seq1 = pF1KE1749.tfa, 756 bp
seq2 = pF1KE1749/gi568815597f_206989542.tfa (gi568815597f:206989542_207199926), 210385 bp

>pF1KE1749 756
>gi568815597f:206989542_207199926 (Chr1)

1-58  (99991-100048)   100% ->
59-232  (100767-100940)   100% ->
233-409  (102103-102279)   100% ->
410-503  (106981-107074)   100% ->
504-618  (108609-108723)   100% ->
619-756  (110248-110385)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTTTTTGGTGTGCGTGCTGTCTTATGGTTGCGTGGCGAGTTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99991 ATGTTTTTTTGGTGTGCGTGCTGTCTTATGGTTGCGTGGCGAGTTTCTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCAGATG         CAGAGCACTGTCCAGAGCTTCCTCCAGTGGACA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100041 TTCAGATGGTA...CAGCAGAGCACTGTCCAGAGCTTCCTCCAGTGGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATAGCATATTTGTCGCAAAGGAGGTGGAAGGACAGATTCTGGGGACTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100800 ATAGCATATTTGTCGCAAAGGAGGTGGAAGGACAGATTCTGGGGACTTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTTTGTATCAAGGGCTACCACCTGGTAGGAAAGAAGACCCTTTTTTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100850 GTTTGTATCAAGGGCTACCACCTGGTAGGAAAGAAGACCCTTTTTTGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCCTCTAAGGAGTGGGATAACACCACTACTGAGTGCCGCT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100900 TGCCTCTAAGGAGTGGGATAACACCACTACTGAGTGCCGCTGTA...CAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGGCCACTGTCCTGATCCTGTGCTGGTGAATGGAGAGTTCAGTTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102103 TGGGCCACTGTCCTGATCCTGTGCTGGTGAATGGAGAGTTCAGTTCTTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGGCCTGTGAATGTAAGTGACAAAATCACGTTTATGTGCAATGACCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102153 GGGCCTGTGAATGTAAGTGACAAAATCACGTTTATGTGCAATGACCACTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATCCTCAAGGGCAGCAATCGGAGCCAGTGTCTAGAGGACCACACCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102203 CATCCTCAAGGGCAGCAATCGGAGCCAGTGTCTAGAGGACCACACCTGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CACCTCCCTTTCCCATCTGCAAAAGTA         GGGACTGTGACCCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102253 CACCTCCCTTTCCCATCTGCAAAAGTAGTA...CAGGGGACTGTGACCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCTGGGAATCCAGTTCATGGCTATTTTGAAGGAAATAACTTCACCTTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106995 CCTGGGAATCCAGTTCATGGCTATTTTGAAGGAAATAACTTCACCTTAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ATCCACCATTAGTTATTACTGTGAAGACAG         GTACTACTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 107045 ATCCACCATTAGTTATTACTGTGAAGACAGGTA...CAGGTACTACTTAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGGCGTGCAGGAGCAGCAATGCGTTGATGGGGAGTGGAGCAGTGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108620 TGGGCGTGCAGGAGCAGCAATGCGTTGATGGGGAGTGGAGCAGTGCACTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCAGTCTGCAAGTTGATCCAGGAAGCTCCCAAACCAGAGTGTGAGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108670 CCAGTCTGCAAGTTGATCCAGGAAGCTCCCAAACCAGAGTGTGAGAAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACTT         CTTGCCTTTCAGGAGAGTAAGAACCTCTGCGAAGCCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108720 ACTTGTA...CAGCTTGCCTTTCAGGAGAGTAAGAACCTCTGCGAAGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGAGAACTTTATGCAACAATTAAAGGAAAGTGGCATGACAATGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110285 TGGAGAACTTTATGCAACAATTAAAGGAAAGTGGCATGACAATGGAGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTAAAATATTCTCTGGAGCTGAAGAAAGCTGAGTTGAAGGCAAAATTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110335 CTAAAATATTCTCTGGAGCTGAAGAAAGCTGAGTTGAAGGCAAAATTGTT

    800 
    756 G
        |
 110385 G