seq1 = pF1KE1770.tfa, 831 bp
seq2 = pF1KE1770/gi568815579r_50956590.tfa (gi568815579r:50956590_51165067), 208478 bp

>pF1KE1770 831
>gi568815579r:50956590_51165067 (Chr19)

(complement)

1-52  (100001-100052)   100% ->
53-239  (104449-104635)   100% ->
240-508  (104975-105243)   100% ->
509-645  (106394-106530)   100% ->
646-831  (108293-108478)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGCCCCTGGCCCTAGTGATCGCCTCCCTGACCTTGGCCTTGTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGCCCCTGGCCCTAGTGATCGCCTCCCTGACCTTGGCCTTGTCAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AG         GTGTCTCCCAGGAGTCTTCCAAGGTTCTCAACACCAATG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGTA...CAGGTGTCTCCCAGGAGTCTTCCAAGGTTCTCAACACCAATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGACCAGTGGGTTTCTCCCAGGTGGCTACACCTGCTTCCCCCACTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104488 GGACCAGTGGGTTTCTCCCAGGTGGCTACACCTGCTTCCCCCACTCTCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCTGGCAGGCTGCCCTACTAGTGCAAGGGCGGCTACTCTGTGGGGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104538 CCCTGGCAGGCTGCCCTACTAGTGCAAGGGCGGCTACTCTGTGGGGGAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTGGTCCACCCCAAATGGGTCCTCACTGCCGCACACTGTCTAAAGGA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 104588 CCTGGTCCACCCCAAATGGGTCCTCACTGCCGCACACTGTCTAAAGGAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    240        GGGGCTCAAAGTTTACCTAGGCAAGCACGCCCTAGGGCGTGTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104638 A...CAGGGGGCTCAAAGTTTACCTAGGCAAGCACGCCCTAGGGCGTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAGCTGGTGAGCAGGTGAGGGAAGTTGTCCACTCTATCCCCCACCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105018 GAAGCTGGTGAGCAGGTGAGGGAAGTTGTCCACTCTATCCCCCACCCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ATACCGGAGAAGCCCCACCCACCTGAACCACGACCATGACATCATGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105068 ATACCGGAGAAGCCCCACCCACCTGAACCACGACCATGACATCATGCTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGAGCTGCAGTCCCCGGTCCAGCTCACAGGCTACATCCAAACCCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105118 TGGAGCTGCAGTCCCCGGTCCAGCTCACAGGCTACATCCAAACCCTGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTTTCCCACAACAACCGCCTAACCCCTGGCACCACCTGTCGGGTGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105168 CTTTCCCACAACAACCGCCTAACCCCTGGCACCACCTGTCGGGTGTCTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTGGGGCACCACCACCAGCCCCCAGG         TGAATTACCCCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 105218 CTGGGGCACCACCACCAGCCCCCAGGGTA...CAGTGAATTACCCCAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTCTACAATGTGCCAACATCCAACTTCGCTCAGATGAGGAGTGTCGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106409 CTCTACAATGTGCCAACATCCAACTTCGCTCAGATGAGGAGTGTCGTCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GTCTACCCAGGAAAGATCACTGACAACATGTTGTGTGCCGGCACAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106459 GTCTACCCAGGAAAGATCACTGACAACATGTTGTGTGCCGGCACAAAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGGTGGCAAAGACTCCTGTGAG         GGTGACTCTGGGGGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 106509 GGGTGGCAAAGACTCCTGTGAGGTG...CAGGGTGACTCTGGGGGCCCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGGTCTGTAACAGAACACTGTATGGCATCGTCTCCTGGGGAGACTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108312 TGGTCTGTAACAGAACACTGTATGGCATCGTCTCCTGGGGAGACTTCCCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TGTGGGCAACCTGACCGGCCTGGTGTCTACACCCGTGTCTCAAGATACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108362 TGTGGGCAACCTGACCGGCCTGGTGTCTACACCCGTGTCTCAAGATACGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCTGTGGATCCGTGAAACAATCCGAAAATATGAAACCCAGCAGCAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108412 CCTGTGGATCCGTGAAACAATCCGAAAATATGAAACCCAGCAGCAAAAAT

    850     .    :    .
    815 GGTTGAAGGGCCCACAA
        |||||||||||||||||
 108462 GGTTGAAGGGCCCACAA