seq1 = pF1KE1689.tfa, 597 bp
seq2 = pF1KE1689/gi568815579r_55266010.tfa (gi568815579r:55266010_55468941), 202932 bp

>pF1KE1689 597
>gi568815579r:55266010_55468941 (Chr19)

(complement)

8-180  (100001-100173)   100% ->
181-267  (100373-100459)   98% ->
268-429  (100571-100732)   100% ->
430-597  (102765-102932)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      8 GTGTTTGCCGCCTGGTCCTGGTCGTGCTGAGCCTGTGGCCAGATACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 GTGTTTGCCGCCTGGTCCTGGTCGTGCTGAGCCTGTGGCCAGATACAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     58 GTCGCCCCTGGGCCACCACCTGGCCCCCCTCGAGTTTCCCCAGACCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCGCCCCTGGGCCACCACCTGGCCCCCCTCGAGTTTCCCCAGACCCTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    108 GGCCGAGCTGGACAGCACCGTGCTCCTGACCCGCTCTCTCCTGGCGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCCGAGCTGGACAGCACCGTGCTCCTGACCCGCTCTCTCCTGGCGGACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    158 CGCGGCAGCTGGCTGCACAGCTG         AGGGACAAATTCCCAGCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100151 CGCGGCAGCTGGCTGCACAGCTGGTA...CAGAGGGACAAATTCCCAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199 GACGGGGACCACAACCTGGATTCCCTGCCCACCCTGGCCATGAGTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100391 GACGGGGACCACAACCTGGATTCCCTGCCCACCCTGGCCATGAGTGCGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    249 GGCACTGGGAGCTCTACAG         CTCCCAGGTGTGCTGACAAGGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100441 GGCACTGGGAGCTCTACAGGTA...CAGCTCCCAGGTGTGCTGACAAGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    290 TGCGAGCGGACCTACTGTCCTACCTGCGGCACGTGCAGTGGCTGCGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100593 TGCGAGCGGACCTACTGTCCTACCTGCGGCACGTGCAGTGGCTGCGCCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    340 GCAGGTGGCTCTTCCCTGAAGACCCTGGAGCCCGAGCTGGGCACCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100643 GCAGGTGGCTCTTCCCTGAAGACCCTGGAGCCCGAGCTGGGCACCCTGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    390 GGCCCGACTGGACCGGCTGCTGCGCCGGCTGCAGCTCCTG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100693 GGCCCGACTGGACCGGCTGCTGCGCCGGCTGCAGCTCCTGGTA...CAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    431 TGTCCCGCCTGGCCCTGCCCCAGCCACCCCCGGACCCGCCGGCGCCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102766 TGTCCCGCCTGGCCCTGCCCCAGCCACCCCCGGACCCGCCGGCGCCCCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    481 CTGGCGCCCCCCTCCTCAGCCTGGGGGGGCATCAGGGCCGCCCACGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102816 CTGGCGCCCCCCTCCTCAGCCTGGGGGGGCATCAGGGCCGCCCACGCCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    531 CCTGGGGGGGCTGCACCTGACACTTGACTGGGCCGTGAGGGGACTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102866 CCTGGGGGGGCTGCACCTGACACTTGACTGGGCCGTGAGGGGACTGCTGC

    600     .    :    .
    581 TGCTGAAGACTCGGCTG
        |||||||||||||||||
 102916 TGCTGAAGACTCGGCTG