seq1 = pF1KE1710.tfa, 645 bp
seq2 = pF1KE1710/gi568815592r_25917088.tfa (gi568815592r:25917088_26117732), 200645 bp

>pF1KE1710 645
>gi568815592r:25917088_26117732 (Chr6)

(complement)

1-645  (100001-100645)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGAAACAGTGCCTCCCGCCCCCGCCGCTTCTGCTGCTCCTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGAAACAGTGCCTCCCGCCCCCGCCGCTTCTGCTGCTCCTGAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCTTTAGCTGGCAAGAAGGCAAAGAAACCTGCTAAGGCTGCAGCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCTTTAGCTGGCAAGAAGGCAAAGAAACCTGCTAAGGCTGCAGCAGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAAGAAAAAACCCGCTGGCCCTTCCGTGTCAGAGCTGATCGTGCAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAAGAAAAAACCCGCTGGCCCTTCCGTGTCAGAGCTGATCGTGCAGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTTCCTCCTCTAAGGAGCGTGGTGGTGTGTCGTTGGCAGCTCTTAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTTCCTCCTCTAAGGAGCGTGGTGGTGTGTCGTTGGCAGCTCTTAAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCGCTGGCGGCCGCAGGCTACGACGTGGAGAAGAACAACAGCCGCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCGCTGGCGGCCGCAGGCTACGACGTGGAGAAGAACAACAGCCGCATTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCTGGGCATTAAGAGCCTGGTAAGCAAGGGAACGTTGGTGCAGACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCTGGGCATTAAGAGCCTGGTAAGCAAGGGAACGTTGGTGCAGACAAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGTACCGGAGCCTCGGGTTCCTTCAAGCTCAACAAGAAGGCGTCCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGTACCGGAGCCTCGGGTTCCTTCAAGCTCAACAAGAAGGCGTCCTCCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAAACCAAGCCCGGCGCCTCAAAGGTGGCTACAAAAACTAAGGCAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGAAACCAAGCCCGGCGCCTCAAAGGTGGCTACAAAAACTAAGGCAACGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGCATCTAAAAAGCTCAAAAAGGCCACGGGGGCTAGCAAAAAGAGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGCATCTAAAAAGCTCAAAAAGGCCACGGGGGCTAGCAAAAAGAGCGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGACTCCGAAAAAGGCTAAAAAGCCTGCGGCAACAAGGAAATCCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGACTCCGAAAAAGGCTAAAAAGCCTGCGGCAACAAGGAAATCCTCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAATCCAAAAAAACCCAAAACTGTAAAGCCCAAGAAAGTAGCTAAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAATCCAAAAAAACCCAAAACTGTAAAGCCCAAGAAAGTAGCTAAAAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGCTAAAGCTAAGGCTGTAAAACCCAAGGCGGCCAAGGCTAGGGTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGCTAAAGCTAAGGCTGTAAAACCCAAGGCGGCCAAGGCTAGGGTGACG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    601 AAGCCAAAGACTGCCAAACCCAAGAAAGCGGCACCCAAGAAAAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAGCCAAAGACTGCCAAACCCAAGAAAGCGGCACCCAAGAAAAAG