seq1 = pF1KE1754.tfa, 393 bp
seq2 = pF1KE1754/gi568815579r_47121805.tfa (gi568815579r:47121805_47332602), 210798 bp

>pF1KE1754 393
>gi568815579r:47121805_47332602 (Chr19)

(complement)

1-88  (100001-100088)   100% ->
89-279  (105849-106039)   100% ->
280-393  (110685-110798)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAATTTGGCATGGGGTCTGCCCAGGCATGTCCATGCCAGGTGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAATTTGGCATGGGGTCTGCCCAGGCATGTCCATGCCAGGTGCCCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGCTTCCACGACGTGGGTCCCCTGCCAGATTTGTG         GTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100051 GGCTGCTTCCACGACGTGGGTCCCCTGCCAGATTTGTGGTG...AAGGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTCAGCCCTCGCTCTCGCTGGCGGAGCAGCACCTGGAGTCGCCCGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105852 CTCAGCCCTCGCTCTCGCTGGCGGAGCAGCACCTGGAGTCGCCCGTGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGCGCCCCGGGGGCTCTGGCGGGCGGTCCCACCCAGGCGGCCCCGGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105902 AGCGCCCCGGGGGCTCTGGCGGGCGGTCCCACCCAGGCGGCCCCGGGAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCGCGGGGAGGAGGAACAGTGGGCCCGGGAGATCGGGGCCCAGCTGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105952 CCGCGGGGAGGAGGAACAGTGGGCCCGGGAGATCGGGGCCCAGCTGCGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGATGGCGGACGACCTCAACGCACAGTACGAGCGGCGG         AGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 106002 GGATGGCGGACGACCTCAACGCACAGTACGAGCGGCGGGTG...CAGAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAAGAGGAGCAGCAGCGGCACCGCCCCTCACCCTGGAGGGTCCTGTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110688 CAAGAGGAGCAGCAGCGGCACCGCCCCTCACCCTGGAGGGTCCTGTACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCTCATCATGGGACTCCTGCCCTTACCCAGGGGCCACAGAGCCCCCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110738 TCTCATCATGGGACTCCTGCCCTTACCCAGGGGCCACAGAGCCCCCGAGA

    400     .    :
    383 TGGAGCCCAAT
        |||||||||||
 110788 TGGAGCCCAAT