seq1 = pF1KE1845.tfa, 1083 bp
seq2 = pF1KE1845/gi568815589r_26742304.tfa (gi568815589r:26742304_26992715), 250412 bp

>pF1KE1845 1083
>gi568815589r:26742304_26992715 (Chr9)

(complement)

1-303  (100001-100303)   100% ->
304-504  (105203-105403)   100% ->
505-589  (106528-106612)   100% ->
590-665  (107831-107906)   100% ->
666-739  (131577-131650)   100% ->
740-1083  (150069-150412)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGGGGAAAAAGTCCTCCCGGGAGAAACGGCGCAAACGTAGCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACGGGGAAAAAGTCCTCCCGGGAGAAACGGCGCAAACGTAGCAGTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGCGGCCGCAGCGCTCGCGGCCCCGGACATCGTACCCGCGTTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGCGGCCGCAGCGCTCGCGGCCCCGGACATCGTACCCGCGTTGGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGCAGCAGTGGAAGCACTAGCGGCTGCGGGAGCGCCGGGGGCTGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGCAGCAGTGGAAGCACTAGCGGCTGCGGGAGCGCCGGGGGCTGCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCGTCAGCTGCTGTGGGAACGCCAATTTTAGTGGAAGTGTCACCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCGTCAGCTGCTGTGGGAACGCCAATTTTAGTGGAAGTGTCACCGGCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGGAGCGGCGGCAGCTGTTGGGGCGGGAGCAGCGTGGAGCGCAGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGGAGCGGCGGCAGCTGTTGGGGCGGGAGCAGCGTGGAGCGCAGCGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCGGAAGCGGAGGAGTACCGACTCTTCCAGCGTCTCGGGCTCCTTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCGGAAGCGGAGGAGTACCGACTCTTCCAGCGTCTCGGGCTCCTTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAG         GAAACTAAATATATTTTGCCAACTTTGGAAAAAGAATT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGGTG...TAGGAAACTAAATATATTTTGCCAACTTTGGAAAAAGAATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ATTCTTGGCAGAGCACAGTGACCTTGAAGAAGGTGGACTGGACCTGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105241 ATTCTTGGCAGAGCACAGTGACCTTGAAGAAGGTGGACTGGACCTGACTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGTCATTGAAACCAGTTAGTTTCTATATATCAGACAAAAAAGAAATGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105291 TGTCATTGAAACCAGTTAGTTTCTATATATCAGACAAAAAAGAAATGCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAGCAGTGCTTCTGTATTATAGGAGAGAAAAAGTTACAGAAGATGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105341 CAGCAGTGCTTCTGTATTATAGGAGAGAAAAAGTTACAGAAGATGCTTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGATGTGTTAAAG         AACTGTTCAATAGAAGAAATTAAAAAAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 105391 TGATGTGTTAAAGGTA...TAGAACTGTTCAATAGAAGAAATTAAAAAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TATGCCAGGAACAGTTAGAGCTCCTGTCTGAAAAAAAAATTTTGAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106556 TATGCCAGGAACAGTTAGAGCTCCTGTCTGAAAAAAAAATTTTGAAGATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTTGAGG         GTGACAATGGAATGGACTCTGATATGGAAGAGGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106606 CTTGAGGGTA...AAGGTGACAATGGAATGGACTCTGATATGGAAGAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGCAGATGATGGTTCTAAGATGGGATCTGATTTAGTCAGTCA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 107865 AGCAGATGATGGTTCTAAGATGGGATCTGATTTAGTCAGTCAGTA...CA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    666  GCAAGACATCTGTATAGATTCTGCTTCATCCGTGAGAGAGAATAAGCAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131576 GGCAAGACATCTGTATAGATTCTGCTTCATCCGTGAGAGAGAATAAGCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCTGAAGGTTTGGAATTAAAACAAG         GAAAAGGGGAAGATAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 131626 CCTGAAGGTTTGGAATTAAAACAAGGTA...CAGGAAAAGGGGAAGATAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGATGTACTCAGTATAAATGCAGATGCTTATGACAGCGACATAGAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150085 TGATGTACTCAGTATAAATGCAGATGCTTATGACAGCGACATAGAAGGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CATGCAACGAAGAAGCAGCTGCTCCCGAGGCACCAGAAAATACAGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150135 CATGCAACGAAGAAGCAGCTGCTCCCGAGGCACCAGAAAATACAGTCCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGTGAAGCTGGTCAGATAGATGACCTGGAGAAAGACATTGAGAAAAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150185 AGTGAAGCTGGTCAGATAGATGACCTGGAGAAAGACATTGAGAAAAGTGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GAATGAGATTCTAGGACTGGCAGAGTCTAGCCCAAACGAACCCAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150235 GAATGAGATTCTAGGACTGGCAGAGTCTAGCCCAAACGAACCCAAAGCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCACCCTGGCTGTTCCTCCACCAGAAGATGTTCAACCTTCTGCACAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150285 CCACCCTGGCTGTTCCTCCACCAGAAGATGTTCAACCTTCTGCACAGCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTGGAGCTGCTAGAACTTGAGATGAGGGCAAGAGCGATTAAAGCCCTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150335 CTGGAGCTGCTAGAACTTGAGATGAGGGCAAGAGCGATTAAAGCCCTAAT

   1100     .    :    .    :    .
   1056 GAAAGCTGGTGATATAAAAAAGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 150385 GAAAGCTGGTGATATAAAAAAGCCAGCC