seq1 = pF1KE1734.tfa, 723 bp
seq2 = pF1KE1734/gi568815588f_104155162.tfa (gi568815588f:104155162_104367402), 212241 bp

>pF1KE1734 723
>gi568815588f:104155162_104367402 (Chr10)

1-34  (99768-99801)   100% ->
35-143  (100002-100110)   100% ->
144-366  (104415-104637)   100% ->
367-465  (107818-107916)   98% ->
466-572  (110923-111029)   100% ->
573-723  (112091-112241)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGGGGAGTCAGCCAGGAGCTTGGGGAAGG         GAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  99768 ATGTCCGGGGAGTCAGCCAGGAGCTTGGGGAAGGGTG...CAGGAAGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GCCCCCGGGGCCGGTCCCGGAGGGCTCGATCCGCATCTACAGCATGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100009 GCCCCCGGGGCCGGTCCCGGAGGGCTCGATCCGCATCTACAGCATGAGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCTGCCCGTTTGCTGAGAGGACGCGTCTAGTCCTGAAGGCCAAGGGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100059 TCTGCCCGTTTGCTGAGAGGACGCGTCTAGTCCTGAAGGCCAAGGGAATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AG         GCATGAAGTCATCAATATCAACCTGAAAAATAAGCCTGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100109 AGGTG...CAGGCATGAAGTCATCAATATCAACCTGAAAAATAAGCCTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTGGTTCTTTAAGAAAAATCCCTTTGGTCTGGTGCCAGTTCTGGAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104454 GTGGTTCTTTAAGAAAAATCCCTTTGGTCTGGTGCCAGTTCTGGAAAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTCAGGGTCAGCTGATCTACGAGTCTGCCATCACCTGTGAGTACCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104504 GTCAGGGTCAGCTGATCTACGAGTCTGCCATCACCTGTGAGTACCTGGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAGCATACCCAGGGAAGAAGCTGTTGCCGGATGACCCCTATGAGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104554 GAAGCATACCCAGGGAAGAAGCTGTTGCCGGATGACCCCTATGAGAAAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTGCCAGAAGATGATCTTAGAGTTGTTTTCTAAG         GTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 104604 TTGCCAGAAGATGATCTTAGAGTTGTTTTCTAAGGTT...TAGGTGCCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCTTGGTAGGAAGCTTTATTAGAAGCCAAAATAAAGAAGACTATGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 107825 CCTTGGTAGGAAGCTTTATTAGAAGCCAAAATAAAGAAGACTATGCTGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTAAAAGAAGAATTTCGTAAAGAATTTACCAAGCTAGAGGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 107875 CTAAAAGAAGAATTTCGTAAAGAATTTACCAAGCTAGAGGAGGTA...CA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    466  GTTCTGACTAATAAGAAGACGACCTTCTTTGGTGGCAATTCTATCTCTA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110922 GGTTCTGACTAATAAGAAGACGACCTTCTTTGGTGGCAATTCTATCTCTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGATTGATTACCTCATCTGGCCCTGGTTTGAACGGCTGGAAGCAATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110972 TGATTGATTACCTCATCTGGCCCTGGTTTGAACGGCTGGAAGCAATGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTAAATGA         GTGTGTAGACCACACTCCAAAACTGAAACTGTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 111022 TTAAATGAGTA...CAGGTGTGTAGACCACACTCCAAAACTGAAACTGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GATGGCAGCCATGAAGGAAGATCCCACAGTCTCAGCCCTGCTTACTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112124 GATGGCAGCCATGAAGGAAGATCCCACAGTCTCAGCCCTGCTTACTAGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGAAAGACTGGCAAGGTTTCCTAGAGCTCTACTTACAGAACAGCCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112174 AGAAAGACTGGCAAGGTTTCCTAGAGCTCTACTTACAGAACAGCCCTGAG

    750     .    :    .
    706 GCCTGTGACTATGGGCTC
        ||||||||||||||||||
 112224 GCCTGTGACTATGGGCTC