seq1 = pF1KE1752.tfa, 771 bp
seq2 = pF1KE1752/gi568815579f_444072.tfa (gi568815579f:444072_649788), 205717 bp

>pF1KE1752 771
>gi568815579f:444072_649788 (Chr19)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-212  (103209-103365)   100% ->
213-348  (104471-104606)   100% ->
349-612  (104851-105114)   100% ->
613-771  (105559-105717)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCCTGCGTGTCTTCACTGCTGGTGCTGGCCCTGGGGGCCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGCCTGCGTGTCTTCACTGCTGGTGCTGGCCCTGGGGGCCCTGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTAG         GCAGCTCCTTTGGGACCCAGATCATCGGGGGCCGGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTAGGTG...CAGGCAGCTCCTTTGGGACCCAGATCATCGGGGGCCGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGTGATCCCCCACTCGCGCCCGTACATGGCCTCACTGCAGAGAAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103245 AGGTGATCCCCCACTCGCGCCCGTACATGGCCTCACTGCAGAGAAATGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCCACCTGTGCGGGGGTGTCCTGGTGCACCCAAAGTGGGTGCTGACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103295 TCCCACCTGTGCGGGGGTGTCCTGGTGCACCCAAAGTGGGTGCTGACGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCCCACTGCCTGGCCCAGCG         GATGGCCCAGCTGAGGCTGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 103345 TGCCCACTGCCTGGCCCAGCGGTG...CAGGATGGCCCAGCTGAGGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCTGGGGCTCCACACCCTGGACAGCCCCGGTCTCACCTTCCACATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104491 TGCTGGGGCTCCACACCCTGGACAGCCCCGGTCTCACCTTCCACATCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCAGCCATCCAGCACCCTCGCTACAAGCCCGTCCCTGCCCTGGAGAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104541 GCAGCCATCCAGCACCCTCGCTACAAGCCCGTCCCTGCCCTGGAGAACGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTCGCGCTGCTTCAG         CTGGACGGGAAAGTGAAGCCCAGCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 104591 CCTCGCGCTGCTTCAGGTG...TAGCTGGACGGGAAAGTGAAGCCCAGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGACCATCCGGCCGTTGGCCCTGCCCAGTAAGCGCCAGGTGGTGGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104876 GGACCATCCGGCCGTTGGCCCTGCCCAGTAAGCGCCAGGTGGTGGCAGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGGACTCGGTGCAGCATGGCCGGCTGGGGGCTGACCCACCAGGGCGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104926 GGGACTCGGTGCAGCATGGCCGGCTGGGGGCTGACCCACCAGGGCGGGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTGTCCCGGGTGCTGCGGGAGCTGGACCTCCAAGTGCTGGACACCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104976 CCTGTCCCGGGTGCTGCGGGAGCTGGACCTCCAAGTGCTGGACACCCGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGTGTAACAACAGCCGCTTCTGGAACGGCAGCCTCTCCCCCAGCATGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105026 TGTGTAACAACAGCCGCTTCTGGAACGGCAGCCTCTCCCCCAGCATGGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGCCTGGCGGCCGACTCCAAGGACCAGGCTCCCTGCAAG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 105076 TGCCTGGCGGCCGACTCCAAGGACCAGGCTCCCTGCAAGGTG...CAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGACTCGGGCGGGCCCCTGGTGTGTGGCAAAGGCCGGGTGTTGGCCGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 105561 TGACTCGGGCGGGCCCCTGGTGTGTGGCAAAGGCCGGGTGTTGGCCAGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCCTGTCCTTCAGCTCCAGGGTCTGCACTGACATCTTCAAGCCTCCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105611 TCCTGTCCTTCAGCTCCAGGGTCTGCACTGACATCTTCAAGCCTCCCGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCCACCGCTGTGGCGCCTTACGTGTCCTGGATCAGGAAGGTCACCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105661 GCCACCGCTGTGGCGCCTTACGTGTCCTGGATCAGGAAGGTCACCGGCCG

    800     .
    765 ATCGGCC
        |||||||
 105711 ATCGGCC