seq1 = pF1KE1703.tfa, 624 bp
seq2 = pF1KE1703/gi568815585f_21571913.tfa (gi568815585f:21571913_21801432), 229520 bp

>pF1KE1703 624
>gi568815585f:21571913_21801432 (Chr13)

1-277  (100001-100277)   100% ->
278-381  (109130-109233)   100% ->
382-624  (129278-129520)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCCCTTAGGTGAAGTTGGGAACTATTTCGGTGTGCAGGATGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCCCTTAGGTGAAGTTGGGAACTATTTCGGTGTGCAGGATGCGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCGTTTGGGAATGTGCCCGTGTTGCCGGTGGACAGCCCGGTTTTGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCGTTTGGGAATGTGCCCGTGTTGCCGGTGGACAGCCCGGTTTTGTTAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGACCACCTGGGTCAGTCCGAAGCAGGGGGGCTCCCCAGGGGACCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGACCACCTGGGTCAGTCCGAAGCAGGGGGGCTCCCCAGGGGACCCGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCACGGACTTGGATCATTTAAAGGGGATTCTCAGGCGGAGGCAGCTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCACGGACTTGGATCATTTAAAGGGGATTCTCAGGCGGAGGCAGCTATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGCAGGACTGGATTTCACTTAGAAATCTTCCCCAATGGTACTATCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTGCAGGACTGGATTTCACTTAGAAATCTTCCCCAATGGTACTATCCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAACCAGGAAAGACCACAGCCGATTTG         GCATTCTGGAATTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100251 GAACCAGGAAAGACCACAGCCGATTTGGTA...CAGGCATTCTGGAATTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATCAGTATAGCAGTGGGCCTGGTCAGCATTCGAGGCGTGGACAGTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109144 ATCAGTATAGCAGTGGGCCTGGTCAGCATTCGAGGCGTGGACAGTGGACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTACCTCGGGATGAATGAGAAGGGGGAGCTGTATGGATCA         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 109194 CTACCTCGGGATGAATGAGAAGGGGGAGCTGTATGGATCAGTA...CAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAAAACTAACCCAAGAGTGTGTATTCAGAGAACAGTTCGAAGAAAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129279 AAAAACTAACCCAAGAGTGTGTATTCAGAGAACAGTTCGAAGAAAACTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TATAATACGTACTCATCAAACCTATATAAGCACGTGGACACTGGAAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129329 TATAATACGTACTCATCAAACCTATATAAGCACGTGGACACTGGAAGGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ATACTATGTTGCATTAAATAAAGATGGGACCCCGAGAGAAGGGACTAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129379 ATACTATGTTGCATTAAATAAAGATGGGACCCCGAGAGAAGGGACTAGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTAAACGGCACCAGAAATTCACACATTTTTTACCTAGACCAGTGGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129429 CTAAACGGCACCAGAAATTCACACATTTTTTACCTAGACCAGTGGACCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GACAAAGTACCTGAACTGTATAAGGATATTCTAAGCCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129479 GACAAAGTACCTGAACTGTATAAGGATATTCTAAGCCAAAGT