seq1 = pF1KE1841.tfa, 1071 bp
seq2 = pF1KE1841/gi568815588r_71997337.tfa (gi568815588r:71997337_72313298), 315962 bp

>pF1KE1841 1071
>gi568815588r:71997337_72313298 (Chr10)

(complement)

1-112  (100001-100112)   100% ->
113-212  (102468-102567)   100% ->
213-310  (109775-109872)   100% ->
311-489  (116310-116488)   100% ->
490-626  (151625-151761)   100% ->
627-746  (160311-160430)   100% ->
747-871  (180118-180242)   100% ->
872-957  (185132-185217)   100% ->
958-1071  (215849-215962)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGTTCTGCGTCCACAGCTTATAAGAATTGATGGCCGGAATTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGTTCTGCGTCCACAGCTTATAAGAATTGATGGCCGGAATTACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGAATCCAGTCCAAGAACAGACCTATCAACATGAAGAAGATGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGAATCCAGTCCAAGAACAGACCTATCAACATGAAGAAGATGAAGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTTCTATCAAG         GCTCCATGGAGTGTGCTGATGAGCCCTGT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTTCTATCAAGGTA...CAGGCTCCATGGAGTGTGCTGATGAGCCCTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATGCCTACGAGGTGGAGCAGACCCCACAAGGATTCCGGTCTACTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102497 GATGCCTACGAGGTGGAGCAGACCCCACAAGGATTCCGGTCTACTTTGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCCCCCAGCTTGCTCTATAA         GCATATAGTTGGAAAGAGAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 102547 GGCCCCCAGCTTGCTCTATAAGTG...CAGGCATATAGTTGGAAAGAGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGGACACTAGGAAGAAAATAGAAATGGAGACCAAAACTTCTATTAGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109795 GGGACACTAGGAAGAAAATAGAAATGGAGACCAAAACTTCTATTAGCATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCTAAACCTGGACAAGACGGGGAAATTG         TAATCACTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 109845 CCTAAACCTGGACAAGACGGGGAAATTGGTG...CAGTAATCACTGGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCATCGAAATGGTGTAATTTCAGCCCGAACACGGATTGATGTTCTTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116323 GCATCGAAATGGTGTAATTTCAGCCCGAACACGGATTGATGTTCTTTTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACACTTTTCGAAGAAAGCAGCCCTTCACTCACTTCCTTGCCTTTTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116373 ACACTTTTCGAAGAAAGCAGCCCTTCACTCACTTCCTTGCCTTTTTCCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AATGAAGTTGAGGTTCAGGAAGGATTCCTGAGATTCCAGGAGGAAGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116423 AATGAAGTTGAGGTTCAGGAAGGATTCCTGAGATTCCAGGAGGAAGTACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGCGAAGTGCTCCATG         GATCATGGGGTTGACAGCAGCATTT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 116473 GGCGAAGTGCTCCATGGTA...CAGGATCATGGGGTTGACAGCAGCATTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCCAGAATCCTAAAAAGCTTCATCTAACTATTGGGATGTTGGTGCTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151650 TCCAGAATCCTAAAAAGCTTCATCTAACTATTGGGATGTTGGTGCTTTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGTGAGGAAGAGATCCAGCAGACATGTGAGATGCTACAGCAGTGTAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151700 AGTGAGGAAGAGATCCAGCAGACATGTGAGATGCTACAGCAGTGTAAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGAATTCATTAA         TGATATTTCTGGGGGTAAACCCCTAGAAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 151750 GGAATTCATTAAGTG...CAGTGATATTTCTGGGGGTAAACCCCTAGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGAGATGGCAGGGATAGAATACATGAATGATGATCCTGGCATGGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160340 TGGAGATGGCAGGGATAGAATACATGAATGATGATCCTGGCATGGTGGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTTCTTTACGCCAAAGTCCATATGAAAGATGGCTCCAACAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 160390 GTTCTTTACGCCAAAGTCCATATGAAAGATGGCTCCAACAGGTA...CAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCTACAAGAATTAGTTGATCGAGTGCTGGAACGTTTTCAGGCATCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180118 GCTACAAGAATTAGTTGATCGAGTGCTGGAACGTTTTCAGGCATCTGGAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TAATAGTGAAAGAGTGGAATAGTGTGAAACTGCATGCTACAGTTATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180168 TAATAGTGAAAGAGTGGAATAGTGTGAAACTGCATGCTACAGTTATGAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ACACTATTCAGGAAAGACCCCAATG         CTGAAGGCAGGTACAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 180218 ACACTATTCAGGAAAGACCCCAATGGTA...CAGCTGAAGGCAGGTACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCTCTACACAGCGGAAGGCAAATATATCTTCAAGGAAAGAGAATCATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185148 TCTCTACACAGCGGAAGGCAAATATATCTTCAAGGAAAGAGAATCATTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ATGGCCGAAATATTTTAAAG         TTGTTTGAGAACTTCTACTTT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 185198 ATGGCCGAAATATTTTAAAGGTC...CAGTTGTTTGAGAACTTCTACTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GGCTCCCTAAAGCTGAATTCAATTCACATCTCTCAGAGGTTCACCGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215870 GGCTCCCTAAAGCTGAATTCAATTCACATCTCTCAGAGGTTCACCGTAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CAGCTTTGGAAACTACGCTTCCTGTGGACAAATTGACTTCTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215920 CAGCTTTGGAAACTACGCTTCCTGTGGACAAATTGACTTCTCC