seq1 = pF1KE1776.tfa, 852 bp
seq2 = pF1KE1776/gi568815597r_6125083.tfa (gi568815597r:6125083_6335911), 210829 bp

>pF1KE1776 852
>gi568815597r:6125083_6335911 (Chr1)

(complement)

1-195  (100001-100195)   100% ->
196-284  (100938-101026)   100% ->
285-454  (102269-102438)   100% ->
455-672  (103793-104010)   100% ->
673-852  (110650-110829)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGCTGCGCGGCGCGGGCTCCGCCGGGCTCTGAGGCGCGTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGGCTGCGCGGCGCGGGCTCCGCCGGGCTCTGAGGCGCGTCTCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCGCCACCTTCCTGCTGGGCGCCTCGGTGCTCGCGCTGCCGCTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCGCCACCTTCCTGCTGGGCGCCTCGGTGCTCGCGCTGCCGCTGCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCGCGCCGGCCTGCAGGGCCGCACCGGGCTGGCGCTCTACGTGGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCGCGCCGGCCTGCAGGGCCGCACCGGGCTGGCGCTCTACGTGGCCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCAACGCGCTGCTGCTGCTGCTCTATCGGCCGCCTCGCTACCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100151 CTCAACGCGCTGCTGCTGCTGCTCTATCGGCCGCCTCGCTACCAGGTG..

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    196     ATAGCCATCCGAGCTTGTTTCCTGGGGTTTGTGTTCGGCTGCGGCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 .CAGATAGCCATCCGAGCTTGTTTCCTGGGGTTTGTGTTCGGCTGCGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGCTGCTAAGTTTTAGCCAGTCTTCTTGGAGTCACTTTGGCTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100984 CGCTGCTAAGTTTTAGCCAGTCTTCTTGGAGTCACTTTGGCTGGTA...T

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    285   GTACATGTGCTCCCTGTCATTGTTCCACTATTCTGAATACTTGGTGAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102267 AGGTACATGTGCTCCCTGTCATTGTTCCACTATTCTGAATACTTGGTGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGCAGTCAATAATCCCAAAAGTCTGTCCTTGGATTCCTTTCTCCTGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102317 AGCAGTCAATAATCCCAAAAGTCTGTCCTTGGATTCCTTTCTCCTGAATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACAGCCTGGAGTATACAGTAGCTGCTCTTTCTTCTTGGTTAGAGTTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102367 ACAGCCTGGAGTATACAGTAGCTGCTCTTTCTTCTTGGTTAGAGTTCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTTGAAAATATCTTTTGGCCAG         AACTGAAGCAGATTACCTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 102417 CTTGAAAATATCTTTTGGCCAGGTT...CAGAACTGAAGCAGATTACCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCTCAGTGTCACAGGGCTGCTGATGGTGGTCTTCGGAGAATGTCTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103812 GCTCAGTGTCACAGGGCTGCTGATGGTGGTCTTCGGAGAATGTCTGAGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGCGGCCATGTTTACAGCTGGCTCCAATTTCAACCACGTGGTACAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103862 AGGCGGCCATGTTTACAGCTGGCTCCAATTTCAACCACGTGGTACAGAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAAAAATCAGATACACATACTCTGGTGACCAGTGGAGTGTACGCTTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103912 GAAAAATCAGATACACATACTCTGGTGACCAGTGGAGTGTACGCTTGGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCGGCATCCTTCTTACGTCGGGTGGTTTTACTGGAGTATTGGAACTCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 103962 TCGGCATCCTTCTTACGTCGGGTGGTTTTACTGGAGTATTGGAACTCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    673         GTGATGCTGTGTAACCCCATCTGCGGCGTCAGCTATGCCCTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104012 TA...TAGGTGATGCTGTGTAACCCCATCTGCGGCGTCAGCTATGCCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACAGTGTGGCGATTCTTCCGCGATCGAACAGAAGAAGAAGAAATCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110692 ACAGTGTGGCGATTCTTCCGCGATCGAACAGAAGAAGAAGAAATCTCACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AATTCACTTTTTTGGAGAGGAGTACCTGGAGTATAAGAAGAGGGTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110742 AATTCACTTTTTTGGAGAGGAGTACCTGGAGTATAAGAAGAGGGTGCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .
    815 CGGGCCTGCCTTTCATAAAGGGGGTCAAGGTGGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110792 CGGGCCTGCCTTTCATAAAGGGGGTCAAGGTGGACCTG