seq1 = pF1KE1753.tfa, 780 bp
seq2 = pF1KE1753/gi568815590f_85365271.tfa (gi568815590f:85365271_85580786), 215516 bp

>pF1KE1753 780
>gi568815590f:85365271_85580786 (Chr8)

1-34  (98812-98845)   100% ->
35-232  (100002-100199)   100% ->
233-351  (108423-108541)   100% ->
352-444  (109054-109146)   100% ->
445-507  (110528-110590)   100% ->
508-663  (111850-112005)   99% ->
664-780  (115400-115516)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCATCACTGGGGGTACGGCAAACACAACG         GACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  98812 ATGTCCCATCACTGGGGGTACGGCAAACACAACGGTG...CAGGACCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GCACTGGCATAAGGACTTCCCCATTGCCAAGGGAGAGCGCCAGTCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100009 GCACTGGCATAAGGACTTCCCCATTGCCAAGGGAGAGCGCCAGTCCCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGACATCGACACTCATACAGCCAAGTATGACCCTTCCCTGAAGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100059 TTGACATCGACACTCATACAGCCAAGTATGACCCTTCCCTGAAGCCCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCTGTTTCCTATGATCAAGCAACTTCCCTGAGGATCCTCAACAATGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100109 TCTGTTTCCTATGATCAAGCAACTTCCCTGAGGATCCTCAACAATGGTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCTTTCAACGTGGAGTTTGATGACTCTCAGGACAAAGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100159 TGCTTTCAACGTGGAGTTTGATGACTCTCAGGACAAAGCAGGTC...TAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCTCAAGGGAGGACCCCTGGATGGCACTTACAGATTGATTCAGTTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108423 TGCTCAAGGGAGGACCCCTGGATGGCACTTACAGATTGATTCAGTTTCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTCACTGGGGTTCACTTGATGGACAAGGTTCAGAGCATACTGTGGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108473 TTTCACTGGGGTTCACTTGATGGACAAGGTTCAGAGCATACTGTGGATAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAAGAAATATGCTGCAGAA         CTTCACTTGGTTCACTGGAACA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 108523 AAAGAAATATGCTGCAGAAGTA...TAGCTTCACTTGGTTCACTGGAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCAAATATGGGGATTTTGGGAAAGCTGTGCAGCAACCTGATGGACTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109076 CCAAATATGGGGATTTTGGGAAAGCTGTGCAGCAACCTGATGGACTGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTTCTAGGTATTTTTTTGAAG         GTTGGCAGCGCTAAACCGGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 109126 GTTCTAGGTATTTTTTTGAAGGTT...TAGGTTGGCAGCGCTAAACCGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCTTCAGAAAGTTGTTGATGTGCTGGATTCCATTAAAACAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 110548 CCTTCAGAAAGTTGTTGATGTGCTGGATTCCATTAAAACAAAGGTA...T

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    508   GGCAAGAGTGCTGACTTCACTAACTTCGATCCTCGTGGCCTCCTTCCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111848 AGGGCAAGAGTGCTGACTTCACTAACTTCGATCCTCGTGGCCTCCTTCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAATCCCTGGATTACTGGACCTACCCAGGCTCACTGACCACCCCTCCTCT
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111898 GAATCCTTGGATTACTGGACCTACCCAGGCTCACTGACCACCCCTCCTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCTGGAATGTGTGACCTGGATTGTGCTCAAGGAACCCATCAGCGTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111948 TCTGGAATGTGTGACCTGGATTGTGCTCAAGGAACCCATCAGCGTCAGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GCGAGCAG         GTGTTGAAATTCCGTAAACTTAACTTCAATGGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 111998 GCGAGCAGGTT...TAGGTGTTGAAATTCCGTAAACTTAACTTCAATGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAGGGTGAACCCGAAGAACTGATGGTGGACAACTGGCGCCCAGCTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115433 GAGGGTGAACCCGAAGAACTGATGGTGGACAACTGGCGCCCAGCTCAGCC

    800     .    :    .    :    .    :
    747 ACTGAAGAACAGGCAAATCAAAGCTTCCTTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115483 ACTGAAGAACAGGCAAATCAAAGCTTCCTTCAAA