seq1 = pF1KE1725.tfa, 705 bp
seq2 = pF1KE1725/gi568815579f_49375690.tfa (gi568815579f:49375690_49580596), 204907 bp

>pF1KE1725 705
>gi568815579f:49375690_49580596 (Chr19)

1-33  (98951-98983)   96% ->
34-144  (100002-100112)   100% ->
145-198  (100456-100509)   100% ->
199-342  (100734-100877)   100% ->
343-481  (103220-103358)   100% ->
482-660  (104609-104787)   100% ->
661-705  (104863-104907)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAGTGCTGGCGCCAGCCTGGAGCCCAACG         ACCTATCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||| >>>...>>>||||||||
  98951 ATGACAGTGCTGGCGCCAGCCTGGAGCCCAACAGTG...CAGACCTATCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCTCCTGCTGCTGCTGCTGAGCTCGGGACTCAGTGGGACCCAGGACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100010 CCTCCTGCTGCTGCTGCTGAGCTCGGGACTCAGTGGGACCCAGGACTGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCTTCCAACACAGCCCCATCTCCTCCGACTTCGCTGTCAAAATCCGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100060 CCTTCCAACACAGCCCCATCTCCTCCGACTTCGCTGTCAAAATCCGTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTG         TCTGACTACCTGCTTCAAGATTACCCAGTCACCGTGGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100110 CTGGTG...CAGTCTGACTACCTGCTTCAAGATTACCCAGTCACCGTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTCCAACCTGCAGGAC         GAGGAGCTCTGCGGGGGCCTCTGGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100494 CTCCAACCTGCAGGACGTA...TAGGAGGAGCTCTGCGGGGGCCTCTGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GGCTGGTCCTGGCACAGCGCTGGATGGAGCGGCTCAAGACTGTCGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100759 GGCTGGTCCTGGCACAGCGCTGGATGGAGCGGCTCAAGACTGTCGCTGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TCCAAGATGCAAGGCTTGCTGGAGCGCGTGAACACGGAGATACACTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100809 TCCAAGATGCAAGGCTTGCTGGAGCGCGTGAACACGGAGATACACTTTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CACCAAATGTGCCTTTCAG         CCCCCCCCCAGCTGTCTTCGCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100859 CACCAAATGTGCCTTTCAGGTC...CAGCCCCCCCCCAGCTGTCTTCGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TCGTCCAGACCAACATCTCCCGCCTCCTGCAGGAGACCTCCGAGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103242 TCGTCCAGACCAACATCTCCCGCCTCCTGCAGGAGACCTCCGAGCAGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTGGCGCTGAAGCCCTGGATCACTCGCCAGAACTTCTCCCGGTGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103292 GTGGCGCTGAAGCCCTGGATCACTCGCCAGAACTTCTCCCGGTGCCTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCTGCAGTGTCAGCCCG         ACTCCTCAACCCTGCCACCCCCAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103342 GCTGCAGTGTCAGCCCGGTA...CAGACTCCTCAACCCTGCCACCCCCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GGAGTCCCCGGCCCCTGGAGGCCACAGCCCCGACAGCCCCGCAGCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104633 GGAGTCCCCGGCCCCTGGAGGCCACAGCCCCGACAGCCCCGCAGCCCCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTGCTCCTCCTACTGCTGCTGCCCGTGGGCCTCCTGCTGCTGGCCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104683 CTGCTCCTCCTACTGCTGCTGCCCGTGGGCCTCCTGCTGCTGGCCGCTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTGGTGCCTGCACTGGCAGAGGACGCGGCGGAGGACACCCCGCCCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104733 CTGGTGCCTGCACTGGCAGAGGACGCGGCGGAGGACACCCCGCCCTGGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGCAG         GTGCCCCCCGTCCCCAGTCCCCAGGACCTGCTGCTT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104783 AGCAGGTG...CAGGTGCCCCCCGTCCCCAGTCCCCAGGACCTGCTGCTT

    750     .
    697 GTGGAGCAC
        |||||||||
 104899 GTGGAGCAC