seq1 = pF1KE1735.tfa, 726 bp
seq2 = pF1KE1735/gi568815579f_14953480.tfa (gi568815579f:14953480_15156086), 202607 bp

>pF1KE1735 726
>gi568815579f:14953480_15156086 (Chr19)

1-27  (98773-98799)   100% ->
28-177  (100003-100152)   100% ->
178-403  (100254-100479)   100% ->
404-520  (101679-101795)   100% ->
521-624  (101951-102054)   100% ->
625-726  (102506-102607)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCAATCCGCGGTCTTTGGAAGAG         GAGAAATATGATAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
  98773 ATGAGCAATCCGCGGTCTTTGGAAGAGGTA...CAGGAGAAATATGATAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GTCAGGTGCCCGCCTGGCCCTAATACTGTGTGTCACCAAAGCCCGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100017 GTCAGGTGCCCGCCTGGCCCTAATACTGTGTGTCACCAAAGCCCGGGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTTCCGAAGAAGACCTGGATGCTCTGGAACACATGTTTCGGCAGCTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100067 GTTCCGAAGAAGACCTGGATGCTCTGGAACACATGTTTCGGCAGCTGAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCGAAAGCACCATGAAAAGAGACCCCACTGCCGAG         CAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100117 TTCGAAAGCACCATGAAAAGAGACCCCACTGCCGAGGTA...CAGCAATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCAGGAAGAGCTGGAAAAATTCCAGCAGGCCATCGATTCCCGGGAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100259 CCAGGAAGAGCTGGAAAAATTCCAGCAGGCCATCGATTCCCGGGAAGATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCGTCAGTTGTGCCTTCGTGGTACTCATGGCTCACGGGAGGGAAGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100309 CCGTCAGTTGTGCCTTCGTGGTACTCATGGCTCACGGGAGGGAAGGCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTCAAGGGAGAAGATGGGGAGATGGTCAAGCTGGAGAATCTCTTCGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100359 CTCAAGGGAGAAGATGGGGAGATGGTCAAGCTGGAGAATCTCTTCGAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTGAACAACAAGAACTGCCAGGCCCTGCGAGCTAAGCCCAAGGTGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100409 CCTGAACAACAAGAACTGCCAGGCCCTGCGAGCTAAGCCCAAGGTGTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCATACAGGCCTGTCGAGGAG         AACAAAGGGACCCCGGTGAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100459 TCATACAGGCCTGTCGAGGAGGTG...CAGAACAAAGGGACCCCGGTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACAGTAGGTGGAGATGAGATTGTGATGGTCATCAAAGACAGCCCACAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101699 ACAGTAGGTGGAGATGAGATTGTGATGGTCATCAAAGACAGCCCACAAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATCCCAACATACACAGATGCCTTGCACGTTTATTCCACGGTAGAGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101749 CATCCCAACATACACAGATGCCTTGCACGTTTATTCCACGGTAGAGGGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    521       GATACATCGCCTACCGACATGATCAGAAAGGCTCATGCTTTATC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101799 ...CAGGATACATCGCCTACCGACATGATCAGAAAGGCTCATGCTTTATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGACCCTGGTGGATGTGTTCACGAAGAGGAAAGGACATATCTTGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101995 CAGACCCTGGTGGATGTGTTCACGAAGAGGAAAGGACATATCTTGGAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TCTGACAGAG         GTGACCCGGCGGATGGCAGAAGCAGAGCTGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 102045 TCTGACAGAGGTG...CAGGTGACCCGGCGGATGGCAGAAGCAGAGCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTCAAGAAGGAAAAGCAAGGAAAACGAACCCTGAAATCCAAAGCACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102537 TTCAAGAAGGAAAAGCAAGGAAAACGAACCCTGAAATCCAAAGCACCCTC

    750     .    :    .    :
    706 CGGAAACGGCTGTATCTGCAG
        |||||||||||||||||||||
 102587 CGGAAACGGCTGTATCTGCAG