seq1 = pF1KE1793.tfa, 912 bp
seq2 = pF1KE1793/gi568815579f_54806523.tfa (gi568815579f:54806523_55012868), 206346 bp

>pF1KE1793 912
>gi568815579f:54806523_55012868 (Chr19)

1-34  (99666-99699)   100% ->
35-70  (99777-99812)   100% ->
71-355  (100001-100285)   99% ->
356-634  (102723-103001)   99% ->
635-682  (103496-103543)   100% ->
683-733  (105646-105696)   100% ->
734-912  (106168-106346)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTTCCACACTCCCTGCCCTGCTCTGCGTCG         GGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  99666 ATGTCTTCCACACTCCCTGCCCTGCTCTGCGTCGGTG...CAGGGCTGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCTGAGTCAGAGGATCAGCGCCCAGCAGC         AGACTCTCCCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
  99784 TCTGAGTCAGAGGATCAGCGCCCAGCAGCGTG...CAGAGACTCTCCCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 AACCGTTCATCTGGGCCGAGCCCCATTTCATGGTTCCAAAGGAAAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100013 AACCGTTCATCTGGGCCGAGCCCCATTTCATGGTTCCAAAGGAAAAGCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTGACCATCTGTTGCCAGGGAAATTATGGGGCTGTTGAATACCAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100063 GTGACCATCTGTTGCCAGGGAAATTATGGGGCTGTTGAATACCAGCTGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTTTGAAGGAAGCCTTTTTGCCGTGGACAGACCAAAACCCCCTGAGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100113 CTTTGAAGGAAGCCTTTTTGCCGTGGACAGACCAAAACCCCCTGAGCGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTAACAAAGTCAAATTCTACATCCCGGACATGAACTCCCGCATGGCAGGG
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100163 TTAACAAAGTCCAATTCTACATCCCGGACATGAACTCCCGCATGGCAGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAATACAGCTGCATCTATCGGGTTGGGGAGCTCTGGTCAGAGCCCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100213 CAATACAGCTGCATCTATCGGGTTGGGGAGCTCTGGTCAGAGCCCAGCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTTGCTGGATCTGGTGGTAACAG         AAATGTATGACACACCCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100263 CTTGCTGGATCTGGTGGTAACAGGTA...TAGAAATGTATGACACACCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCCTCTCGGTTCATCCTGGACCCGAAGTGATCTCGGGAGAGAAGGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102741 CCCTCTCGGTTCATCCTGGACCCGAAGTGATCTCGGGAGAGAAGGTGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTCTACTGCCGTCTAGACACTGCAACAAGCATGTTCTTACTGCTCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102791 TTCTACTGCCGTCTAGACACTGCAACAAGCATGTTCTTACTGCTCAAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGGAAGATCCAGCCACGTACAGCGCGGATACGGGAAGGTCCAGGCGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102841 GGGAAGATCCAGCCACGTACAGCGCGGATACGGGAAGGTCCAGGCGGAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCCCCTGGGCCCTGTGACCACAGCCCACCGAGGGACATACCGATGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 102891 TCCCCCTGGGCCCTGTGACCACAGCCCACAGAGGGACATACCGATGTTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGCTCCTATAACAACCATGCCTGGTCTTTCCCCAGTGAGCCAGTGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102941 GGCTCCTATAACAACCATGCCTGGTCTTTCCCCAGTGAGCCAGTGAAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCTGGTCACAG         GCGACATTGAGAACACCAGCCTTGCACCTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 102991 CCTGGTCACAGGTG...CAGGCGACATTGAGAACACCAGCCTTGCACCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAGACCCCACCTTTCCTG         CAGACACTTGGGGCACCTACCTT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103526 AAGACCCCACCTTTCCTGGTG...CAGCAGACACTTGGGGCACCTACCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTAACCACAGAGACGGGACTCCAGAAAG         ACCATGCCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 105669 TTAACCACAGAGACGGGACTCCAGAAAGGTA...CAGACCATGCCCTCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGATCACACTGCCCAGAATCTCCTTCGGATGGGCCTGGCCTTTCTAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106181 GGATCACACTGCCCAGAATCTCCTTCGGATGGGCCTGGCCTTTCTAGTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGGTGGCTCTAGTGTGGTTCCTGGTTGAAGACTGGCTCAGCAGGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106231 TGGTGGCTCTAGTGTGGTTCCTGGTTGAAGACTGGCTCAGCAGGAAGAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ACTAGAGAGCGAGCCAGCAGAGCTTCCACTTGGGAAGGCAGGAGAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106281 ACTAGAGAGCGAGCCAGCAGAGCTTCCACTTGGGAAGGCAGGAGAAGGCT

    950     .    :    .
    897 GAACACACAGACTCTT
        ||||||||||||||||
 106331 GAACACACAGACTCTT