seq1 = pF1KE1719.tfa, 675 bp
seq2 = pF1KE1719/gi568815581f_7339621.tfa (gi568815581f:7339621_7543143), 203523 bp

>pF1KE1719 675
>gi568815581f:7339621_7543143 (Chr17)

1-193  (100001-100193)   100% ->
194-304  (101851-101961)   100% ->
305-408  (102156-102259)   100% ->
409-607  (102974-103172)   100% ->
608-675  (103456-103523)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGCTGGCCAGTAGCCTGATCCGGCAGAAGCGGGAGGTCCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGCTGGCCAGTAGCCTGATCCGGCAGAAGCGGGAGGTCCGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCGGGGGCAGCCGGCCGGTGTCGGCGCAGCGGCGCGTGTGTCCCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCCGGGGGCAGCCGGCCGGTGTCGGCGCAGCGGCGCGTGTGTCCCCGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCACCAAGTCCCTTTGCCAGAAGCAGCTCCTCATCCTGCTGTCCAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCACCAAGTCCCTTTGCCAGAAGCAGCTCCTCATCCTGCTGTCCAAGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGACTGTGCGGGGGGCGGCCCGCGCGGCCGGACCGCGGCCCGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100151 CGACTGTGCGGGGGGCGGCCCGCGCGGCCGGACCGCGGCCCGGGTG...C

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    194   AGCCTCAGCTCAAAGGCATCGTCACCAAACTGTTCTGCCGCCAGGGTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101849 AGAGCCTCAGCTCAAAGGCATCGTCACCAAACTGTTCTGCCGCCAGGGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTACCTCCAGGCGAATCCCGACGGAAGCATCCAGGGCACCCCAGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101899 TCTACCTCCAGGCGAATCCCGACGGAAGCATCCAGGGCACCCCAGAGGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACCAGCTCCTTCA         CCCACTTCAACCTGATCCCTGTGGGCCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 101949 ACCAGCTCCTTCAGTG...CAGCCCACTTCAACCTGATCCCTGTGGGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCGTGTGGTCACCATCCAGAGCGCCAAGCTGGGTCACTACATGGCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102184 CCGTGTGGTCACCATCCAGAGCGCCAAGCTGGGTCACTACATGGCCATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGCTGAGGGACTGCTCTACAGTTCG         CCGCATTTCACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102234 ATGCTGAGGGACTGCTCTACAGTTCGGTG...TAGCCGCATTTCACAGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGTGTCGCTTTAAGGAGTGTGTCTTTGAGAATTACTACGTCCTGTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102989 GAGTGTCGCTTTAAGGAGTGTGTCTTTGAGAATTACTACGTCCTGTACGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTCTGCTCTCTACCGCCAGCGTCGTTCTGGCCGGGCCTGGTACCTCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103039 CTCTGCTCTCTACCGCCAGCGTCGTTCTGGCCGGGCCTGGTACCTCGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGACAAGGAGGGCCAGGTCATGAAGGGAAACCGAGTTAAGAAGACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103089 TGGACAAGGAGGGCCAGGTCATGAAGGGAAACCGAGTTAAGAAGACCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCAGCTGCCCACTTTCTGCCCAAGCTCCTGGAGG         TGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 103139 GCAGCTGCCCACTTTCTGCCCAAGCTCCTGGAGGGTG...CAGTGGCCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GTACCAGGAGCCTTCTCTCCACAGTGTCCCCGAGGCCTCCCCTTCCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103463 GTACCAGGAGCCTTCTCTCCACAGTGTCCCCGAGGCCTCCCCTTCCAGTC

    700     .    :
    665 CCCCTGCCCCC
        |||||||||||
 103513 CCCCTGCCCCC