seq1 = pF1KE1718.tfa, 672 bp
seq2 = pF1KE1718/gi568815597r_159613528.tfa (gi568815597r:159613528_159814485), 200958 bp

>pF1KE1718 672
>gi568815597r:159613528_159814485 (Chr1)

(complement)

1-61  (100001-100061)   100% ->
62-672  (100348-100958)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAAGCTGTTGTGTTTCTTGGTCTTGACCAGCCTCTCTCATGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAAGCTGTTGTGTTTCTTGGTCTTGACCAGCCTCTCTCATGCTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGCCAGACAG         ACATGTCGAGGAAGGCTTTTGTGTTTCCCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGCCAGACAGGTA...CAGACATGTCGAGGAAGGCTTTTGTGTTTCCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGAGTCGGATACTTCCTATGTATCCCTCAAAGCACCGTTAACGAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100378 AAGAGTCGGATACTTCCTATGTATCCCTCAAAGCACCGTTAACGAAGCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCAAAGCCTTCACTGTGTGCCTCCACTTCTACACGGAACTGTCCTCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100428 CTCAAAGCCTTCACTGTGTGCCTCCACTTCTACACGGAACTGTCCTCGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCGTGGGTACAGTATTTTCTCGTATGCCACCAAGAGACAAGACAATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100478 CCGTGGGTACAGTATTTTCTCGTATGCCACCAAGAGACAAGACAATGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTCTCATATTTTGGTCTAAGGATATAGGATACAGTTTTACAGTGGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100528 TTCTCATATTTTGGTCTAAGGATATAGGATACAGTTTTACAGTGGGTGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCTGAAATATTATTCGAGGTTCCTGAAGTCACAGTAGCTCCAGTACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100578 TCTGAAATATTATTCGAGGTTCCTGAAGTCACAGTAGCTCCAGTACACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TTGTACAAGCTGGGAGTCCGCCTCAGGGATCGTGGAGTTCTGGGTAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100628 TTGTACAAGCTGGGAGTCCGCCTCAGGGATCGTGGAGTTCTGGGTAGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGAAGCCCAGGGTGAGGAAGAGTCTGAAGAAGGGATACACTGTGGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100678 GGAAGCCCAGGGTGAGGAAGAGTCTGAAGAAGGGATACACTGTGGGGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAAGCAAGCATCATCTTGGGGCAGGAGCAGGATTCCTTCGGTGGGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100728 GAAGCAAGCATCATCTTGGGGCAGGAGCAGGATTCCTTCGGTGGGAACTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGAAGGAAGCCAGTCCCTGGTGGGAGACATTGGAAATGTGAACATGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100778 TGAAGGAAGCCAGTCCCTGGTGGGAGACATTGGAAATGTGAACATGTGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACTTTGTGCTGTCACCAGATGAGATTAACACCATCTATCTTGGCGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100828 ACTTTGTGCTGTCACCAGATGAGATTAACACCATCTATCTTGGCGGGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TTCAGTCCTAATGTCCTGAACTGGCGGGCACTGAAGTATGAAGTGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100878 TTCAGTCCTAATGTCCTGAACTGGCGGGCACTGAAGTATGAAGTGCAAGG

    650     .    :    .    :    .    :
    642 CGAAGTGTTCACCAAACCCCAGCTGTGGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 100928 CGAAGTGTTCACCAAACCCCAGCTGTGGCCC