seq1 = pF1KE1832.tfa, 1053 bp
seq2 = pF1KE1832/gi568815597r_22020053.tfa (gi568815597r:22020053_22242922), 222870 bp

>pF1KE1832 1053
>gi568815597r:22020053_22242922 (Chr1)

(complement)

1-77  (100001-100077)   100% ->
78-313  (113072-113307)   100% ->
314-445  (121347-121478)   100% ->
446-588  (121570-121712)   100% ->
589-1053  (122406-122870)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTCCCCGCTCGTGCCTGCGTTCGCTGCGCCTCCTCGTCTTCGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTCCCCGCTCGTGCCTGCGTTCGCTGCGCCTCCTCGTCTTCGCCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCTCAGCCGCCGCGAGCAACTGGCT         GTACCTGGCCAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100051 CTTCTCAGCCGCCGCGAGCAACTGGCTGTA...CAGGTACCTGGCCAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTCGTCGGTGGGGAGCATCTCAGAGGAGGAGACGTGCGAGAAACTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113086 TGTCGTCGGTGGGGAGCATCTCAGAGGAGGAGACGTGCGAGAAACTCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCCTGATCCAGAGGCAGGTGCAGATGTGCAAGCGGAACCTGGAAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113136 GGCCTGATCCAGAGGCAGGTGCAGATGTGCAAGCGGAACCTGGAAGTCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGACTCGGTGCGCCGCGGTGCCCAGCTGGCCATTGAGGAGTGCCAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113186 GGACTCGGTGCGCCGCGGTGCCCAGCTGGCCATTGAGGAGTGCCAGTACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTTCCGGAACCGGCGCTGGAACTGCTCCACACTCGACTCCTTGCCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113236 AGTTCCGGAACCGGCGCTGGAACTGCTCCACACTCGACTCCTTGCCCGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCGGCAAGGTGGTGACGCAAG         GGACTCGGGAGGCGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 113286 TTCGGCAAGGTGGTGACGCAAGGTG...CAGGGACTCGGGAGGCGGCCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGTGTACGCCATCTCTTCGGCAGGTGTGGCCTTTGCAGTGACGCGGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121366 CGTGTACGCCATCTCTTCGGCAGGTGTGGCCTTTGCAGTGACGCGGGCGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCAGCAGTGGGGAGCTGGAGAAGTGCGGCTGTGACAGGACAGTGCATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121416 GCAGCAGTGGGGAGCTGGAGAAGTGCGGCTGTGACAGGACAGTGCATGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTCAGCCCACAGG         GCTTCCAGTGGTCAGGATGCTCTGACAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 121466 GTCAGCCCACAGGGTA...CAGGCTTCCAGTGGTCAGGATGCTCTGACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATCGCCTACGGTGTGGCCTTCTCACAGTCGTTTGTGGATGTGCGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121598 CATCGCCTACGGTGTGGCCTTCTCACAGTCGTTTGTGGATGTGCGGGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GAAGCAAGGGGGCCTCGTCCAGCAGAGCCCTCATGAACCTCCACAACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121648 GAAGCAAGGGGGCCTCGTCCAGCAGAGCCCTCATGAACCTCCACAACAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAGGCCGGCAGGAAG         GCCATCCTGACACACATGCGGGTGGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 121698 GAGGCCGGCAGGAAGGTA...CAGGCCATCCTGACACACATGCGGGTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ATGCAAGTGCCACGGGGTGTCAGGCTCCTGTGAGGTAAAGACGTGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122432 ATGCAAGTGCCACGGGGTGTCAGGCTCCTGTGAGGTAAAGACGTGCTGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GAGCCGTGCCGCCCTTCCGCCAGGTGGGTCACGCACTGAAGGAGAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122482 GAGCCGTGCCGCCCTTCCGCCAGGTGGGTCACGCACTGAAGGAGAAGTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GATGGTGCCACTGAGGTGGAGCCACGCCGCGTGGGCTCCTCCAGGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122532 GATGGTGCCACTGAGGTGGAGCCACGCCGCGTGGGCTCCTCCAGGGCACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GGTGCCACGCAACGCACAGTTCAAGCCGCACACAGATGAGGACCTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122582 GGTGCCACGCAACGCACAGTTCAAGCCGCACACAGATGAGGACCTGGTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACTTGGAGCCTAGCCCCGACTTCTGTGAGCAGGACATGCGCAGCGGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122632 ACTTGGAGCCTAGCCCCGACTTCTGTGAGCAGGACATGCGCAGCGGCGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CTGGGCACGAGGGGCCGCACATGCAACAAGACGTCCAAGGCCATCGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122682 CTGGGCACGAGGGGCCGCACATGCAACAAGACGTCCAAGGCCATCGACGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CTGTGAGCTGCTGTGCTGTGGCCGCGGCTTCCACACGGCGCAGGTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122732 CTGTGAGCTGCTGTGCTGTGGCCGCGGCTTCCACACGGCGCAGGTGGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TGGCTGAACGCTGCAGCTGCAAATTCCACTGGTGCTGCTTCGTCAAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122782 TGGCTGAACGCTGCAGCTGCAAATTCCACTGGTGCTGCTTCGTCAAGTGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .
   1015 CGGCAGTGCCAGCGGCTCGTGGAGTTGCACACGTGCCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122832 CGGCAGTGCCAGCGGCTCGTGGAGTTGCACACGTGCCGA