seq1 = pF1KE1815.tfa, 993 bp
seq2 = pF1KE1815/gi568815597r_10361493.tfa (gi568815597r:10361493_10572458), 210966 bp

>pF1KE1815 993
>gi568815597r:10361493_10572458 (Chr1)

(complement)

1-136  (100001-100136)   100% ->
137-298  (103121-103282)   100% ->
299-441  (105127-105269)   100% ->
442-631  (108839-109028)   100% ->
632-783  (109250-109401)   100% ->
784-993  (110757-110966)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGTGACCGGGGACGCCGGGGTACCAGAATCTGGCGAGATCCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGTGACCGGGGACGCCGGGGTACCAGAATCTGGCGAGATCCGGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTAAAGCCGTGTCTGCTGCGCCGCAACTACAGCCGCGAACAGCACGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTAAAGCCGTGTCTGCTGCGCCGCAACTACAGCCGCGAACAGCACGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCCGCCTCCTGCCTCGAAGACCTGAGGAGCAAGG         CCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100101 TGGCCGCCTCCTGCCTCGAAGACCTGAGGAGCAAGGGTT...CAGCCTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACATTCTGGCCATTGATAAGTCCCTGACACCAGTCACCCTGGTCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103126 GACATTCTGGCCATTGATAAGTCCCTGACACCAGTCACCCTGGTCCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAGGATGGCACCATAGTGGATGATGACGATTACTTTCTGTGTCTACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103176 AGAGGATGGCACCATAGTGGATGATGACGATTACTTTCTGTGTCTACCTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCAATACTAAGTTTGTGGCATTGGCTAGTAATGAGAAATGGGCATACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103226 CCAATACTAAGTTTGTGGCATTGGCTAGTAATGAGAAATGGGCATACAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AATTCAG         ATGGAGGTACAGCTTGGATTTCCCAAGAGTCCTT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103276 AATTCAGGTA...CAGATGGAGGTACAGCTTGGATTTCCCAAGAGTCCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGATGTAGATGAAACAGACAGCGGGGCAGGGTTGAAGTGGAAGAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105161 TGATGTAGATGAAACAGACAGCGGGGCAGGGTTGAAGTGGAAGAATGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCAGGCAGCTGAAAGAAGATCTGTCCAGCATCATCCTCCTATCAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105211 CCAGGCAGCTGAAAGAAGATCTGTCCAGCATCATCCTCCTATCAGAGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GACCTCCAG         ATGCTTGTTGACGCTCCCTGCTCAGACCTGGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 105261 GACCTCCAGGTA...TAGATGCTTGTTGACGCTCCCTGCTCAGACCTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCAGGAACTACGTCAGAGTTGTGCCACCGTCCAGCGGCTGCAGCACACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108871 TCAGGAACTACGTCAGAGTTGTGCCACCGTCCAGCGGCTGCAGCACACAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCAACAGGTGCTTGACCAAAGAGAGGAAGTGCGTCAGTCCAAGCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108921 TCCAACAGGTGCTTGACCAAAGAGAGGAAGTGCGTCAGTCCAAGCAGCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGCAGCTGTACCTCCAGGCTTTGGAGAAAGAGGGCAGCCTCTTGTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108971 CTGCAGCTGTACCTCCAGGCTTTGGAGAAAGAGGGCAGCCTCTTGTCAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCAGGAAG         AGTCCAAAGCTGCCTTTGGTGAGGAGGTGGATG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 109021 GCAGGAAGGTA...CAGAGTCCAAAGCTGCCTTTGGTGAGGAGGTGGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CAGTAGACACGGGTATCAGCAGAGAGACCTCCTCGGACGTTGCGCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109283 CAGTAGACACGGGTATCAGCAGAGAGACCTCCTCGGACGTTGCGCTGGCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AGCCACATCCTTACTGCACTGAGGGAGAAGCAGGCTCCAGAGCTGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109333 AGCCACATCCTTACTGCACTGAGGGAGAAGCAGGCTCCAGAGCTGAGCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 ATCTAGTCAGGATTTGGAG         TTGGTTACCAAGGAAGACCCCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 109383 ATCTAGTCAGGATTTGGAGGTG...CAGTTGGTTACCAAGGAAGACCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AAGCACTGGCTGTTGCCTTGAACTGGGACATAAAGAAGACGGAGACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110779 AAGCACTGGCTGTTGCCTTGAACTGGGACATAAAGAAGACGGAGACTGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CAGGAGGCCTGTGAGCGGGAGCTCGCCCTGCGCCTGCAGCAGACGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110829 CAGGAGGCCTGTGAGCGGGAGCTCGCCCTGCGCCTGCAGCAGACGCAGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CTTGCATTCTCTCCGGAGCATCTCAGCAAGCAAGGCCTCACCACCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110879 CTTGCATTCTCTCCGGAGCATCTCAGCAAGCAAGGCCTCACCACCTGGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .
    956 ACCTGCAGAATCCTAAGCGAGCCAGACAGGATCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110929 ACCTGCAGAATCCTAAGCGAGCCAGACAGGATCCCACA