seq1 = pF1KE1721.tfa, 630 bp
seq2 = pF1KE1721/gi568815586f_121922092.tfa (gi568815586f:121922092_122159160), 237069 bp

>pF1KE1721 630
>gi568815586f:121922092_122159160 (Chr12)

1-92  (100001-100092)   100% ->
93-174  (108609-108690)   100% ->
175-271  (113240-113336)   100% ->
272-439  (121795-121962)   100% ->
440-561  (132714-132835)   100% ->
562-630  (137001-137069)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGGCAGGTCGGTTCGAGCCGAGACGAGGAGCCGGGCCAAAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGGCAGGTCGGTTCGAGCCGAGACGAGGAGCCGGGCCAAAGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATCAAGAGGGTCATGGCGGCGATCGAGAAAGTGCGCAAATG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100051 TATCAAGAGGGTCATGGCGGCGATCGAGAAAGTGCGCAAATGGTA...CA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     93  GGAGAAGAAATGGGTGACCGTTGGTGACACATCCCTACGAATCTACAAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108608 GGGAGAAGAAATGGGTGACCGTTGGTGACACATCCCTACGAATCTACAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGGGTCCCTGTGACGGAGCCCAAGGTTGATGAC         AAAAACAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 108658 TGGGTCCCTGTGACGGAGCCCAAGGTTGATGACGTG...CAGAAAAACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAATAAGAAAAAAGGCAAGGACGAGAAGTGTGGCTCAGAGGTGACCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113248 GAATAAGAAAAAAGGCAAGGACGAGAAGTGTGGCTCAGAGGTGACCACTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CGGAGAACAGTTCCTCCCCAGGGATGATGGACATGCATG         AC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 113298 CGGAGAACAGTTCCTCCCCAGGGATGATGGACATGCATGGTG...CAGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GATAACAGCAACCAGAGCTCCATCGCAGATGCCTCCCCCATCAAACAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121797 GATAACAGCAACCAGAGCTCCATCGCAGATGCCTCCCCCATCAAACAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAACAGCAGCAACTCCAGCCCCGCTCCAGAGCCCAACTCGGCTGTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121847 GAACAGCAGCAACTCCAGCCCCGCTCCAGAGCCCAACTCGGCTGTGCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCGACGGCACCGAGGCCAAGGTGGATGAGGCCCAGGCTGATGGGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121897 GCGACGGCACCGAGGCCAAGGTGGATGAGGCCCAGGCTGATGGGAAGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CACCCAGGAGCTGAAG         ATGCTTCTGATGAGCAGAATTCACA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 121947 CACCCAGGAGCTGAAGGTA...CAGATGCTTCTGATGAGCAGAATTCACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GTCCTCGATGGAACATTCGATGAACAGCTCAGAGAAAGTAGATCGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132739 GTCCTCGATGGAACATTCGATGAACAGCTCAGAGAAAGTAGATCGGCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CGTCTGGAGACTCGGGTCTGGCCGCAGAGACGTCTGCAATCTCTCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 132789 CGTCTGGAGACTCGGGTCTGGCCGCAGAGACGTCTGCAATCTCTCAGGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    562       GATCTGGAAGGAGTGCCACCCTCTAAAAAGATGAAACTGGAGGC
        ...>>>||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132839 ...AAGGATTTGGAAGGAGTGCCACCCTCTAAAAAGATGAAACTGGAGGC

    650     .    :    .    :    .
    606 CTCTCAACAAAACTCCGAAGAGATG
        |||||||||||||||||||||||||
 137045 CTCTCAACAAAACTCCGAAGAGATG