seq1 = pF1KE1798.tfa, 2406 bp
seq2 = pF1KE1798/gi568815584r_90772077.tfa (gi568815584r:90772077_91160434), 388358 bp

>pF1KE1798 2406
>gi568815584r:90772077_91160434 (Chr14)

(complement)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-175  (159276-159347)   100% ->
176-394  (181911-182129)   100% ->
395-510  (212885-213000)   100% ->
511-618  (217250-217357)   100% ->
619-702  (237239-237322)   100% ->
703-806  (240126-240229)   100% ->
807-957  (254136-254286)   100% ->
958-1119  (257466-257627)   100% ->
1120-1245  (259699-259824)   100% ->
1246-1379  (260194-260327)   100% ->
1380-1473  (261013-261106)   100% ->
1474-1644  (265852-266022)   100% ->
1645-1836  (269757-269948)   100% ->
1837-1996  (285075-285234)   100% ->
1997-2160  (286640-286803)   100% ->
2161-2406  (288113-288358)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGAGGAGGGTGGCAGCAGCGGCGGCGCCGCGGGGACCAGCGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGAGGAGGGTGGCAGCAGCGGCGGCGCCGCGGGGACCAGCGCGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCGGCGACGGAGGAGAGCAGCTCCTCACTGTCAAGCACGAGCTGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCGGCGACGGAGGAGAGCAGCTCCTCACTGTCAAGCACGAGCTGCGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTG         CTAATTTGACAGGACATGCTGAGAAGGTGGGAATAGAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGGTG...TAGCTAATTTGACAGGACATGCTGAGAAGGTGGGAATAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATTTTGAGCTCCTGAAGGTCCTAGGAACTGGAG         CTTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 159314 AATTTTGAGCTCCTGAAGGTCCTAGGAACTGGAGGTA...CAGCTTATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AAAAGTATTTCTAGTTCGTAAAATAAGTGGCCATGATACTGGAAAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181918 AAAAGTATTTCTAGTTCGTAAAATAAGTGGCCATGATACTGGAAAGCTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGCCATGAAAGTTTTGAAAAAGGCAACAATCGTTCAAAAGGCCAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181968 ATGCCATGAAAGTTTTGAAAAAGGCAACAATCGTTCAAAAGGCCAAAACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACAGAGCATACAAGGACAGAACGACAAGTCCTGGAACACATTAGGCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182018 ACAGAGCATACAAGGACAGAACGACAAGTCCTGGAACACATTAGGCAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCCATTTTTGGTAACATTACATTATGCTTTCCAGACAGAAACCAAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182068 GCCATTTTTGGTAACATTACATTATGCTTTCCAGACAGAAACCAAACTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATCTCATTTTAG         ATTATATAAATGGTGGTGAACTTTTTACT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 182118 ATCTCATTTTAGGTA...TAGATTATATAAATGGTGGTGAACTTTTTACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CATCTTTCTCAAAGAGAGCGTTTCACAGAGCATGAGGTGCAGATTTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212914 CATCTTTCTCAAAGAGAGCGTTTCACAGAGCATGAGGTGCAGATTTATGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGGAGAGATTGTGCTTGCCCTCGAACATCTCCACAAG         TTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 212964 TGGAGAGATTGTGCTTGCCCTCGAACATCTCCACAAGGTA...CAGTTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGATTATATATCGTGATATTAAGCTTGAGAATATTCTACTTGATTCTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217254 GGATTATATATCGTGATATTAAGCTTGAGAATATTCTACTTGATTCTAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGCCATGTGGTGCTGACAGATTTTGGTCTGAGTAAGGAGTTTGTGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217304 GGCCATGTGGTGCTGACAGATTTTGGTCTGAGTAAGGAGTTTGTGGCTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGAA         ACTGAAAGAGCATATTCCTTTTGTGGAACTATTGAAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217354 TGAAGTG...AAGACTGAAAGAGCATATTCCTTTTGTGGAACTATTGAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACATGGCACCAGATATTGTCAGAGGGGGAGATTCAGGACATGACAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 237276 ACATGGCACCAGATATTGTCAGAGGGGGAGATTCAGGACATGACAAGGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    703       GCAGTTGACTGGTGGAGTTTGGGTGTTCTAATGTATGAATTACT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237326 ...TAGGCAGTTGACTGGTGGAGTTTGGGTGTTCTAATGTATGAATTACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AACTGGAGCATCTCCTTTCACTGTTGATGGAGAAAAAAATTCCCAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240170 AACTGGAGCATCTCCTTTCACTGTTGATGGAGAAAAAAATTCCCAAGCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGATATCTAG         GAGAATATTAAAAAGTGAGCCTCCATATCCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 240220 AGATATCTAGGTA...CAGGAGAATATTAAAAAGTGAGCCTCCATATCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CAAGAAATGAGTGCTTTAGCGAAAGACCTAATTCAGCGTCTTTTGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 254167 CAAGAAATGAGTGCTTTAGCGAAAGACCTAATTCAGCGTCTTTTGATGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AGATCCCAAGAAGAGATTGGGATGTGGTCCACGTGATGCAGATGAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 254217 AGATCCCAAGAAGAGATTGGGATGTGGTCCACGTGATGCAGATGAAATCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AAGAACATCTCTTCTTTCAG         AAAATAAATTGGGATGATTTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 254267 AAGAACATCTCTTCTTTCAGGTG...TAGAAAATAAATTGGGATGATTTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GCCGCCAAAAAAGTGCCTGCACCATTTAAGCCAGTCATTCGAGATGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257487 GCCGCCAAAAAAGTGCCTGCACCATTTAAGCCAGTCATTCGAGATGAATT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AGATGTGAGTAACTTTGCAGAAGAGTTCACAGAAATGGATCCCACTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257537 AGATGTGAGTAACTTTGCAGAAGAGTTCACAGAAATGGATCCCACTTATT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CTCCCGCAGCCCTGCCCCAGAGTTCTGAGAAGCTGTTTCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 257587 CTCCCGCAGCCCTGCCCCAGAGTTCTGAGAAGCTGTTTCAGGTA...TAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GGCTATTCCTTTGTTGCTCCTTCCATCCTATTCAAGCGTAATGCAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 259699 GGCTATTCCTTTGTTGCTCCTTCCATCCTATTCAAGCGTAATGCAGCTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CATAGACCCTCTTCAGTTTCACATGGGAGTTGAACGTCCTGGAGTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 259749 CATAGACCCTCTTCAGTTTCACATGGGAGTTGAACGTCCTGGAGTGACAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 ATGTTGCCAGGAGTGCAATGATGAAG         GACTCTCCATTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 259799 ATGTTGCCAGGAGTGCAATGATGAAGGTA...CAGGACTCTCCATTCTAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CAACACTATGACCTAGATTTGAAGGACAAACCCCTGGGAGAAGGTAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 260209 CAACACTATGACCTAGATTTGAAGGACAAACCCCTGGGAGAAGGTAGTTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TTCAATTTGTCGAAAGTGTGTGCATAAAAAAAGTAACCAAGCTTTTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 260259 TTCAATTTGTCGAAAGTGTGTGCATAAAAAAAGTAACCAAGCTTTTGCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TCAAAATAATCAGCAAAAG         GATGGAAGCCAATACTCAAAAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 260309 TCAAAATAATCAGCAAAAGGTA...CAGGATGGAAGCCAATACTCAAAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GAAATAACAGCTCTGAAACTCTGTGAAGGACACCCCAATATTGTGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261035 GAAATAACAGCTCTGAAACTCTGTGAAGGACACCCCAATATTGTGAAGTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GCATGAAGTTTTTCATGATCAG         CTTCACACGTTTCTAGTGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 261085 GCATGAAGTTTTTCATGATCAGGTA...TAGCTTCACACGTTTCTAGTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TGGAACTTCTGAATGGAGGAGAACTGTTTGAGCGCATTAAGAAAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 265871 TGGAACTTCTGAATGGAGGAGAACTGTTTGAGCGCATTAAGAAAAAGAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CACTTCAGTGAGACGGAAGCCAGCTACATCATGAGGAAGCTTGTTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 265921 CACTTCAGTGAGACGGAAGCCAGCTACATCATGAGGAAGCTTGTTTCAGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 TGTAAGCCACATGCATGATGTTGGAGTGGTGCACAGGGATCTGAAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 265971 TGTAAGCCACATGCATGATGTTGGAGTGGTGCACAGGGATCTGAAACCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AG         AATTTATTGTTCACCGATGAAAATGACAATTTGGAAATT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 266021 AGGTA...CAGAATTTATTGTTCACCGATGAAAATGACAATTTGGAAATT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 AAAATAATTGATTTTGGATTTGCACGGCTAAAGCCACCGGATAATCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 269796 AAAATAATTGATTTTGGATTTGCACGGCTAAAGCCACCGGATAATCAGCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CCTGAAGACTCCATGCTTCACCCTTCATTATGCCGCCCCAGAGCTCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 269846 CCTGAAGACTCCATGCTTCACCCTTCATTATGCCGCCCCAGAGCTCTTGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 ATCAGAACGGCTACGATGAGTCCTGTGACCTGTGGAGCTTGGGCGTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 269896 ATCAGAACGGCTACGATGAGTCCTGTGACCTGTGGAGCTTGGGCGTCATT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 TTG         TACACAATGTTGTCAGGACAGGTTCCCTTCCAATCTCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 269946 TTGGTG...TAGTACACAATGTTGTCAGGACAGGTTCCCTTCCAATCTCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 TGACCGAAGTTTGACGTGTACCAGCGCGGTGGAAATCATGAAGAAAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 285113 TGACCGAAGTTTGACGTGTACCAGCGCGGTGGAAATCATGAAGAAAATTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 AAAAGGGAGATTTCTCCTTTGAAGGAGAAGCCTGGAAGAATGTATCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 285163 AAAAGGGAGATTTCTCCTTTGAAGGAGAAGCCTGGAAGAATGTATCCCAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GAGGCTAAAGATTTGATCCAAG         GACTTCTCACAGTAGATCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 285213 GAGGCTAAAGATTTGATCCAAGGTA...AAGGACTTCTCACAGTAGATCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 AAACAAAAGGCTTAAAATGTCTGGCTTGAGGTACAATGAATGGCTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 286659 AAACAAAAGGCTTAAAATGTCTGGCTTGAGGTACAATGAATGGCTACAAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 ATGGAAGTCAGCTGTCCTCCAATCCTCTGATGACTCCGGATATTCTAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 286709 ATGGAAGTCAGCTGTCCTCCAATCCTCTGATGACTCCGGATATTCTAGGA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 TCTTCCGGAGCTGCCGTGCATACCTGTGTGAAAGCAACCTTCCAC     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 286759 TCTTCCGGAGCTGCCGTGCATACCTGTGTGAAAGCAACCTTCCACGTA..

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161     GCCTTTAACAAATACAAGAGAGAGGGGTTTTGCCTTCAGAATGTTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 286809 .CAGGCCTTTAACAAATACAAGAGAGAGGGGTTTTGCCTTCAGAATGTTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 ATAAGGCCCCTTTGGCTAAGAGAAGAAAAATGAAAAAGACTAGCACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 288159 ATAAGGCCCCTTTGGCTAAGAGAAGAAAAATGAAAAAGACTAGCACCAGT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 ACCGAGACGCGCAGCAGTTCCAGTGAGAGTTCCCATTCTTCTTCCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 288209 ACCGAGACGCGCAGCAGTTCCAGTGAGAGTTCCCATTCTTCTTCCTCTCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 TTCTCACGGTAAAACTACACCCACCAAGACACTGCAGCCCAGCAATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 288259 TTCTCACGGTAAAACTACACCCACCAAGACACTGCAGCCCAGCAATCCTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 CCGACAGCAATAACCCGGAGACCCTCTTCCAGTTCTCGGACTCAGTAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 288309 CCGACAGCAATAACCCGGAGACCCTCTTCCAGTTCTCGGACTCAGTAGCT