seq1 = pF1KE1759.tfa, 789 bp
seq2 = pF1KE1759/gi568815591f_30652151.tfa (gi568815591f:30652151_30855848), 203698 bp

>pF1KE1759 789
>gi568815591f:30652151_30855848 (Chr7)

1-154  (100001-100154)   100% ->
155-362  (101581-101788)   100% ->
363-789  (103272-103698)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGGTGGCTTCACTGGGGGTGATGAGTACCAGAAGCACTTCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGGTGGCTTCACTGGGGGTGATGAGTACCAGAAGCACTTCCTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGGGACTACTTGGCTACTTACTACAGCTTCGATGGCAGCCCCTCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGGGACTACTTGGCTACTTACTACAGCTTCGATGGCAGCCCCTCACCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCCGAGATGCTGAAGTTTAACTTGGAATGTCTCCACAAGACCTTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCCGAGATGCTGAAGTTTAACTTGGAATGTCTCCACAAGACCTTCGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTG         GAGGCCTCCAAGGGGACACGCTGATTGACATTGGCTC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTGGTG...CAGGAGGCCTCCAAGGGGACACGCTGATTGACATTGGCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGGTCCTACCATCTACCAAGTTCTTGCTGCCTGTGATTCCTTCCAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101618 AGGTCCTACCATCTACCAAGTTCTTGCTGCCTGTGATTCCTTCCAAGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCACTCTCTCCGACTTTACCGACCGCAACCGGGAGGAGCTGGAAAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101668 TCACTCTCTCCGACTTTACCGACCGCAACCGGGAGGAGCTGGAAAAGTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGAAGAAGGAGCCGGGGGCCTATGACTGGACCCCAGCGGTGAAATTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101718 CTGAAGAAGGAGCCGGGGGCCTATGACTGGACCCCAGCGGTGAAATTCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTGTGAGCTGGAAGGAAACAG         CGGCCGATGGGAGGAGAAGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101768 CTGTGAGCTGGAAGGAAACAGGTA...CAGCGGCCGATGGGAGGAGAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGGAGAAGCTGCGGGCAGCGGTGAAGCGGGTGCTCAAGTGCGATGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103292 AGGAGAAGCTGCGGGCAGCGGTGAAGCGGGTGCTCAAGTGCGATGTCCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTGGGCAACCCGCTGGCCCCGGCTGTGTTGCCTCTCGCCGACTGTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103342 CTGGGCAACCCGCTGGCCCCGGCTGTGTTGCCTCTCGCCGACTGTGTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CACCCTGCTGGCCATGGAGTGTGCCTGCTGTAGCCTTGATGCCTACCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103392 CACCCTGCTGGCCATGGAGTGTGCCTGCTGTAGCCTTGATGCCTACCGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTGCCCTGTGCAACCTTGCCTCACTGCTCAAGCCGGGTGGCCACCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103442 CTGCCCTGTGCAACCTTGCCTCACTGCTCAAGCCGGGTGGCCACCTGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ACCACTGTCACGCTTCGGCTCCCGTCCTACATGGTGGGGAAGCGTGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103492 ACCACTGTCACGCTTCGGCTCCCGTCCTACATGGTGGGGAAGCGTGAATT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TTCCTGCGTGGCCCTGGAGAAAGGGGAGGTGGAGCAGGCTGTCCTGGATG
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 103542 TTCCTGCGTGGCCCTGGAGAAAGAGGAGGTGGAGCAGGCTGTCCTGGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CTGGCTTTGACATTGAACAGCTCCTACACAGTCCCCAGAGCTACTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103592 CTGGCTTTGACATTGAACAGCTCCTACACAGTCCCCAGAGCTACTCTGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ACCAATGCTGCCAACAATGGGGTCTGCTGCATTGTGGCTCGCAAGAAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 103642 ACCAATGCTGCCAACAATGGGGTCTGCTTCATTGTGGCTCGCAAGAAGCC

    800     .
    783 TGGGCCC
        |||||||
 103692 TGGGCCC