seq1 = pF1KE1823.tfa, 1008 bp
seq2 = pF1KE1823/gi568815580r_69764317.tfa (gi568815580r:69764317_70047406), 283090 bp

>pF1KE1823 1008
>gi568815580r:69764317_70047406 (Chr18)

(complement)

1-46  (100001-100046)   100% ->
47-382  (100338-100673)   100% ->
383-727  (151362-151706)   100% ->
728-830  (174161-174263)   100% ->
831-885  (179996-180050)   100% ->
886-1008  (182968-183090)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATTATCCTACTTTACTTTTGGCTCTTCTTCATGTATACAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100001 ATGGATTATCCTACTTTACTTTTGGCTCTTCTTCATGTATACAGAGGTA.

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     47      CTCTATGTGAAGAGGTGCTTTGGCATACATCAGTTCCCTTTGCCG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ..CAGCTCTATGTGAAGAGGTGCTTTGGCATACATCAGTTCCCTTTGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAACATGTCTCTAGAATGTGTGTATCCATCAATGGGCATCTTAACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100383 AGAACATGTCTCTAGAATGTGTGTATCCATCAATGGGCATCTTAACACAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGGAGTGGTTCAAGATCGGGACCCAGCAGGATTCCATAGCCATTTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100433 GTGGAGTGGTTCAAGATCGGGACCCAGCAGGATTCCATAGCCATTTTCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCTACTCATGGCATGGTCATAAGGAAGCCCTATGCTGAGAGGGTTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100483 CCCTACTCATGGCATGGTCATAAGGAAGCCCTATGCTGAGAGGGTTTACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTTTGAATTCAACGATGGCTTCCAATAACATGACTCTTTTCTTTCGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100533 TTTTGAATTCAACGATGGCTTCCAATAACATGACTCTTTTCTTTCGGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCTCTGAAGATGATGTTGGCTACTATTCCTGCTCTCTTTACACTTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100583 GCCTCTGAAGATGATGTTGGCTACTATTCCTGCTCTCTTTACACTTACCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ACAGGGAACTTGGCAGAAGGTGATACAGGTGGTTCAGTCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100633 ACAGGGAACTTGGCAGAAGGTGATACAGGTGGTTCAGTCAGGTA...CAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATAGTTTTGAGGCAGCTGTGCCATCAAATAGCCACATTGTTTCGGAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151362 ATAGTTTTGAGGCAGCTGTGCCATCAAATAGCCACATTGTTTCGGAACCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGAAAGAATGTCACACTCACTTGTCAGCCTCAGATGACGTGGCCTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151412 GGAAAGAATGTCACACTCACTTGTCAGCCTCAGATGACGTGGCCTGTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGCAGTGAGGTGGGAAAAGATCCAGCCCCGTCAGATCGACCTCTTAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151462 GGCAGTGAGGTGGGAAAAGATCCAGCCCCGTCAGATCGACCTCTTAACTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACTGCAACTTGGTCCATGGCAGAAATTTCACCTCCAAGTTCCCAAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151512 ACTGCAACTTGGTCCATGGCAGAAATTTCACCTCCAAGTTCCCAAGACAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ATAGTGAGCAACTGCAGCCACGGAAGGTGGAGCGTCATCGTCATCCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151562 ATAGTGAGCAACTGCAGCCACGGAAGGTGGAGCGTCATCGTCATCCCCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGTCACAGTCTCAGACTCGGGGCTTTACCGCTGCTACTTGCAGGCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151612 TGTCACAGTCTCAGACTCGGGGCTTTACCGCTGCTACTTGCAGGCCAGCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CAGGAGAAAACGAAACCTTCGTGATGAGATTGACTGTAGCCGAGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 151662 CAGGAGAAAACGAAACCTTCGTGATGAGATTGACTGTAGCCGAGGGTG..

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    728     GTAAAACCGATAACCAATATACCCTCTTTGTGGCTGGAGGGACAGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151712 .TAGGTAAAACCGATAACCAATATACCCTCTTTGTGGCTGGAGGGACAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TTTATTGTTGTTGTTTGTTATCTCAATTACCACCATCATTGTCATTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174207 TTTATTGTTGTTGTTTGTTATCTCAATTACCACCATCATTGTCATTTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TTAACAG         AAGGAGAAGGAGAGAGAGAAGAGATCTATTTACA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174257 TTAACAGGTG...CAGAAGGAGAAGGAGAGAGAGAAGAGATCTATTTACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GAGTCCTGGGATACACAGAAG         GCACCCAATAACTATAGAAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 180030 GAGTCCTGGGATACACAGAAGGTA...TAGGCACCCAATAACTATAGAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TCCCATCTCTACCGGTCAACCTACCAATCAATCCATGGATGATACAAGAG
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182988 TCCCATCTCTACCAGTCAACCTACCAATCAATCCATGGATGATACAAGAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AGGATATTTATGTCAACTATCCAACCTTCTCTCGCAGACCAAAGACTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183038 AGGATATTTATGTCAACTATCCAACCTTCTCTCGCAGACCAAAGACTAGA

   1050 
   1006 GTT
        |||
 183088 GTT