seq1 = pF1KE1750.tfa, 759 bp
seq2 = pF1KE1750/gi568815579f_759690.tfa (gi568815579f:759690_963235), 203546 bp

>pF1KE1750 759
>gi568815579f:759690_963235 (Chr19)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-212  (100928-101084)   100% ->
213-357  (101172-101316)   100% ->
358-615  (102010-102267)   100% ->
616-759  (103403-103546)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACAGCTGGGAGCGCCTGGCAGTTCTGGTCCTCCTAGGAGCGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACAGCTGGGAGCGCCTGGCAGTTCTGGTCCTCCTAGGAGCGGCCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCG         CGGCGCCGCCCCGTGGTCGGATCCTGGGCGGCAGAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCGGTG...CAGCGGCGCCGCCCCGTGGTCGGATCCTGGGCGGCAGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGCCGAGGCGCACGCGCGGCCCTACATGGCGTCGGTGCAGCTGAACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100964 AGGCCGAGGCGCACGCGCGGCCCTACATGGCGTCGGTGCAGCTGAACGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGCACCTGTGCGGCGGCGTCCTGGTGGCGGAGCAGTGGGTGCTGAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101014 GCGCACCTGTGCGGCGGCGTCCTGGTGGCGGAGCAGTGGGTGCTGAGCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCGCACTGCCTGGAGGACGC         GGCCGACGGGAAGGTGCAGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101064 GGCGCACTGCCTGGAGGACGCGTG...CAGGGCCGACGGGAAGGTGCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTCTCCTGGGCGCGCACTCCCTGTCGCAGCCGGAGCCCTCCAAGCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101192 TTCTCCTGGGCGCGCACTCCCTGTCGCAGCCGGAGCCCTCCAAGCGCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACGACGTGCTCCGCGCAGTGCCCCACCCGGACAGCCAGCCCGACACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101242 TACGACGTGCTCCGCGCAGTGCCCCACCCGGACAGCCAGCCCGACACCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGACCACGACCTCCTGCTGCTACAG         CTGTCGGAGAAGGCCA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101292 CGACCACGACCTCCTGCTGCTACAGGTC...CAGCTGTCGGAGAAGGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CACTGGGCCCTGCTGTGCGCCCCCTGCCCTGGCAGCGCGTGGACCGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102026 CACTGGGCCCTGCTGTGCGCCCCCTGCCCTGGCAGCGCGTGGACCGCGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGGCACCGGGAACTCTCTGCGACGTGGCCGGCTGGGGCATAGTCAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102076 GTGGCACCGGGAACTCTCTGCGACGTGGCCGGCTGGGGCATAGTCAACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGCGGGCCGCCGCCCGGACAGCCTGCAGCACGTGCTCTTGCCAGTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102126 CGCGGGCCGCCGCCCGGACAGCCTGCAGCACGTGCTCTTGCCAGTGCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACCGCGCCACCTGCAACCGGCGCACGCACCACGACGGCGCCATCACCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102176 ACCGCGCCACCTGCAACCGGCGCACGCACCACGACGGCGCCATCACCGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGCTTGATGTGCGCGGAGAGCAATCGCCGGGACAGCTGCAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 102226 CGCTTGATGTGCGCGGAGAGCAATCGCCGGGACAGCTGCAAGGTG...CA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    616  GGTGACTCCGGGGGCCCGCTGGTGTGCGGGGGCGTGCTCGAGGGCGTGG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103402 GGGTGACTCCGGGGGCCCGCTGGTGTGCGGGGGCGTGCTCGAGGGCGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCACCTCGGGCTCGCGCGTTTGCGGCAACCGCAAGAAGCCCGGGATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103452 TCACCTCGGGCTCGCGCGTTTGCGGCAACCGCAAGAAGCCCGGGATCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    715 ACCCGCGTGGCGAGCTATGCGGCCTGGATCGACAGCGTCCTGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103502 ACCCGCGTGGCGAGCTATGCGGCCTGGATCGACAGCGTCCTGGCC