seq1 = pF1KE1763.tfa, 807 bp
seq2 = pF1KE1763/gi568815579r_1298743.tfa (gi568815579r:1298743_1501476), 202734 bp

>pF1KE1763 807
>gi568815579r:1298743_1501476 (Chr19)

(complement)

1-181  (100001-100181)   100% ->
182-327  (101539-101684)   100% ->
328-391  (101890-101953)   100% ->
392-459  (102282-102349)   100% ->
460-807  (102451-102798)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGCCCCCAGCGCGACCCCCATCTTCGCGCCCGGCGAGAACTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCGCCCCCAGCGCGACCCCCATCTTCGCGCCCGGCGAGAACTGCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCGCGTGGGGGGCGGCGCCCGCGGCCTACGACGCAGCGGACACGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCGCGTGGGGGGCGGCGCCCGCGGCCTACGACGCAGCGGACACGCACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCGCATCCTGGGCAAGCCGGTGATGGAGCGCTGGGAGACCCCCTATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCGCATCCTGGGCAAGCCGGTGATGGAGCGCTGGGAGACCCCCTATATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACGCGCTGGCCGCCGCCGCCTCCTCCAAAG         GGGGCCGGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100151 CACGCGCTGGCCGCCGCCGCCTCCTCCAAAGGTA...CAGGGGGCCGGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTGGAGGTGGGCTTTGGCATGGCCATCGCAGCGTCAAAGGTGCAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101549 CCTGGAGGTGGGCTTTGGCATGGCCATCGCAGCGTCAAAGGTGCAGGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGCCCATTGATGAGCATTGGATCATCGAGTGCAATGACGGCGTCTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101599 CGCCCATTGATGAGCATTGGATCATCGAGTGCAATGACGGCGTCTTCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGGCTCCGGGACTGGGCCCCACGGCAGACACACAAG         GTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101649 CGGCTCCGGGACTGGGCCCCACGGCAGACACACAAGGTG...AAGGTCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCCCTTGAAAGGCCTGTGGGAGGATGTGGCACCCACCCTGCCTGACGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101895 CCCCTTGAAAGGCCTGTGGGAGGATGTGGCACCCACCCTGCCTGACGGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACTTTGATG         GGATCCTGTACGACACGTACCCACTCTCGGAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101945 ACTTTGATGGTG...CAGGGATCCTGTACGACACGTACCCACTCTCGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGACCTGGCACACACACCAGTTCAACTTCATCAAG         AACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102314 GAGACCTGGCACACACACCAGTTCAACTTCATCAAGGTG...CAGAACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGCCTTTCGCCTGCTGAAGCCGGGGGGCGTCCTCACCTACTGCAACCTCA
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102456 CGCCTTTCGCCTGCTGAAGCCGGGGGGCGTCCTCACCTACTGCAACCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCTCCTGGGGGGAGCTGATGAAGTCCAAGTACTCAGACATCACCATCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102506 CCTCCTGGGGGGAGCTGATGAAGTCCAAGTACTCAGACATCACCATCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTTGAGGTGCGCCCACCTGAAGTTCCCCATGGGTCTCCAGGAAGTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102556 TTTGAGGTGCGCCCACCTGAAGTTCCCCATGGGTCTCCAGGAAGTGACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGGATGGGGGTGGGAAGGGGCTGCTGGAGCCACCTTGCTACCTGGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102606 TGGATGGGGGTGGGAAGGGGCTGCTGGAGCCACCTTGCTACCTGGGGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTCCCTTCCTGACCCCCTGGGTGGGCTGGACTGTGCTGGTTCATTTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102656 GTCCCTTCCTGACCCCCTGGGTGGGCTGGACTGTGCTGGTTCATTTAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ATCAAAGTCCTTTGCCTGGCGCAGTGGCTGCCAGGAGCAGTGGCTCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102706 ATCAAAGTCCTTTGCCTGGCGCAGTGGCTGCCAGGAGCAGTGGCTCAGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTATAATCCCAGCACTGTGGAAGGCCGAGGTGGGCAGATTGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102756 CTATAATCCCAGCACTGTGGAAGGCCGAGGTGGGCAGATTGCT