seq1 = pF1KE1707.tfa, 621 bp
seq2 = pF1KE1707/gi568815597r_114674274.tfa (gi568815597r:114674274_114880607), 206334 bp

>pF1KE1707 621
>gi568815597r:114674274_114880607 (Chr1)

(complement)

1-159  (100001-100159)   100% ->
160-265  (100393-100498)   100% ->
266-408  (101324-101466)   100% ->
409-522  (104149-104262)   100% ->
523-621  (106236-106334)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCTGCACCATCGAGAAGATCCTGACAGACGCCAAGACGCTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCTGCACCATCGAGAAGATCCTGACAGACGCCAAGACGCTGCTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGGCTACGGGAGCACGATGCGGCCGCCGAGTCGCTGGTGGATCAGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGGCTACGGGAGCACGATGCGGCCGCCGAGTCGCTGGTGGATCAGTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGCGCTGCACCGGCGGGTAGCAGCTATGCGGGAGGCGGGGACAGCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGCGCTGCACCGGCGGGTAGCAGCTATGCGGGAGGCGGGGACAGCGCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGGACCAG         TATCAAGAGGATGCATCCGATATGAAGGACAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCGGACCAGGTC...CAGTATCAAGAGGATGCATCCGATATGAAGGACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTCCAAATACAAACCTCACATTCTGCTGTCCCAAGAGAACACACAGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100425 GTCCAAATACAAACCTCACATTCTGCTGTCCCAAGAGAACACACAGATTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GAGACTTGCAACAGGAAAACAGAG         AGCTATGGATTTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100475 GAGACTTGCAACAGGAAAACAGAGGTT...CAGAGCTATGGATTTCCTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGAACACCAGGATGCTTTGGAACTTATCATGAGCAAATATCGGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101341 GAGGAACACCAGGATGCTTTGGAACTTATCATGAGCAAATATCGGAAACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GATGTTACAGTTAATGGTTGCTAAAAAAGCGGTGGATGCTGAACCAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101391 GATGTTACAGTTAATGGTTGCTAAAAAAGCGGTGGATGCTGAACCAGTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGAAAGCTCACCAGTCTCACTCTGCA         GAAATTGAGAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101441 TGAAAGCTCACCAGTCTCACTCTGCAGTA...CAGGAAATTGAGAGTCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATTGACAGAATCTGTGAAATGGGAGAAGTGATGAGGAAAGCAGTTCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104164 ATTGACAGAATCTGTGAAATGGGAGAAGTGATGAGGAAAGCAGTTCAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGATGATGACCAGTTTTGTAAGATTCAGGAAAAATTAGCCCAATTAGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 104214 GGATGATGACCAGTTTTGTAAGATTCAGGAAAAATTAGCCCAATTAGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    523         CTTGAAAATAAGGAACTTCGAGAATTATTGTCCATCAGCAGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104264 TA...CAGCTTGAAAATAAGGAACTTCGAGAATTATTGTCCATCAGCAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAGTCTCTTCAAGCCAGAAAGGAAAACTCAATGGACACTGCTTCCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106278 GAGTCTCTTCAAGCCAGAAAGGAAAACTCAATGGACACTGCTTCCCAAGC

    650     .
    615 CATCAAA
        |||||||
 106328 CATCAAA