seq1 = pF1KE1837.tfa, 1062 bp
seq2 = pF1KE1837/gi568815587r_76087068.tfa (gi568815587r:76087068_76306407), 219340 bp

>pF1KE1837 1062
>gi568815587r:76087068_76306407 (Chr11)

(complement)

1-83  (100001-100083)   100% ->
84-319  (109690-109925)   100% ->
320-597  (111564-111841)   99% ->
598-890  (114552-114844)   100% ->
891-1062  (119169-119340)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGGCGCGGCCGCAGGTCTGCGAGGCGCTGCTCTTCGCCCTGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGGCGCGGCCGCAGGTCTGCGAGGCGCTGCTCTTCGCCCTGGCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGACCGGCGTGTGCTATGGCATCAAGTGGCT         GGCGCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100051 CCAGACCGGCGTGTGCTATGGCATCAAGTGGCTGTG...CAGGGCGCTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCAAGACACCATCGGCCCTGGCACTGAACCAGACGCAACACTGCAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109698 CCAAGACACCATCGGCCCTGGCACTGAACCAGACGCAACACTGCAAGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGAGGGTCTGGTGTCTGCACAGGTGCAGCTGTGCCGCAGCAACCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109748 CTGGAGGGTCTGGTGTCTGCACAGGTGCAGCTGTGCCGCAGCAACCTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTCATGCACACGGTGGTGCACGCCGCCCGCGAGGTCATGAAGGCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109798 GCTCATGCACACGGTGGTGCACGCCGCCCGCGAGGTCATGAAGGCCTGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCCGGGCCTTTGCCGACATGCGCTGGAACTGCTCCTCCATTGAGCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109848 GCCGGGCCTTTGCCGACATGCGCTGGAACTGCTCCTCCATTGAGCTCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCCAACTATTTGCTTGACCTGGAGAGAG         GGACCCGGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 109898 CCCAACTATTTGCTTGACCTGGAGAGAGGTA...CAGGGACCCGGGAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGCCTTCGTGTATGCGCTGTCGGCCGCCGCCATCAGCCACGCCATCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111577 GGCCTTCGTGTATGCGCTGTCGGCCGCCGCCATCAGCCACGCCATCGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGGCCTGCACCTCCGGCGACCTGCCTGGCTGCTCCTGCGGCCCCGTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 111627 GGGCCTGCACCTCCGGCGACCTGCCCGGCTGCTCCTGCGGCCCCGTCCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGTGAGCCACCCGGGCCCGGGAACCGCTGGGGAGGATGTGCGGACAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111677 GGTGAGCCACCCGGGCCCGGGAACCGCTGGGGAGGATGTGCGGACAACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAGCTACGGGCTCCTCATGGGGGCCAAGTTTTCCGATGCTCCTATGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111727 CAGCTACGGGCTCCTCATGGGGGCCAAGTTTTCCGATGCTCCTATGAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGAAAAAAACAGGATCCCAAGCCAATAAACTGATGCGTCTACACAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111777 TGAAAAAAACAGGATCCCAAGCCAATAAACTGATGCGTCTACACAACAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAAGTGGGGAGACAG         GCTCTGCGCGCCTCTCTGGAAATGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 111827 GAAGTGGGGAGACAGGTA...CAGGCTCTGCGCGCCTCTCTGGAAATGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GTGTAAGTGCCATGGGGTGTCTGGCTCCTGCTCCATCCGCACCTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114578 GTGTAAGTGCCATGGGGTGTCTGGCTCCTGCTCCATCCGCACCTGCTGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGGGGCTGCAGGAGCTGCAGGATGTGGCTGCTGACCTCAAGACCCGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114628 AGGGGCTGCAGGAGCTGCAGGATGTGGCTGCTGACCTCAAGACCCGATAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTGTCGGCCACCAAGGTAGTGCACCGACCCATGGGCACCCGCAAGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114678 CTGTCGGCCACCAAGGTAGTGCACCGACCCATGGGCACCCGCAAGCACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGTGCCCAAGGACCTGGATATCCGGCCTGTGAAGGACTCGGAACTCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114728 GGTGCCCAAGGACCTGGATATCCGGCCTGTGAAGGACTCGGAACTCGTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ATCTGCAGAGCTCACCTGACTTCTGCATGAAGAATGAGAAGGTGGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114778 ATCTGCAGAGCTCACCTGACTTCTGCATGAAGAATGAGAAGGTGGGCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CACGGGACACAAGACAG         GCAGTGCAACAAGACATCCAACGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 114828 CACGGGACACAAGACAGGTG...TAGGCAGTGCAACAAGACATCCAACGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AAGCGACAGCTGCGACCTTATGTGCTGCGGGCGTGGCTACAACCCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119193 AAGCGACAGCTGCGACCTTATGTGCTGCGGGCGTGGCTACAACCCCTACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CAGACCGCGTGGTCGAGCGGTGCCACTGTAAGTACCACTGGTGCTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119243 CAGACCGCGTGGTCGAGCGGTGCCACTGTAAGTACCACTGGTGCTGCTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1015 GTCACCTGCCGCAGGTGTGAGCGTACCGTGGAGCGCTATGTCTGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119293 GTCACCTGCCGCAGGTGTGAGCGTACCGTGGAGCGCTATGTCTGCAAG