seq1 = pF1KE1747.tfa, 753 bp
seq2 = pF1KE1747/gi568815586r_4270346.tfa (gi568815586r:4270346_4479582), 209237 bp

>pF1KE1747 753
>gi568815586r:4270346_4479582 (Chr12)

(complement)

1-211  (100001-100211)   100% ->
212-315  (106886-106989)   100% ->
316-753  (108800-109237)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGGGGGCCCGCCTCAGGCTCTGGGTCTGTGCCTTGTGCAGCGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGGGGGCCCGCCTCAGGCTCTGGGTCTGTGCCTTGTGCAGCGTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCATGAGCGTCCTCAGAGCCTATCCCAATGCCTCCCCACTGCTCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCATGAGCGTCCTCAGAGCCTATCCCAATGCCTCCCCACTGCTCGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAGCTGGGGTGGCCTGATCCACCTGTACACAGCCACAGCCAGGAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAGCTGGGGTGGCCTGATCCACCTGTACACAGCCACAGCCAGGAACAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACCACCTGCAGATCCACAAGAATGGCCATGTGGATGGCGCACCCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACCACCTGCAGATCCACAAGAATGGCCATGTGGATGGCGCACCCCATCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GACCATCTACA         GTGCCCTGATGATCAGATCAGAGGATGCTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GACCATCTACAGTG...TAGGTGCCCTGATGATCAGATCAGAGGATGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCTTTGTGGTGATTACAGGTGTGATGAGCAGAAGATACCTCTGCATGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106916 GCTTTGTGGTGATTACAGGTGTGATGAGCAGAAGATACCTCTGCATGGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCAGAGGCAACATTTTTGGATCA         CACTATTTCGACCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 106966 TTCAGAGGCAACATTTTTGGATCAGTG...CAGCACTATTTCGACCCGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAACTGCAGGTTCCAACACCAGACGCTGGAAAACGGGTACGACGTCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108817 GAACTGCAGGTTCCAACACCAGACGCTGGAAAACGGGTACGACGTCTACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACTCTCCTCAGTATCACTTCCTGGTCAGTCTGGGCCGGGCGAAGAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108867 ACTCTCCTCAGTATCACTTCCTGGTCAGTCTGGGCCGGGCGAAGAGAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTCCTGCCAGGCATGAACCCACCCCCGTACTCCCAGTTCCTGTCCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108917 TTCCTGCCAGGCATGAACCCACCCCCGTACTCCCAGTTCCTGTCCCGGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GAACGAGATCCCCCTAATTCACTTCAACACCCCCATACCACGGCGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108967 GAACGAGATCCCCCTAATTCACTTCAACACCCCCATACCACGGCGGCACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCCGGAGCGCCGAGGACGACTCGGAGCGGGACCCCCTGAACGTGCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109017 CCCGGAGCGCCGAGGACGACTCGGAGCGGGACCCCCTGAACGTGCTGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CCCCGGGCCCGGATGACCCCGGCCCCGGCCTCCTGTTCACAGGAGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109067 CCCCGGGCCCGGATGACCCCGGCCCCGGCCTCCTGTTCACAGGAGCTCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GAGCGCCGAGGACAACAGCCCGATGGCCAGTGACCCATTAGGGGTGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109117 GAGCGCCGAGGACAACAGCCCGATGGCCAGTGACCCATTAGGGGTGGTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GGGGCGGTCGAGTGAACACGCACGCTGGGGGAACGGGCCCGGAAGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109167 GGGGCGGTCGAGTGAACACGCACGCTGGGGGAACGGGCCCGGAAGGCTGC

    750     .    :    .    :
    733 CGCCCCTTCGCCAAGTTCATC
        |||||||||||||||||||||
 109217 CGCCCCTTCGCCAAGTTCATC