seq1 = pF1KE1711.tfa, 648 bp
seq2 = pF1KE1711/gi568815590f_21943145.tfa (gi568815590f:21943145_22148246), 205102 bp

>pF1KE1711 648
>gi568815590f:21943145_22148246 (Chr8)

1-35  (99785-99819)   100% ->
36-72  (100001-100037)   100% ->
73-250  (102970-103147)   100% ->
251-357  (103383-103489)   100% ->
358-648  (104812-105102)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAGCCGCCCGCCTGCTGCCCAACCTCACTCT         GTGCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
  99785 ATGGGAGCCGCCCGCCTGCTGCCCAACCTCACTCTGTA...CAGGTGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ACAGCTGCTGATTCTCTGCTGTCAAACTCAG         GGGGAGAATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100007 ACAGCTGCTGATTCTCTGCTGTCAAACTCAGGTA...AAGGGGGAGAATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 ACCCGTCTCCTAATTTTAACCAGTACGTGAGGGACCAGGGCGCCATGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102980 ACCCGTCTCCTAATTTTAACCAGTACGTGAGGGACCAGGGCGCCATGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GACCAGCTGAGCAGGCGGCAGATCCGCGAGTACCAACTCTACAGCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103030 GACCAGCTGAGCAGGCGGCAGATCCGCGAGTACCAACTCTACAGCAGGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAGTGGCAAGCACGTGCAGGTCACCGGGCGTCGCATCTCCGCCACCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103080 CAGTGGCAAGCACGTGCAGGTCACCGGGCGTCGCATCTCCGCCACCGCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGACGGCAACAAGTTTG         CCAAGCTCATAGTGGAGACGGAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103130 AGGACGGCAACAAGTTTGGTG...CAGCCAAGCTCATAGTGGAGACGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACGTTTGGCAGCCGGGTTCGCATCAAAGGGGCTGAGAGTGAGAAGTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103406 ACGTTTGGCAGCCGGGTTCGCATCAAAGGGGCTGAGAGTGAGAAGTACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTGTATGAACAAGAGGGGCAAGCTCATCGGGAAG         CCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 103456 CTGTATGAACAAGAGGGGCAAGCTCATCGGGAAGGTG...CAGCCCAGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GGAAGAGCAAAGACTGCGTGTTCACGGAGATCGTGCTGGAGAACAACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104819 GGAAGAGCAAAGACTGCGTGTTCACGGAGATCGTGCTGGAGAACAACTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ACGGCCTTCCAGAACGCCCGGCACGAGGGCTGGTTCATGGCCTTCACGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104869 ACGGCCTTCCAGAACGCCCGGCACGAGGGCTGGTTCATGGCCTTCACGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCAGGGGCGGCCCCGCCAGGCTTCCCGCAGCCGCCAGAACCAGCGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104919 GCAGGGGCGGCCCCGCCAGGCTTCCCGCAGCCGCCAGAACCAGCGCGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCCACTTCATCAAGCGCCTCTACCAAGGCCAGCTGCCCTTCCCCAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104969 CCCACTTCATCAAGCGCCTCTACCAAGGCCAGCTGCCCTTCCCCAACCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCCGAGAAGCAGAAGCAGTTCGAGTTTGTGGGCTCCGCCCCCACCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105019 GCCGAGAAGCAGAAGCAGTTCGAGTTTGTGGGCTCCGCCCCCACCCGCCG

    650     .    :    .    :    .    :
    615 GACCAAGCGCACACGGCGGCCCCAGCCCCTCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105069 GACCAAGCGCACACGGCGGCCCCAGCCCCTCACG