seq1 = pF1KE1706.tfa, 633 bp
seq2 = pF1KE1706/gi568815590r_16893075.tfa (gi568815590r:16893075_17102032), 208958 bp

>pF1KE1706 633
>gi568815590r:16893075_17102032 (Chr8)

(complement)

1-286  (100001-100286)   99% ->
287-390  (106275-106378)   100% ->
391-633  (108716-108958)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCCCTTAGCCGAAGTCGGGGGCTTTCTGGGCGGCCTGGAGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCCCTTAGCCGAAGTCGGGGGCTTTCTGGGCGGCCTGGAGGGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCCAGCAGGTGGGTTCGCATTTCCTGTTGCCTCCTGCCGGGGAGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCCAGCAGGTGGGTTCGCATTTCCTGTTGCCTCCTGCCGGGGAGCGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCGCTGCTGGGCGAGCGCAGGAGCGCGGCGGAGCGGAGCGCCCGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100101 CGCCGCTGCTGGGCGAGCGCAGGAGCGCGGCGGAGCGGAGCGCGCGCGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGCCGGGGGCTGCGCAGCTGGCGCACCTGCACGGCATCCTGCGCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGCCGGGGGCTGCGCAGCTGGCGCACCTGCACGGCATCCTGCGCCGCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCAGCTCTATTGCCGCACCGGCTTCCACCTGCAGATCCTGCCCGACGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCAGCTCTATTGCCGCACCGGCTTCCACCTGCAGATCCTGCCCGACGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGTGCAGGGCACCCGGCAGGACCACAGCCTCTTCG         GTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100251 GCGTGCAGGGCACCCGGCAGGACCACAGCCTCTTCGGTA...CAGGTATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTGGAATTCATCAGTGTGGCAGTGGGACTGGTCAGTATTAGAGGTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106280 TTGGAATTCATCAGTGTGGCAGTGGGACTGGTCAGTATTAGAGGTGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGTGGTCTCTATCTTGGAATGAATGACAAAGGAGAACTCTATGGATCA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 106330 CAGTGGTCTCTATCTTGGAATGAATGACAAAGGAGAACTCTATGGATCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    391         GAGAAACTTACTTCCGAATGCATCTTTAGGGAGCAGTTTGAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106380 TA...CAGGAGAAACTTACTTCCGAATGCATCTTTAGGGAGCAGTTTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGAACTGGTATAACACCTATTCATCTAACATATATAAACATGGAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108758 GAGAACTGGTATAACACCTATTCATCTAACATATATAAACATGGAGACAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGGCCGCAGGTATTTTGTGGCACTTAACAAAGACGGAACTCCAAGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108808 TGGCCGCAGGTATTTTGTGGCACTTAACAAAGACGGAACTCCAAGAGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCGCCAGGTCCAAGAGGCATCAGAAATTTACACATTTCTTACCTAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108858 GCGCCAGGTCCAAGAGGCATCAGAAATTTACACATTTCTTACCTAGACCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTGGATCCAGAAAGAGTTCCAGAATTGTACAAGGACCTACTGATGTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108908 GTGGATCCAGAAAGAGTTCCAGAATTGTACAAGGACCTACTGATGTACAC

    650 
    633 T
        |
 108958 T