seq1 = pF1KE1821.tfa, 1005 bp
seq2 = pF1KE1821/gi568815597r_166757570.tfa (gi568815597r:166757570_166976233), 218664 bp

>pF1KE1821 1005
>gi568815597r:166757570_166976233 (Chr1)

(complement)

1-74  (100001-100074)   100% ->
75-166  (106380-106471)   100% ->
167-232  (106724-106789)   100% ->
233-330  (112313-112410)   100% ->
331-540  (113822-114031)   100% ->
541-692  (115897-116048)   100% ->
693-855  (117953-118115)   100% ->
856-1005  (118515-118664)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACCTTTGTGAGCGAGCTGGAGGCGGCCAAGAAGAACTTAAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGACCTTTGTGAGCGAGCTGGAGGCGGCCAAGAAGAACTTAAGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCTGGGGGACAACGTGAAACA         ATACTGGGCTAACCTAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100051 GGCCCTGGGGGACAACGTGAAACAGTA...CAGATACTGGGCTAACCTAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGCTGTGGTTCAAGCAGAAGATCAGCAAAGAGGAGTTTGACCTTGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106397 AGCTGTGGTTCAAGCAGAAGATCAGCAAAGAGGAGTTTGACCTTGAAGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CATAGACTTCTCACACAGGATAATG         TCCATTCTCACAATGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 106447 CATAGACTTCTCACACAGGATAATGGTA...CAGTCCATTCTCACAATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTTCCTCCTGGCCATTCTCACGCGTTGTCAGATTTTGGTTTCTACACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106740 TTTCCTCCTGGCCATTCTCACGCGTTGTCAGATTTTGGTTTCTACACCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233          ATGGTGCTGGATCTTTGCCTTGGCCAGGGGGTTCCGCAGCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106790 GTA...TAGATGGTGCTGGATCTTTGCCTTGGCCAGGGGGTTCCGCAGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAACCTGGAAAACCCAAGGGAAAGAAAAAGCTTTCTTCTGTTCGTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112354 AAACCTGGAAAACCCAAGGGAAAGAAAAAGCTTTCTTCTGTTCGTCAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ATTTGAT         CATAGATTCCAGCCTCAAAATCCTCTCTCAGGAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112404 ATTTGATGTA...TAGCATAGATTCCAGCCTCAAAATCCTCTCTCAGGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CCCAGCAATTTGTGGCAAAGGATCCCCAAGATGATGACGACTTGAAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113856 CCCAGCAATTTGTGGCAAAGGATCCCCAAGATGATGACGACTTGAAACTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TGTTCCCACACAATGATGCTTCCCACTCGAGGCCAGCTTGAAGGGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113906 TGTTCCCACACAATGATGCTTCCCACTCGAGGCCAGCTTGAAGGGAGAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GATAGTGACTGCTTATGAGCATGGGCTGGACAATGTCACCGAGGAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113956 GATAGTGACTGCTTATGAGCATGGGCTGGACAATGTCACCGAGGAGGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTTCAGCTGTTGTCTATGCTGTGGAG         AATCACCTTAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 114006 TTTCAGCTGTTGTCTATGCTGTGGAGGTT...CAGAATCACCTTAAAGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATACTGACGTCAGTTGTGTCAAGAAGGAAAGCTTATCGGTTACGAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115912 ATACTGACGTCAGTTGTGTCAAGAAGGAAAGCTTATCGGTTACGAGATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCATTTTAAATATGCCTTTGGCAGTAACGTGACCCCGCAGCCATACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115962 TCATTTTAAATATGCCTTTGGCAGTAACGTGACCCCGCAGCCATACCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGAATAGTGTAGTAGCTTACAACAACTTAATAGAAAG         CCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 116012 AGAATAGTGTAGTAGCTTACAACAACTTAATAGAAAGGTA...CAGCCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CCAGCTTTTACTGCTCCCTGTGCTGGTCAGAATCCAGCTTCTCACCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117957 CCAGCTTTTACTGCTCCCTGTGCTGGTCAGAATCCAGCTTCTCACCCACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCCTGATGATGCTGAGCAGCAGGCTGCACTCCTGCTGGCATGCTCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118007 CCCTGATGATGCTGAGCAGCAGGCTGCACTCCTGCTGGCATGCTCCGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACACTCTACCTGCATCTTTGCCTCCGGTGAACATGTACGATCTTTTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118057 ACACTCTACCTGCATCTTTGCCTCCGGTGAACATGTACGATCTTTTTGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GCTTTGCAG         GTGCACAGGGAAGTCATCCCTACACATACTGT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 118107 GCTTTGCAGGTA...CAGGTGCACAGGGAAGTCATCCCTACACATACTGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTATGCTCTTAACATTGAAAGGATCATCACGAAACTCTGGCATCCAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118547 CTATGCTCTTAACATTGAAAGGATCATCACGAAACTCTGGCATCCAAATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ATGAAGAGCTGCAGCAAGACAAAGTTCACCGCCAGCGCTTGGCAGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118597 ATGAAGAGCTGCAGCAAGACAAAGTTCACCGCCAGCGCTTGGCAGCCAAG

   1050     .    :    .
    988 GAGGGGCTTTTGCTGTGC
        ||||||||||||||||||
 118647 GAGGGGCTTTTGCTGTGC