seq1 = pF1KE1748.tfa, 753 bp
seq2 = pF1KE1748/gi568815589r_114690455.tfa (gi568815589r:114690455_114906012), 215558 bp

>pF1KE1748 753
>gi568815589r:114690455_114906012 (Chr9)

(complement)

1-210  (100001-100210)   100% ->
211-253  (112445-112487)   100% ->
254-301  (113559-113606)   100% ->
302-753  (115107-115558)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGAGGATCTGGGACTGAGCTTTGGGGAAACAGCCAGTGTGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGAGGATCTGGGACTGAGCTTTGGGGAAACAGCCAGTGTGGAAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCCAGAGCACGGCAGCTGCAGGCCCAAGGCCAGGAGCAGCAGCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCCAGAGCACGGCAGCTGCAGGCCCAAGGCCAGGAGCAGCAGCGCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTGGGCTCTCACCTGCTGCCTGGTGTTGCTCCCCTTCCTTGCAGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTGGGCTCTCACCTGCTGCCTGGTGTTGCTCCCCTTCCTTGCAGGACTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCACATACCTGCTTGTCAGCCAGCTCCGGGCCCAGGGAGAGGCCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCACATACCTGCTTGTCAGCCAGCTCCGGGCCCAGGGAGAGGCCTGTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCAGTTCCAG         GCTCTAAAAGGACAGGAGTTTGCACCTTCAC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCAGTTCCAGGTA...TAGGCTCTAAAAGGACAGGAGTTTGCACCTTCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATCAGCAAGTTT         ATGCACCTCTTAGAGCAGACGGAGATAAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 112476 ATCAGCAAGTTTGTA...CAGATGCACCTCTTAGAGCAGACGGAGATAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCAAGGGCACACCTGACAG         TTGTGAGACAAACTCCCACACA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 113588 CCAAGGGCACACCTGACAGGTA...CAGTTGTGAGACAAACTCCCACACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCACTTTAAAAATCAGTTCCCAGCTCTGCACTGGGAACATGAACTAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115129 GCACTTTAAAAATCAGTTCCCAGCTCTGCACTGGGAACATGAACTAGGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGCCTTCACCAAGAACCGAATGAACTATACCAACAAATTCCTGCTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115179 TGGCCTTCACCAAGAACCGAATGAACTATACCAACAAATTCCTGCTGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCAGAGTCGGGAGACTACTTCATTTACTCCCAGGTCACATTCCGTGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115229 CCAGAGTCGGGAGACTACTTCATTTACTCCCAGGTCACATTCCGTGGGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GACCTCTGAGTGCAGTGAAATCAGACAAGCAGGCCGACCAAACAAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115279 GACCTCTGAGTGCAGTGAAATCAGACAAGCAGGCCGACCAAACAAGCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACTCCATCACTGTGGTCATCACCAAGGTAACAGACAGCTACCCTGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115329 ACTCCATCACTGTGGTCATCACCAAGGTAACAGACAGCTACCCTGAGCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACCCAGCTCCTCATGGGGACCAAGTCTGTGTGCGAAGTAGGTAGCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 115379 ACCCAGCTCCTCATGGGGACCAAGTCTGTATGCGAAGTAGGTAGCAACTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GTTCCAGCCCATCTACCTCGGAGCCATGTTCTCCTTGCAAGAAGGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115429 GTTCCAGCCCATCTACCTCGGAGCCATGTTCTCCTTGCAAGAAGGGGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGCTAATGGTGAACGTCAGTGACATCTCTTTGGTGGATTACACAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115479 AGCTAATGGTGAACGTCAGTGACATCTCTTTGGTGGATTACACAAAAGAA

    750     .    :    .    :    .    :
    724 GATAAAACCTTCTTTGGAGCCTTCTTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 115529 GATAAAACCTTCTTTGGAGCCTTCTTACTA