seq1 = pF1KE1755.tfa, 783 bp
seq2 = pF1KE1755/gi568815586r_108988209.tfa (gi568815586r:108988209_109192786), 204578 bp

>pF1KE1755 783
>gi568815586r:108988209_109192786 (Chr12)

(complement)

1-280  (100001-100280)   100% ->
281-479  (102580-102778)   100% ->
480-783  (104275-104578)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACAGATTCCTGGTGAAAGGGGCTCAAGGGGGCCTTTTGAGGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACAGATTCCTGGTGAAAGGGGCTCAAGGGGGCCTTTTGAGGAAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGAGCAAGAGCCAACTGGAGAAGAGCCAGCTGTGTTGGGAGGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGAGCAAGAGCCAACTGGAGAAGAGCCAGCTGTGTTGGGAGGAGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGAAAGCACAAGGAAGAGGCCCAGGAGAGAGGCCCCAGGGAATGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGAAAGCACAAGGAAGAGGCCCAGGAGAGAGGCCCCAGGGAATGGAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACTCAGCAGGCCCTAGCTGGCGGCACATTCGGGCTGAGGGCCTGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACTCAGCAGGCCCTAGCTGGCGGCACATTCGGGCTGAGGGCCTGGACTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGTTACACAGTCCTGTTTGGCAAAGCTGAGGCAGATGAGATTTTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGTTACACAGTCCTGTTTGGCAAAGCTGAGGCAGATGAGATTTTCCAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGTTGGAGAAAGAAGTAGAATATTTTACAG         GAGCACTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100251 AGTTGGAGAAAGAAGTAGAATATTTTACAGGTA...CAGGAGCACTGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGAGTCCAGGTATTCGGGAAGTGGCACAGTGTGCCCAGGAAGCAGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102591 AGAGTCCAGGTATTCGGGAAGTGGCACAGTGTGCCCAGGAAGCAGGCAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GTATGGCGACGCTGGGCTGACCTACACATTTTCAGGCCTCACGCTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102641 GTATGGCGACGCTGGGCTGACCTACACATTTTCAGGCCTCACGCTGTCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CAAAGCCCTGGATCCCAGTTCTAGAGCGCATCCGGGATCACGTCTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102691 CAAAGCCCTGGATCCCAGTTCTAGAGCGCATCCGGGATCACGTCTCTGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTGACTGGACAGACCTTCAACTTTGTGCTCATCAACAG         GTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 102741 GTGACTGGACAGACCTTCAACTTTGTGCTCATCAACAGGTG...CAGGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TAAAGATGGCTGTGACCACATCGGGGAGCACCGAGATGATGAAAGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104278 TAAAGATGGCTGTGACCACATCGGGGAGCACCGAGATGATGAAAGAGAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGGCCCCTGGGAGCCCCATTGCCTCTGTCTCCTTCGGTGCCTGCAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104328 TGGCCCCTGGGAGCCCCATTGCCTCTGTCTCCTTCGGTGCCTGCAGAGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TTTGTCTTCCGGCATAAGGATTCCCGTGGGAAAAGCCCCTCCAGGAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104378 TTTGTCTTCCGGCATAAGGATTCCCGTGGGAAAAGCCCCTCCAGGAGGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGCGGTGGTCAGGCTGCCGCTGGCCCACGGGAGCTTACTAATGATGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104428 GGCGGTGGTCAGGCTGCCGCTGGCCCACGGGAGCTTACTAATGATGAACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACCCGACCAACACGCACTGGTACCACAGTCTTCCCGTGAGAAAGAAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104478 ACCCGACCAACACGCACTGGTACCACAGTCTTCCCGTGAGAAAGAAGGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CTGGCTCCACGGGTGAATCTGACTTTTCGTAAAATTTTGCTTACTAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104528 CTGGCTCCACGGGTGAATCTGACTTTTCGTAAAATTTTGCTTACTAAAAA

    800 
    783 A
        |
 104578 A