seq1 = pF1KE1829.tfa, 1041 bp
seq2 = pF1KE1829/gi568815588r_70332939.tfa (gi568815588r:70332939_70541667), 208729 bp

>pF1KE1829 1041
>gi568815588r:70332939_70541667 (Chr10)

(complement)

1-193  (100001-100193)   100% ->
194-891  (105685-106382)   99% ->
892-1041  (108580-108729)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACGCCCACTGCCTGCCCTTCCTTCTGCACGCCTGGTGGGCCCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACGCCCACTGCCTGCCCTTCCTTCTGCACGCCTGGTGGGCCCTACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGGCGGGTGCTGCGACGGTGGCCACTGCGCTCCTGCGTACGCGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGGCGGGTGCTGCGACGGTGGCCACTGCGCTCCTGCGTACGCGGGGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCCCTCGTCGCCATCCCCTCTGGCGTACATGCTGAGCCTCTACCGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCCCTCGTCGCCATCCCCTCTGGCGTACATGCTGAGCCTCTACCGCGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGCTGCCGAGGGCAGACATCATCCGCAGCCTACAGGCAGAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100151 CCGCTGCCGAGGGCAGACATCATCCGCAGCCTACAGGCAGAAGGTA...C

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    194   ATGTGGCAGTGGATGGGCAGAACTGGACGTTTGCTTTTGACTTCTCCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105683 AGATGTGGCAGTGGATGGGCAGAACTGGACGTTTGCTTTTGACTTCTCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCTGAGCCAACAAGAGGATCTGGCATGGGCTGAGCTCCGGCTGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105733 TCCTGAGCCAACAAGAGGATCTGGCATGGGCTGAGCTCCGGCTGCAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCCAGCCCTGTGGACCTCCCCACTGAGGGCTCACTTGCCATTGAGATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105783 TCCAGCCCTGTGGACCTCCCCACTGAGGGCTCACTTGCCATTGAGATTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCACCAGCCAAAGCCCGACACAGAGCAGGCTTCAGACAGCTGCTTAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105833 CCACCAGCCAAAGCCCGACACAGAGCAGGCTTCAGACAGCTGCTTAGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGTTTCAGATGGACCTATTCACTGTCACTTTGTCCCAGGTCACCTTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105883 GGTTTCAGATGGACCTATTCACTGTCACTTTGTCCCAGGTCACCTTTTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTGGGCAGCATGGTTTTGGAGGTGACCAGGCCTCTCTCCAAGTGGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105933 TTGGGCAGCATGGTTTTGGAGGTGACCAGGCCTCTCTCCAAGTGGCTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCGCCCTGGGGCCCTGGAGAAGCAGATGTCCAGGGTAGCTGGAGAGTGCT
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105983 GCACCCTGGGGCCCTGGAGAAGCAGATGTCCAGGGTAGCTGGAGAGTGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGCCGCGGCCCCCCACACCGCCTGCCACCAATGTGCTCCTTATGCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106033 GGCCGCGGCCCCCCACACCGCCTGCCACCAATGTGCTCCTTATGCTCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TCCAACCTCTCGCAGGAGCAGAGGCAGCTGGGTGGGTCCACCTTGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106083 TCCAACCTCTCGCAGGAGCAGAGGCAGCTGGGTGGGTCCACCTTGCTGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGAAGCCGAGAGCTCCTGGCGGGCCCAGGAGGGACAGCTGTCCTGGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106133 GGAAGCCGAGAGCTCCTGGCGGGCCCAGGAGGGACAGCTGTCCTGGGAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GGGGCAAGAGGCACCGTCGACATCACTTGCCAGACAGAAGTCAACTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106183 GGGGCAAGAGGCACCGTCGACATCACTTGCCAGACAGAAGTCAACTGTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CGGAAGGTCAAGTTCCAGGTGGACTTCAACCTGATCGGATGGGGCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106233 CGGAAGGTCAAGTTCCAGGTGGACTTCAACCTGATCGGATGGGGCTCCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GATCATCTACCCCAAGCAGTACAACGCCTATCGCTGTGAGGGCGAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106283 GATCATCTACCCCAAGCAGTACAACGCCTATCGCTGTGAGGGCGAGTGTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CTAATCCTGTTGGGGAGGAGTTTCATCCGACCAACCATGCATACATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106333 CTAATCCTGTTGGGGAGGAGTTTCATCCGACCAACCATGCATACATCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892          AGTCTGCTGAAACGTTACCAGCCCCACCGAGTCCCTTCCAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106383 GTG...CAGAGTCTGCTGAAACGTTACCAGCCCCACCGAGTCCCTTCCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TTGTTGTGCCCCAGTGAAGACCAAGCCGCTGAGCATGCTGTATGTGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108621 TTGTTGTGCCCCAGTGAAGACCAAGCCGCTGAGCATGCTGTATGTGGATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ATGGCAGAGTGCTCCTAGATCACCATAAAGACATGATCGTGGAAGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108671 ATGGCAGAGTGCTCCTAGATCACCATAAAGACATGATCGTGGAAGAATGT

   1050     .
   1033 GGGTGCCTC
        |||||||||
 108721 GGGTGCCTC