCCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AGTTCG         GATTTCCTGAGAAGATAACAGTGAAACAGCGTTAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148123 AGTTCGGTA...TAGGATTTCCTGAGAAGATAACAGTGAAACAGCGTTAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CGCCTACTTGGAAATAGTCTCAACGTGCATGTAGTAGCTAAACTAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152530 CGCCTACTTGGAAATAGTCTCAACGTGCATGTAGTAGCTAAACTAATCAA

   1250     .    :
   1161 AATCTTATATGAA
        |||||||||||||
 152580 AATCTTATATGAA